RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514552.5

PDE4D-222, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-222ENST00000514552 CRKP46108 304 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-222ENST00000514552 NFIAQ12857 509 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-222ENST00000514552 FLAD1Q8NFF5 587 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-222ENST00000514552 DBNDD2Q9BQY9 259 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-222ENST00000514552 C1GALT1Q9NS00 363 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-222ENST00000514552 TAF1LQ8IZX4 1826 aa9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-222ENST00000514552 PALLDQ8WX93 1383 aa9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-222ENST00000514552 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-222ENST00000514552 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-222ENST00000514552 HID1Q8IV36 788 aa9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-222ENST00000514552 SLITRK4Q8IW52 837 aa9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-222ENST00000514552 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-222ENST00000514552 CCSER2Q9H7U1 834 aa9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-222ENST00000514552 ADAM30Q9UKF2 790 aa9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-222ENST00000514552 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-222ENST00000514552 KAT6BQ8WYB5 2073 aa9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-222ENST00000514552 WASHC2AQ641Q2 1341 aa9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-222ENST00000514552 C4BP0C0L5 1744 aa9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-222ENST00000514552 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
PDE4D-222ENST00000514552 PGRP06401 933 aa9.27□□□□□ -0.93
PDE4D-222ENST00000514552 FBLN1P23142 703 aa9.27□□□□□ -0.93
PDE4D-222ENST00000514552 CAP2P40123 477 aa9.27□□□□□ -0.93
PDE4D-222ENST00000514552 ZAR1Q86SH2 424 aa9.27□□□□□ -0.93
PDE4D-222ENST00000514552 GIMAP7Q8NHV1 300 aa9.27□□□□□ -0.93
PDE4D-222ENST00000514552 NKD1Q969G9 470 aa9.27□□□□□ -0.93
PDE4D-222ENST00000514552 SPATA32Q96LK8 384 aa9.27□□□□□ -0.93
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF831Q5JPB2 1677 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-222ENST00000514552 CYP27B1O15528 508 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-222ENST00000514552 PAK2Q13177 524 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-222ENST00000514552 SEZ6Q53EL9 994 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-222ENST00000514552 UBE3DQ7Z6J8 389 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-222ENST00000514552 USHBP1Q8N6Y0 703 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-222ENST00000514552 FBRSQ9HAH7 460 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-222ENST00000514552 LGR6Q9HBX8 967 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-222ENST00000514552 BRMS1Q9HCU9 246 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-222ENST00000514552 ITGB4P16144 1822 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-222ENST00000514552 GRIN3BO60391 1043 aa9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-222ENST00000514552 GPR162Q16538 588 aa9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-222ENST00000514552 PRSS36Q5K4E3 855 aa9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-222ENST00000514552 TMEM201Q5SNT2 666 aa9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-222ENST00000514552 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-222ENST00000514552 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-222ENST00000514552 GATA6Q92908 595 aa9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-222ENST00000514552 MFSD14AQ96MC6 490 aa9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-222ENST00000514552 TBC1D32Q96NH3 1257 aa9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-222ENST00000514552 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-222ENST00000514552 ACBD3Q9H3P7 528 aa9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-222ENST00000514552 CORINQ9Y5Q5 1042 aa9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-222ENST00000514552 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-222ENST00000514552 UBR3Q6ZT12 1888 aa9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-222ENST00000514552 LRIG2O94898 1065 aa9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-222ENST00000514552 ATE1O95260 518 aa9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-222ENST00000514552 PLCG1P19174 1290 aa9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-222ENST00000514552 ADMP35318 185 aa9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-222ENST00000514552 GJA8P48165 433 aa9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF165P49910 485 aa9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-222ENST00000514552 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-222ENST00000514552 SLC6A19Q695T7 634 aa9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-222ENST00000514552 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-222ENST00000514552 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-222ENST00000514552 GPRASP2Q96D09 838 aa9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-222ENST00000514552 EHMT1Q9H9B1 1298 aa9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-222ENST00000514552 CD2APQ9Y5K6 639 aa9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-222ENST00000514552 ADAM23O75077 832 aa9.23□□□□□ -0.93
PDE4D-222ENST00000514552 HTR3BO95264 441 aa9.23□□□□□ -0.93
PDE4D-222ENST00000514552 CDK5R2Q13319 367 aa9.23□□□□□ -0.93
PDE4D-222ENST00000514552 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
PDE4D-222ENST00000514552 NKG7Q16617 165 aa9.23□□□□□ -0.93
PDE4D-222ENST00000514552 ARMCX6Q7L4S7 300 aa9.23□□□□□ -0.93
PDE4D-222ENST00000514552 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
PDE4D-222ENST00000514552 FBXL6Q8N531 539 aa9.23□□□□□ -0.93
PDE4D-222ENST00000514552 RASGRP4Q8TDF6 673 aa9.23□□□□□ -0.93
PDE4D-222ENST00000514552 TMEM87BQ96K49 555 aa9.23□□□□□ -0.93
PDE4D-222ENST00000514552 FOXQ1Q9C009 403 aa9.23□□□□□ -0.93
PDE4D-222ENST00000514552 TJP2Q9UDY2 1190 aa9.23□□□□□ -0.93
PDE4D-222ENST00000514552 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa9.23□□□□□ -0.93
PDE4D-222ENST00000514552 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa9.23□□□□□ -0.93
PDE4D-222ENST00000514552 CST3P01034 146 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
PDE4D-222ENST00000514552 F13BP05160 661 aa9.22□□□□□ -0.93
PDE4D-222ENST00000514552 MCM4P33991 863 aa9.22□□□□□ -0.93
PDE4D-222ENST00000514552 CYP27A1Q02318 531 aa9.22□□□□□ -0.93
PDE4D-222ENST00000514552 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP9.22□□□□□ -0.93
PDE4D-222ENST00000514552 OGFOD3Q6PK18 319 aa9.22□□□□□ -0.93
PDE4D-222ENST00000514552 NLGN2Q8NFZ4 835 aa9.22□□□□□ -0.93
PDE4D-222ENST00000514552 SHKBP1Q8TBC3 707 aa9.22□□□□□ -0.93
PDE4D-222ENST00000514552 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
PDE4D-222ENST00000514552 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
PDE4D-222ENST00000514552 REV1Q9UBZ9 1251 aa9.22□□□□□ -0.93
PDE4D-222ENST00000514552 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
PDE4D-222ENST00000514552 IGSF1Q8N6C5 1336 aa9.22□□□□□ -0.93
PDE4D-222ENST00000514552 KDRP35968 1356 aa9.22□□□□□ -0.93
PDE4D-222ENST00000514552 WDR64B1ANS9 1081 aa9.21□□□□□ -0.94
PDE4D-222ENST00000514552 ITGB7P26010 798 aa9.21□□□□□ -0.94
PDE4D-222ENST00000514552 C1QTNF8P60827 252 aa9.21□□□□□ -0.94
PDE4D-222ENST00000514552 IFNL2Q8IZJ0 200 aa9.21□□□□□ -0.94
PDE4D-222ENST00000514552 MFSD2AQ8NA29 543 aa9.21□□□□□ -0.94
PDE4D-222ENST00000514552 PIGBQ92521 554 aa9.21□□□□□ -0.94
PDE4D-222ENST00000514552 PRDM10Q9NQV6 1147 aa9.21□□□□□ -0.94
PDE4D-222ENST00000514552 ATG3Q9NT62 314 aa9.21□□□□□ -0.94
PDE4D-222ENST00000514552 TMOD3Q9NYL9 352 aa9.21□□□□□ -0.94
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