RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513595.1

FOXD1-201, Transcript of forkhead box D1, humanhuman

TSL 3

Gene FOXD1, Length 406 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1-201ENST00000513595 TBC1D12O60347 775 aa15.49■□□□□ 0.07
FOXD1-201ENST00000513595 PEX10O60683 326 aa15.49■□□□□ 0.07
FOXD1-201ENST00000513595 PRDM1O75626 825 aa15.49■□□□□ 0.07
FOXD1-201ENST00000513595 WTAPQ15007 396 aa15.49■□□□□ 0.07
FOXD1-201ENST00000513595 AAK1Q2M2I8 961 aa15.49■□□□□ 0.07
FOXD1-201ENST00000513595 TRIM60Q495X7 471 aa15.49■□□□□ 0.07
FOXD1-201ENST00000513595 GPR142Q7Z601 462 aa15.49■□□□□ 0.07
FOXD1-201ENST00000513595 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa15.49■□□□□ 0.07
FOXD1-201ENST00000513595 MICALL1Q8N3F8 863 aa15.49■□□□□ 0.07
FOXD1-201ENST00000513595 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
FOXD1-201ENST00000513595 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa15.49■□□□□ 0.07
FOXD1-201ENST00000513595 PHIPQ8WWQ0 1821 aa15.48■□□□□ 0.07
FOXD1-201ENST00000513595 PFKFB2O60825 505 aa15.48■□□□□ 0.07
FOXD1-201ENST00000513595 LARGE1O95461 756 aa15.48■□□□□ 0.07
FOXD1-201ENST00000513595 RASA1P20936 1047 aa15.48■□□□□ 0.07
FOXD1-201ENST00000513595 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
FOXD1-201ENST00000513595 RCAN1P53805 252 aa15.48■□□□□ 0.07
FOXD1-201ENST00000513595 EPHB4P54760 987 aa15.48■□□□□ 0.07
FOXD1-201ENST00000513595 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
FOXD1-201ENST00000513595 NHLH1Q02575 133 aa15.48■□□□□ 0.07
FOXD1-201ENST00000513595 APOBRQ0VD83 1088 aa15.48■□□□□ 0.07
FOXD1-201ENST00000513595 ADGRE1Q14246 886 aa15.48■□□□□ 0.07
FOXD1-201ENST00000513595 Q3C1V9 767 aa15.48■□□□□ 0.07
FOXD1-201ENST00000513595 C1orf53Q5VUE5 145 aa15.48■□□□□ 0.07
FOXD1-201ENST00000513595 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa15.48■□□□□ 0.07
FOXD1-201ENST00000513595 PLEKHH3Q7Z736 793 aa15.48■□□□□ 0.07
FOXD1-201ENST00000513595 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
FOXD1-201ENST00000513595 ARRDC4Q8NCT1 418 aa15.48■□□□□ 0.07
FOXD1-201ENST00000513595 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
FOXD1-201ENST00000513595 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
FOXD1-201ENST00000513595 LY9Q9HBG7 655 aa15.48■□□□□ 0.07
FOXD1-201ENST00000513595 RBPJLQ9UBG7 517 aa15.48■□□□□ 0.07
FOXD1-201ENST00000513595 TNKSO95271 1327 aa15.47■□□□□ 0.07
FOXD1-201ENST00000513595 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa15.47■□□□□ 0.07
FOXD1-201ENST00000513595 CCDC69A6NI79 296 aa15.47■□□□□ 0.07
FOXD1-201ENST00000513595 TSPY3P0CV98 308 aa15.47■□□□□ 0.07
FOXD1-201ENST00000513595 TSPY8P0CW00 308 aa15.47■□□□□ 0.07
FOXD1-201ENST00000513595 CNGA1P29973 690 aa15.47■□□□□ 0.07
FOXD1-201ENST00000513595 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
FOXD1-201ENST00000513595 TFAP4Q01664 338 aa15.47■□□□□ 0.07
FOXD1-201ENST00000513595 MAP2K5Q13163 448 aa15.47■□□□□ 0.07
FOXD1-201ENST00000513595 SEC23AQ15436 765 aa15.47■□□□□ 0.07
FOXD1-201ENST00000513595 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa15.47■□□□□ 0.07
FOXD1-201ENST00000513595 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
FOXD1-201ENST00000513595 NFXL1Q6ZNB6 911 aa15.47■□□□□ 0.07
FOXD1-201ENST00000513595 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
FOXD1-201ENST00000513595 CCDC83Q8IWF9 413 aa15.47■□□□□ 0.07
FOXD1-201ENST00000513595 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
FOXD1-201ENST00000513595 SLC44A5Q8NCS7 719 aa15.47■□□□□ 0.07
FOXD1-201ENST00000513595 NEDD1Q8NHV4 660 aa15.47■□□□□ 0.07
FOXD1-201ENST00000513595 GTF3C6Q969F1 213 aa15.47■□□□□ 0.07
FOXD1-201ENST00000513595 CCDC17Q96LX7 622 aa15.47■□□□□ 0.07
FOXD1-201ENST00000513595 TRIM34Q9BYJ4 488 aa15.47■□□□□ 0.07
FOXD1-201ENST00000513595 PORCNQ9H237 461 aa15.47■□□□□ 0.07
FOXD1-201ENST00000513595 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
FOXD1-201ENST00000513595 CHD9Q3L8U1 2897 aa15.47■□□□□ 0.07
FOXD1-201ENST00000513595 PLIN4Q96Q06 1357 aa15.47■□□□□ 0.07
FOXD1-201ENST00000513595 GOLGA8BA8MQT2 603 aa15.46■□□□□ 0.07
FOXD1-201ENST00000513595 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
FOXD1-201ENST00000513595 ITGB8P26012 769 aa15.46■□□□□ 0.07
FOXD1-201ENST00000513595 HERVK_113P62684 666 aa15.46■□□□□ 0.07
FOXD1-201ENST00000513595 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
FOXD1-201ENST00000513595 TMEM92Q6UXU6 159 aa15.46■□□□□ 0.07
FOXD1-201ENST00000513595 DGKHQ86XP1 1220 aa15.46■□□□□ 0.07
FOXD1-201ENST00000513595 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa15.46■□□□□ 0.07
FOXD1-201ENST00000513595 ANKS1AQ92625 1134 aa15.46■□□□□ 0.07
FOXD1-201ENST00000513595 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP15.46■□□□□ 0.07
FOXD1-201ENST00000513595 UIMC1Q96RL1 719 aa15.46■□□□□ 0.07
FOXD1-201ENST00000513595 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
FOXD1-201ENST00000513595 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
FOXD1-201ENST00000513595 FLRT1Q9NZU1 646 aa15.46■□□□□ 0.07
FOXD1-201ENST00000513595 SLC12A7Q9Y666 1083 aa15.46■□□□□ 0.07
FOXD1-201ENST00000513595 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa15.46■□□□□ 0.06
FOXD1-201ENST00000513595 USP17L5A8MUK1 530 aa15.45■□□□□ 0.06
FOXD1-201ENST00000513595 KBTBD13C9JR72 458 aa15.45■□□□□ 0.06
FOXD1-201ENST00000513595 DDIT3P35638 169 aa15.45■□□□□ 0.06
FOXD1-201ENST00000513595 ERVK-9P63128 1117 aa15.45■□□□□ 0.06
FOXD1-201ENST00000513595 ERVK-24P63145 666 aa15.45■□□□□ 0.06
FOXD1-201ENST00000513595 PPP2R5BQ15173 497 aa15.45■□□□□ 0.06
FOXD1-201ENST00000513595 FAM47AQ5JRC9 791 aa15.45■□□□□ 0.06
FOXD1-201ENST00000513595 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
FOXD1-201ENST00000513595 APOA5Q6Q788 366 aa15.45■□□□□ 0.06
FOXD1-201ENST00000513595 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
FOXD1-201ENST00000513595 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa15.45■□□□□ 0.06
FOXD1-201ENST00000513595 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP15.45■□□□□ 0.06
FOXD1-201ENST00000513595 CHMP5Q9NZZ3 219 aa15.45■□□□□ 0.06
FOXD1-201ENST00000513595 BRPF3Q9ULD4 1205 aa15.45■□□□□ 0.06
FOXD1-201ENST00000513595 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
FOXD1-201ENST00000513595 SMC3Q9UQE7 1217 aa15.45■□□□□ 0.06
FOXD1-201ENST00000513595 DOCK1Q14185 1865 aa15.45■□□□□ 0.06
FOXD1-201ENST00000513595 NID2Q14112 1375 aa15.45■□□□□ 0.06
FOXD1-201ENST00000513595 LOC285556D6RIA3 1793 aa15.44■□□□□ 0.06
FOXD1-201ENST00000513595 ZBTB43O43298 467 aa15.44■□□□□ 0.06
FOXD1-201ENST00000513595 CALM1P0DP23 149 aa15.44■□□□□ 0.06
FOXD1-201ENST00000513595 CALM2P0DP24 149 aa15.44■□□□□ 0.06
FOXD1-201ENST00000513595 CALM3P0DP25 149 aa15.44■□□□□ 0.06
FOXD1-201ENST00000513595 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
FOXD1-201ENST00000513595 SHMT1P34896 483 aa15.44■□□□□ 0.06
FOXD1-201ENST00000513595 PBX2P40425 430 aa15.44■□□□□ 0.06
FOXD1-201ENST00000513595 EMP3P54852 163 aa15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms