RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512427.5

HOXC-AS1-202, HOXC cluster antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene HOXC-AS1, Length 290 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 Q9Y3F1 56 aa11.02□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa11.02□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ZBBXA8MT70 800 aa11.01□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TMEM232C9JQI7 657 aa11.01□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CCL23P55773 120 aa11.01□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CNTN2Q02246 1040 aa11.01□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ADGRE1Q14246 886 aa11.01□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MICALL1Q8N3F8 863 aa11.01□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 FAM122AQ96E09 287 aa11.01□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 KATNBL1Q9H079 304 aa11.01□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ECHDC1Q9NTX5 307 aa11.01□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MYH4Q9Y623 1939 aa11.01□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PLIN4Q96Q06 1357 aa11.01□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CTAGE5O15320 804 aa11□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 GPAA1O43292 621 aa11□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PLA2G6O60733 806 aa11□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CHGBP05060 677 aa11□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ACTN1P12814 892 aa11□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ALAS1P13196 640 aa11□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PLA2G5P39877 138 aa11□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SLC1A4P43007 532 aa11□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SIRT2Q8IXJ6 389 aa11□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 NEDD1Q8NHV4 660 aa11□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 STAG1Q8WVM7 1258 aa11□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 GMCL1Q96IK5 515 aa11□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TRERF1Q96PN7 1200 aa11□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 VTA1Q9NP79 307 aa11□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 POLR3EQ9NVU0 708 aa11□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MCM3APO60318 1980 aa10.99□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MUC3AQ02505 3323 aa10.99□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa10.99□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 B4GALT4O60513 344 aa10.99□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PRDM1O75626 825 aa10.99□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CPT1AP50416 773 aa10.99□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TMEM67Q5HYA8 995 aa10.99□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 OSBP2Q969R2 916 aa10.99□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 NAPBQ9H115 298 aa10.99□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TRPV6Q9H1D0 765 aa10.99□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ASTN1O14525 1302 aa10.99□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RAD50Q92878 1312 aa10.99□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SOWAHBA6NEL2 793 aa10.98□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 KIF28PB7ZC32 967 aa10.98□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SMPD1P17405 629 aa10.98□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RFC2P35250 354 aa10.98□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TFAP4Q01664 338 aa10.98□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa10.98□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 AGBL1Q96MI9 1066 aa10.98□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SLC9A7Q96T83 725 aa10.98□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 WNT8AQ9H1J5 351 aa10.98□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CYP39A1Q9NYL5 469 aa10.98□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CCPG1Q9ULG6 757 aa10.98□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 COG5Q9UP83 839 aa10.98□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 UMODL1Q5DID0 1318 aa10.98□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CHD7Q9P2D1 2997 aa10.98□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TSPY2A6NKD2 308 aa10.97□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ERC2O15083 957 aa10.97□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MCCP23508 829 aa10.97□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RABGGTBP53611 331 aa10.97□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 DUSP28Q4G0W2 176 aa10.97□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RCSD1Q6JBY9 416 aa10.97□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 NSMFQ6X4W1 530 aa10.97□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 EEPD1Q7L9B9 569 aa10.97□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 IFNL3Q8IZI9 196 aa10.97□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RETREG2Q8NC44 543 aa10.97□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa10.97□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PNMA2Q9UL42 364 aa10.97□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 STX8Q9UNK0 236 aa10.97□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 GRIN2DO15399 1336 aa10.97□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TNKSO95271 1327 aa10.97□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MYO9BQ13459 2157 aa10.97□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ZNF536O15090 1300 aa10.96□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 B4DLN1 442 aa10.96□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PITPNM1O00562 1244 aa10.96□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP10.96□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 KPNA6O60684 536 aa10.96□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 BMP1P13497 986 aa10.96□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PSMC6P62333 389 aa10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms