RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555616.5

ACTN1-215, Transcript of actinin alpha 1, human

TSL 3

Gene ACTN1, Length 919 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACTN1-215	ENST00000555616	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		11.23	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		11.23	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		11.23	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	ALPK3	Q96L96	1907 aa		11.23	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616		E7EWF7	191 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	ASTN1	O14525	1302 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	RARB	P10826	455 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	CNTN2	Q02246	1040 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	ANO1	Q5XXA6	986 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	ARMCX2	Q7L311	632 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	NEK1	Q96PY6	1258 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	KIF2C	Q99661	725 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	KATNBL1	Q9H079	304 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	NFIB	O00712	420 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	ST18	O60284	1047 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	LRRC41	Q15345	812 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	NCOA7	Q8NI08	942 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	PRO3102	Q9H379	93 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
ACTN1-215	ENST00000555616	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ACTN1-215	ENST00000555616	KBTBD13	C9JR72	458 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ACTN1-215	ENST00000555616	ADAMTS4	O75173	837 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ACTN1-215	ENST00000555616	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
ACTN1-215	ENST00000555616	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	11.2	□□□□□ -0.62
ACTN1-215	ENST00000555616	NEK4	P51957	841 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ACTN1-215	ENST00000555616	ANTXR2	P58335	489 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ACTN1-215	ENST00000555616	ACVR2B	Q13705	512 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ACTN1-215	ENST00000555616	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
ACTN1-215	ENST00000555616	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ACTN1-215	ENST00000555616	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
ACTN1-215	ENST00000555616	CHRDL2	Q6WN34	429 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ACTN1-215	ENST00000555616	NSMF	Q6X4W1	530 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ACTN1-215	ENST00000555616	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ACTN1-215	ENST00000555616	RUFY3	Q7L099	469 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ACTN1-215	ENST00000555616	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
ACTN1-215	ENST00000555616	MORC4	Q8TE76	937 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ACTN1-215	ENST00000555616	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ACTN1-215	ENST00000555616	CPVL	Q9H3G5	476 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ACTN1-215	ENST00000555616	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ACTN1-215	ENST00000555616	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ACTN1-215	ENST00000555616	PHF24	Q9UPV7	400 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ACTN1-215	ENST00000555616	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
ACTN1-215	ENST00000555616	LCT	P09848	1927 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ACTN1-215	ENST00000555616	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
ACTN1-215	ENST00000555616	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ACTN1-215	ENST00000555616	ASB14	A6NK59	587 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ACTN1-215	ENST00000555616	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
ACTN1-215	ENST00000555616	ADCY6	O43306	1168 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ACTN1-215	ENST00000555616	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
ACTN1-215	ENST00000555616	PGK1	P00558	417 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ACTN1-215	ENST00000555616	RPS6KB1	P23443	525 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ACTN1-215	ENST00000555616	MCM5	P33992	734 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ACTN1-215	ENST00000555616	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
ACTN1-215	ENST00000555616	SNX17	Q15036	470 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ACTN1-215	ENST00000555616	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
ACTN1-215	ENST00000555616	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
ACTN1-215	ENST00000555616	RNF180	Q86T96	592 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ACTN1-215	ENST00000555616	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ACTN1-215	ENST00000555616	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
ACTN1-215	ENST00000555616	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
ACTN1-215	ENST00000555616	MAF1	Q9H063	256 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ACTN1-215	ENST00000555616	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
ACTN1-215	ENST00000555616	ABCB11	O95342	1321 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ACTN1-215	ENST00000555616	ERICH2	A1L162	156 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ACTN1-215	ENST00000555616	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
ACTN1-215	ENST00000555616	MCM2	P49736	904 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ACTN1-215	ENST00000555616	NKX3-2	P78367	333 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ACTN1-215	ENST00000555616	FGD1	P98174	961 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ACTN1-215	ENST00000555616	TROAP	Q12815	778 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ACTN1-215	ENST00000555616	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
ACTN1-215	ENST00000555616	BECN1	Q14457	450 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ACTN1-215	ENST00000555616	GRM4	Q14833	912 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ACTN1-215	ENST00000555616	WTAP	Q15007	396 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ACTN1-215	ENST00000555616	ANKRD1	Q15327	319 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ACTN1-215	ENST00000555616	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ACTN1-215	ENST00000555616	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ACTN1-215	ENST00000555616	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ACTN1-215	ENST00000555616	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ACTN1-215	ENST00000555616	RGS22	Q8NE09	1264 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ACTN1-215	ENST00000555616	MTMR8	Q96EF0	704 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ACTN1-215	ENST00000555616	MTA3	Q9BTC8	594 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ACTN1-215	ENST00000555616	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		11.18	□□□□□ -0.62

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