RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578600.1

PTPRM-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-208ENST00000578600 LRP5O75197 1615 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRM-208ENST00000578600 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
PTPRM-208ENST00000578600 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRM-208ENST00000578600 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRM-208ENST00000578600 C9IYK1 514 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRM-208ENST00000578600 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
PTPRM-208ENST00000578600 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
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PTPRM-208ENST00000578600 C16orf86Q6ZW13 317 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRM-208ENST00000578600 CLEC10AQ8IUN9 316 aa7.49□□□□□ -1.21
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PTPRM-208ENST00000578600 ZMYM5Q9UJ78 669 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRM-208ENST00000578600 NHSL1Q5SYE7 1610 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRM-208ENST00000578600 IQCA1LA6NCM1 817 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-208ENST00000578600 DHX15O43143 795 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
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PTPRM-208ENST00000578600 BEND4Q6ZU67 534 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-208ENST00000578600 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-208ENST00000578600 CDH24Q86UP0 819 aa7.48□□□□□ -1.21
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PTPRM-208ENST00000578600 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-208ENST00000578600 KREMEN1Q96MU8 473 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-208ENST00000578600 FAM83CQ9BQN1 747 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-208ENST00000578600 EPN3Q9H201 632 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-208ENST00000578600 TMX1Q9H3N1 280 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-208ENST00000578600 STK17AQ9UEE5 414 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-208ENST00000578600 LEMD3Q9Y2U8 911 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-208ENST00000578600 PRKAB1Q9Y478 270 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-208ENST00000578600 MYOM2P54296 1465 aa7.48□□□□□ -1.21
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PTPRM-208ENST00000578600 ROCK1Q13464 1354 aa7.47□□□□□ -1.21
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PTPRM-208ENST00000578600 KLHL25Q9H0H3 589 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRM-208ENST00000578600 FAM86C1Q9NVL1 165 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRM-208ENST00000578600 SLIT2O94813 1529 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRM-208ENST00000578600 LAMC1P11047 1609 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRM-208ENST00000578600 NINLQ9Y2I6 1382 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRM-208ENST00000578600 DISP2A7MBM2 1401 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRM-208ENST00000578600 ITGB2P05107 769 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRM-208ENST00000578600 EPHX1P07099 455 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRM-208ENST00000578600 ADMP35318 185 aa7.44□□□□□ -1.22
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