RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554292.1

PCNX1-206, Transcript of pecanex 1, human

TSL 4

Gene PCNX1, Length 402 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCNX1-206	ENST00000554292	NSMF	Q6X4W1	530 aa		33.02	■■■□□ 2.88
PCNX1-206	ENST00000554292	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	33.02	■■■□□ 2.88
PCNX1-206	ENST00000554292	FBXO11	Q86XK2	927 aa		33.02	■■■□□ 2.88
PCNX1-206	ENST00000554292	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	33.02	■■■□□ 2.88
PCNX1-206	ENST00000554292	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		33.02	■■■□□ 2.88
PCNX1-206	ENST00000554292	CYP2C19	P33261	490 aa		33.01	■■■□□ 2.87
PCNX1-206	ENST00000554292	USH1G	Q495M9	461 aa		33.01	■■■□□ 2.87
PCNX1-206	ENST00000554292	APOA5	Q6Q788	366 aa		33.01	■■■□□ 2.87
PCNX1-206	ENST00000554292	MTMR8	Q96EF0	704 aa		33.01	■■■□□ 2.87
PCNX1-206	ENST00000554292	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		33.01	■■■□□ 2.87
PCNX1-206	ENST00000554292	ZBTB5	O15062	677 aa		33	■■■□□ 2.87
PCNX1-206	ENST00000554292	IGHA2	P01877	340 aa		33	■■■□□ 2.87
PCNX1-206	ENST00000554292	SMARCA1	P28370	1054 aa		33	■■■□□ 2.87
PCNX1-206	ENST00000554292	MICU3	Q86XE3	530 aa		33	■■■□□ 2.87
PCNX1-206	ENST00000554292	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		33	■■■□□ 2.87
PCNX1-206	ENST00000554292	AMN	Q9BXJ7	453 aa		33	■■■□□ 2.87
PCNX1-206	ENST00000554292	MAF1	Q9H063	256 aa		33	■■■□□ 2.87
PCNX1-206	ENST00000554292	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		33	■■■□□ 2.87
PCNX1-206	ENST00000554292	CPA1	P15085	419 aa		32.99	■■■□□ 2.87
PCNX1-206	ENST00000554292	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	32.99	■■■□□ 2.87
PCNX1-206	ENST00000554292	GJA8	P48165	433 aa		32.99	■■■□□ 2.87
PCNX1-206	ENST00000554292	RGS19	P49795	217 aa		32.99	■■■□□ 2.87
PCNX1-206	ENST00000554292	RCAN1	P53805	252 aa		32.99	■■■□□ 2.87
PCNX1-206	ENST00000554292	FBXL16	Q8N461	479 aa		32.99	■■■□□ 2.87
PCNX1-206	ENST00000554292	TINF2	Q9BSI4	451 aa		32.99	■■■□□ 2.87
PCNX1-206	ENST00000554292	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		32.99	■■■□□ 2.87
PCNX1-206	ENST00000554292	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		32.99	■■■□□ 2.87
PCNX1-206	ENST00000554292	MCM3AP	O60318	1980 aa		32.99	■■■□□ 2.87
PCNX1-206	ENST00000554292	NFIB	O00712	420 aa		32.98	■■■□□ 2.87
PCNX1-206	ENST00000554292	ZBTB43	O43298	467 aa		32.98	■■■□□ 2.87
PCNX1-206	ENST00000554292	ANAPC15	P60006	121 aa		32.98	■■■□□ 2.87
PCNX1-206	ENST00000554292		Q6ZUG5	572 aa		32.98	■■■□□ 2.87
PCNX1-206	ENST00000554292	RUFY3	Q7L099	469 aa		32.98	■■■□□ 2.87
PCNX1-206	ENST00000554292	HOMER1	Q86YM7	354 aa		32.98	■■■□□ 2.87
PCNX1-206	ENST00000554292	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		32.98	■■■□□ 2.87
PCNX1-206	ENST00000554292	FANCB	Q8NB91	859 aa		32.98	■■■□□ 2.87
PCNX1-206	ENST00000554292	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	32.98	■■■□□ 2.87
PCNX1-206	ENST00000554292	DEFB118	Q96PH6	123 aa		32.98	■■■□□ 2.87
PCNX1-206	ENST00000554292	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		32.98	■■■□□ 2.87
PCNX1-206	ENST00000554292	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	32.98	■■■□□ 2.87
PCNX1-206	ENST00000554292	MRPL11	Q9Y3B7	192 aa	Known RBP	32.98	■■■□□ 2.87
PCNX1-206	ENST00000554292	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		32.97	■■■□□ 2.87
PCNX1-206	ENST00000554292	RXRA	P19793	462 aa		32.97	■■■□□ 2.87
PCNX1-206	ENST00000554292	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		32.97	■■■□□ 2.87
PCNX1-206	ENST00000554292	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		32.97	■■■□□ 2.87
PCNX1-206	ENST00000554292	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		32.96	■■■□□ 2.87
PCNX1-206	ENST00000554292	SGPL1	O95470	568 aa		32.96	■■■□□ 2.87
PCNX1-206	ENST00000554292	CYBA	P13498	195 aa		32.96	■■■□□ 2.87
PCNX1-206	ENST00000554292	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		32.96	■■■□□ 2.87
PCNX1-206	ENST00000554292	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		32.96	■■■□□ 2.87
PCNX1-206	ENST00000554292	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		32.96	■■■□□ 2.87
PCNX1-206	ENST00000554292	BRF1	Q92994	677 aa		32.96	■■■□□ 2.87
PCNX1-206	ENST00000554292	PIGS	Q96S52	555 aa		32.96	■■■□□ 2.87
PCNX1-206	ENST00000554292	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		32.96	■■■□□ 2.87
PCNX1-206	ENST00000554292	LCT	P09848	1927 aa		32.96	■■■□□ 2.87
PCNX1-206	ENST00000554292	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		32.95	■■■□□ 2.87
PCNX1-206	ENST00000554292	CYTH3	O43739	400 aa		32.95	■■■□□ 2.87
PCNX1-206	ENST00000554292	MSC	O60682	206 aa		32.95	■■■□□ 2.87
PCNX1-206	ENST00000554292	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	32.95	■■■□□ 2.87
PCNX1-206	ENST00000554292	CCND3	P30281	292 aa	Predicted RBP	32.95	■■■□□ 2.87
PCNX1-206	ENST00000554292	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		32.95	■■■□□ 2.87
PCNX1-206	ENST00000554292	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		32.95	■■■□□ 2.87
PCNX1-206	ENST00000554292	RGS22	Q8NE09	1264 aa		32.95	■■■□□ 2.87
PCNX1-206	ENST00000554292	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	32.95	■■■□□ 2.87
PCNX1-206	ENST00000554292	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		32.95	■■■□□ 2.87
PCNX1-206	ENST00000554292	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	32.95	■■■□□ 2.87
PCNX1-206	ENST00000554292	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		32.95	■■■□□ 2.87
PCNX1-206	ENST00000554292	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	32.95	■■■□□ 2.87
PCNX1-206	ENST00000554292	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		32.95	■■■□□ 2.86
PCNX1-206	ENST00000554292	CNGA1	P29973	690 aa		32.94	■■■□□ 2.86
PCNX1-206	ENST00000554292	CNTN2	Q02246	1040 aa		32.94	■■■□□ 2.86
PCNX1-206	ENST00000554292	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	32.94	■■■□□ 2.86
PCNX1-206	ENST00000554292	RTN1	Q16799	776 aa		32.94	■■■□□ 2.86
PCNX1-206	ENST00000554292	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		32.94	■■■□□ 2.86
PCNX1-206	ENST00000554292	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	32.94	■■■□□ 2.86
PCNX1-206	ENST00000554292	ASB14	A6NK59	587 aa		32.93	■■■□□ 2.86
PCNX1-206	ENST00000554292	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		32.93	■■■□□ 2.86
PCNX1-206	ENST00000554292	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		32.93	■■■□□ 2.86
PCNX1-206	ENST00000554292	PPP2R5B	Q15173	497 aa		32.93	■■■□□ 2.86
PCNX1-206	ENST00000554292	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		32.93	■■■□□ 2.86
PCNX1-206	ENST00000554292	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		32.93	■■■□□ 2.86
PCNX1-206	ENST00000554292	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		32.92	■■■□□ 2.86
PCNX1-206	ENST00000554292	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	32.92	■■■□□ 2.86
PCNX1-206	ENST00000554292	C8orf34	Q49A92	452 aa		32.92	■■■□□ 2.86
PCNX1-206	ENST00000554292	FGD4	Q96M96	766 aa		32.92	■■■□□ 2.86
PCNX1-206	ENST00000554292	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		32.91	■■■□□ 2.86
PCNX1-206	ENST00000554292	APOBR	Q0VD83	1088 aa		32.91	■■■□□ 2.86
PCNX1-206	ENST00000554292	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	32.91	■■■□□ 2.86
PCNX1-206	ENST00000554292	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	32.91	■■■□□ 2.86
PCNX1-206	ENST00000554292	SHISA4	Q96DD7	197 aa		32.91	■■■□□ 2.86
PCNX1-206	ENST00000554292	CRISPLD2	Q9H0B8	497 aa		32.91	■■■□□ 2.86
PCNX1-206	ENST00000554292	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		32.91	■■■□□ 2.86
PCNX1-206	ENST00000554292	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		32.9	■■■□□ 2.86
PCNX1-206	ENST00000554292	CALML3	P27482	149 aa		32.9	■■■□□ 2.86
PCNX1-206	ENST00000554292	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	32.9	■■■□□ 2.86
PCNX1-206	ENST00000554292	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		32.9	■■■□□ 2.86
PCNX1-206	ENST00000554292	ARMCX2	Q7L311	632 aa		32.9	■■■□□ 2.86
PCNX1-206	ENST00000554292	TRPV1	Q8NER1	839 aa		32.9	■■■□□ 2.86
PCNX1-206	ENST00000554292	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	32.9	■■■□□ 2.86
PCNX1-206	ENST00000554292	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	32.9	■■■□□ 2.86

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