RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531226.5

PACSIN3-208, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 654 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC35G1Q2M3R5 365 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-208ENST00000531226 RIOX1Q9H6W3 641 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-208ENST00000531226 CYTH3O43739 400 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-208ENST00000531226 CASTP20810 708 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-208ENST00000531226 RPS6KB1P23443 525 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-208ENST00000531226 USH1GQ495M9 461 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-208ENST00000531226 APOA5Q6Q788 366 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-208ENST00000531226 NFIBO00712 420 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-208ENST00000531226 EN2P19622 333 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-208ENST00000531226 RXRAP19793 462 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-208ENST00000531226 GJA8P48165 433 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-208ENST00000531226 NSMFQ6X4W1 530 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-208ENST00000531226 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-208ENST00000531226 MICU3Q86XE3 530 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-208ENST00000531226 FBXO11Q86XK2 927 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-208ENST00000531226 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM133AQ8N9E0 248 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-208ENST00000531226 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-208ENST00000531226 CLEC4DQ8WXI8 215 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-208ENST00000531226 FGD4Q96M96 766 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-208ENST00000531226 CYP39A1Q9NYL5 469 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-208ENST00000531226 ABCB11O95342 1321 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-208ENST00000531226 POTEB2H3BUK9 544 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-208ENST00000531226 ZBTB5O15062 677 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-208ENST00000531226 CYBAP13498 195 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-208ENST00000531226 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-208ENST00000531226 GNAQP50148 359 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-208ENST00000531226 FGD1P98174 961 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-208ENST00000531226 Q6ZUG5 572 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-208ENST00000531226 FBXL16Q8N461 479 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-208ENST00000531226 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-208ENST00000531226 SHISA4Q96DD7 197 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-208ENST00000531226 DEFB118Q96PH6 123 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-208ENST00000531226 LZTS2Q9BRK4 669 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-208ENST00000531226 TINF2Q9BSI4 451 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-208ENST00000531226 SPZ1Q9BXG8 430 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-208ENST00000531226 AMNQ9BXJ7 453 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-208ENST00000531226 TM6SF1Q9BZW5 370 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-208ENST00000531226 BRPF3Q9ULD4 1205 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-208ENST00000531226 BRCA2P51587 3418 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-208ENST00000531226 SGPL1O95470 568 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-208ENST00000531226 SMARCA1P28370 1054 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-208ENST00000531226 CNTN2Q02246 1040 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-208ENST00000531226 C8orf34Q49A92 452 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-208ENST00000531226 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-208ENST00000531226 RUFY3Q7L099 469 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-208ENST00000531226 HOMER1Q86YM7 354 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-208ENST00000531226 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-208ENST00000531226 FANCBQ8NB91 859 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-208ENST00000531226 PIGSQ96S52 555 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-208ENST00000531226 AGXT2Q9BYV1 514 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-208ENST00000531226 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-208ENST00000531226 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-208ENST00000531226 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-208ENST00000531226 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-208ENST00000531226 PLEKHA8P1O95397 391 aa22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-208ENST00000531226 RCAN1P53805 252 aa22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-208ENST00000531226 TRPV1Q8NER1 839 aa22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-208ENST00000531226 NRBP1Q9UHY1 535 aa22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-208ENST00000531226 PTPDC1A2A3K4 754 aa22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-208ENST00000531226 ZBTB43O43298 467 aa22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-208ENST00000531226 SEC24BO95487 1268 aa22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-208ENST00000531226 CAPN2P17655 700 aa22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-208ENST00000531226 ANAPC15P60006 121 aa22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-208ENST00000531226 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC30A10Q6XR72 485 aa22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-208ENST00000531226 RNF207Q6ZRF8 634 aa22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-208ENST00000531226 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-208ENST00000531226 BRF1Q92994 677 aa22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-208ENST00000531226 MAF1Q9H063 256 aa22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-208ENST00000531226 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-208ENST00000531226 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-208ENST00000531226 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-208ENST00000531226 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-208ENST00000531226 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa22.05■■□□□ 1.12
PACSIN3-208ENST00000531226 SOWAHBA6NEL2 793 aa22.05■■□□□ 1.12
PACSIN3-208ENST00000531226 RTN1Q16799 776 aa22.05■■□□□ 1.12
PACSIN3-208ENST00000531226 TMTC3Q6ZXV5 915 aa22.05■■□□□ 1.12
PACSIN3-208ENST00000531226 RGS22Q8NE09 1264 aa22.05■■□□□ 1.12
PACSIN3-208ENST00000531226 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa22.05■■□□□ 1.12
PACSIN3-208ENST00000531226 ASTN1O14525 1302 aa22.05■■□□□ 1.12
PACSIN3-208ENST00000531226 MSCO60682 206 aa22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-208ENST00000531226 CNGA1P29973 690 aa22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-208ENST00000531226 RPS6P62753 249 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-208ENST00000531226 APOBRQ0VD83 1088 aa22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-208ENST00000531226 TRAF1Q13077 416 aa22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-208ENST00000531226 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-208ENST00000531226 ARMCX2Q7L311 632 aa22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-208ENST00000531226 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-208ENST00000531226 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-208ENST00000531226 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-208ENST00000531226 NID2Q14112 1375 aa22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-208ENST00000531226 GOLGA8AA7E2F4 631 aa22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-208ENST00000531226 GOLGA8BA8MQT2 603 aa22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-208ENST00000531226 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-208ENST00000531226 MCF2L2Q86YR7 1114 aa22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-208ENST00000531226 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-208ENST00000531226 PIBF1Q8WXW3 757 aa22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-208ENST00000531226 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
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