RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558936.5

RABGGTA-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTA, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-207ENST00000558936 TMEM67Q5HYA8 995 aa14.79□□□□□ -0.04
RABGGTA-207ENST00000558936 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
RABGGTA-207ENST00000558936 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
RABGGTA-207ENST00000558936 VAT1LQ9HCJ6 419 aa14.79□□□□□ -0.04
RABGGTA-207ENST00000558936 CCPG1Q9ULG6 757 aa14.79□□□□□ -0.04
RABGGTA-207ENST00000558936 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
RABGGTA-207ENST00000558936 KLRF2D3W0D1 207 aa14.78□□□□□ -0.04
RABGGTA-207ENST00000558936 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
RABGGTA-207ENST00000558936 COL6A1P12109 1028 aa14.78□□□□□ -0.04
RABGGTA-207ENST00000558936 FUT2Q10981 343 aa14.78□□□□□ -0.04
RABGGTA-207ENST00000558936 IKQ13123 557 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
RABGGTA-207ENST00000558936 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
RABGGTA-207ENST00000558936 KCTD2Q14681 263 aa14.78□□□□□ -0.04
RABGGTA-207ENST00000558936 WTAPQ15007 396 aa14.78□□□□□ -0.04
RABGGTA-207ENST00000558936 ASPRV1Q53RT3 343 aa14.78□□□□□ -0.04
RABGGTA-207ENST00000558936 CCDC178Q5BJE1 867 aa14.78□□□□□ -0.04
RABGGTA-207ENST00000558936 ZNF654Q8IZM8 581 aa14.78□□□□□ -0.04
RABGGTA-207ENST00000558936 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
RABGGTA-207ENST00000558936 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
RABGGTA-207ENST00000558936 NEK1Q96PY6 1258 aa14.78□□□□□ -0.04
RABGGTA-207ENST00000558936 ACAD9Q9H845 621 aa14.78□□□□□ -0.04
RABGGTA-207ENST00000558936 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
RABGGTA-207ENST00000558936 WDR19Q8NEZ3 1342 aa14.77□□□□□ -0.04
RABGGTA-207ENST00000558936 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 CTAGE5O15320 804 aa14.77□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 MCM5P33992 734 aa14.77□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 LIFRP42702 1097 aa14.77□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 TRDNQ13061 729 aa14.77□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 SGMS1Q86VZ5 419 aa14.77□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa14.77□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 MORC4Q8TE76 937 aa14.77□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 PIGSQ96S52 555 aa14.77□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 MYADML2A6NDP7 307 aa14.76□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 COPB2P35606 906 aa14.76□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 TKFCQ3LXA3 575 aa14.76□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 USH1GQ495M9 461 aa14.76□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 MFSD14CQ5VZR4 134 aa14.76□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 TAPT1Q6NXT6 567 aa14.76□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 ANKRD35Q8N283 1001 aa14.76□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 MTA3Q9BTC8 594 aa14.76□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 AGXT2Q9BYV1 514 aa14.76□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 PDGFCQ9NRA1 345 aa14.76□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa14.75□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 ADAMTS3O15072 1205 aa14.75□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 SEPT4O43236 478 aa14.75□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 TFRCP02786 760 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 CAPN2P17655 700 aa14.75□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 CDC27P30260 824 aa14.75□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 RPS6P62753 249 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 ARMCX2Q7L311 632 aa14.75□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 DDX11Q96FC9 970 aa14.75□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 TMEM87BQ96K49 555 aa14.75□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 ADAMTS4O75173 837 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 EDNRBP24530 442 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 GHRHRQ02643 423 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 NSMFQ6X4W1 530 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 NUP133Q8WUM0 1156 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 TAAR1Q96RJ0 339 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 MAP3K14Q99558 947 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 FBXO40Q9UH90 709 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 POTEB2H3BUK9 544 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 ZBTB5O15062 677 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 ACVR2BQ13705 512 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 C8orf34Q49A92 452 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 TYW1BQ6NUM6 668 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 APOA5Q6Q788 366 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 SLC5A4Q9NY91 659 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 DTNBO60941 627 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 DDAH1O94760 285 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 PGK1P00558 417 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 CNGA1P29973 690 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 FBXL16Q8N461 479 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 RGS22Q8NE09 1264 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 KLHDC9Q8NEP7 349 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 PIBF1Q8WXW3 757 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 IL17RAQ96F46 866 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 LAMA3Q16787 3333 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 RPS6KB1P23443 525 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 CALML3P27482 149 aa14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms