RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560589.5

TLE3-222, Transcript of transducin like enhancer of split 3, human

TSL 5 BASIC

Gene TLE3, Length 3,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TLE3-222	ENST00000560589	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	12.71	□□□□□ -0.37
TLE3-222	ENST00000560589	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	12.71	□□□□□ -0.37
TLE3-222	ENST00000560589	ST3GAL1	Q11201	340 aa		12.71	□□□□□ -0.37
TLE3-222	ENST00000560589	MPP3	Q13368	585 aa		12.71	□□□□□ -0.37
TLE3-222	ENST00000560589	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		12.71	□□□□□ -0.37
TLE3-222	ENST00000560589	FAM114A2	Q9NRY5	505 aa		12.71	□□□□□ -0.37
TLE3-222	ENST00000560589	CETN3	O15182	167 aa		12.71	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	MBD4	O95243	580 aa		12.71	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	APBA3	O96018	575 aa		12.71	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		12.71	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	SMTN	P53814	917 aa		12.71	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	12.71	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	OLFML1	Q6UWY5	402 aa		12.71	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		12.71	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	SLC35F6	Q8N357	371 aa		12.71	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	TMCO5A	Q8N6Q1	288 aa		12.71	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	CNBD1	Q8NA66	436 aa		12.71	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	IFT81	Q8WYA0	676 aa		12.71	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	TRIM11	Q96F44	468 aa		12.71	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	BATF3	Q9NR55	127 aa		12.71	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	ADD2	P35612	726 aa		12.7	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	TMED1	Q13445	227 aa		12.7	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	IQCB1	Q15051	598 aa		12.7	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		12.7	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	BZW1	Q7L1Q6	419 aa	Known RBP	12.7	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	PHC3	Q8NDX5	983 aa		12.7	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		12.7	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		12.7	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	ZNF711	Q9Y462	761 aa		12.7	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	PSMC4	P43686	418 aa		12.7	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	NANOGNB	Q7Z5D8	188 aa		12.7	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	LMNTD2	Q8IXW0	634 aa		12.7	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	CCDC63	Q8NA47	563 aa		12.7	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		12.7	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	C8orf76	Q96K31	380 aa		12.7	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	12.7	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	NYX	Q9GZU5	481 aa		12.7	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		12.7	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		12.7	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	ICA1	Q05084	483 aa		12.7	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	MAP3K12	Q12852	859 aa		12.7	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	KRT32	Q14532	448 aa		12.7	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	MTF1	Q14872	753 aa		12.7	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	FAM133B	Q5BKY9	247 aa	Known RBP	12.7	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		12.7	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	ANKZF1	Q9H8Y5	726 aa		12.7	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	BLOC1S6	Q9UL45	172 aa		12.7	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	12.69	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	ZNF213	O14771	459 aa		12.69	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	12.69	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	C16orf87	Q6PH81	154 aa		12.69	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	NOD2	Q9HC29	1040 aa		12.69	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		12.69	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	SUPT3H	O75486	399 aa		12.69	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	MCM3	P25205	808 aa		12.69	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	12.69	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	TXNRD1	Q16881	649 aa		12.69	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	GALNT17	Q6IS24	598 aa		12.69	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		12.69	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		12.69	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		12.69	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		12.69	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		12.69	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	TMEM232	C9JQI7	657 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	FOXP2	O15409	715 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	RXRA	P19793	462 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	SESN3	P58005	492 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	DDR1	Q08345	913 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	NOP53	Q9NZM5	478 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	CCDC160	A6NGH7	325 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	CYP7A1	P22680	504 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	MORC4	Q8TE76	937 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	12.68	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	ALS2CR12	Q96Q35	445 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	NAPG	Q99747	312 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	COL4A1	P02462	1669 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	PROM2	Q8N271	834 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	SMIM22	K7EJ46	135 aa		12.67	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	12.67	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		12.67	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	12.67	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589		Q4G0T1	1027 aa		12.67	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	CFAP58	Q5T655	872 aa		12.67	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		12.67	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	SPATA17	Q96L03	361 aa		12.67	□□□□□ -0.38
TLE3-222	ENST00000560589	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		12.67	□□□□□ -0.38

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.8 ms