RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491264.5

HOXB-AS3-213, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3

Gene HOXB-AS3, Length 478 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-213ENST00000491264 TMTC2Q8N394 836 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXB-AS3-213ENST00000491264 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXB-AS3-213ENST00000491264 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
HOXB-AS3-213ENST00000491264 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
HOXB-AS3-213ENST00000491264 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXB-AS3-213ENST00000491264 CCDC69A6NI79 296 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXB-AS3-213ENST00000491264 KBTBD13C9JR72 458 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXB-AS3-213ENST00000491264 NFIBO00712 420 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXB-AS3-213ENST00000491264 REC8O95072 547 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXB-AS3-213ENST00000491264 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
HOXB-AS3-213ENST00000491264 KRT32Q14532 448 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXB-AS3-213ENST00000491264 GRM4Q14833 912 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXB-AS3-213ENST00000491264 RNF207Q6ZRF8 634 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXB-AS3-213ENST00000491264 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXB-AS3-213ENST00000491264 STAG2Q8N3U4 1231 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXB-AS3-213ENST00000491264 NUP133Q8WUM0 1156 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXB-AS3-213ENST00000491264 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXB-AS3-213ENST00000491264 MAD2L2Q9UI95 211 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXB-AS3-213ENST00000491264 FAM184BQ9ULE4 1060 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXB-AS3-213ENST00000491264 DNM1LO00429 736 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-213ENST00000491264 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-213ENST00000491264 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-213ENST00000491264 CALML3P27482 149 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-213ENST00000491264 ACVR2BQ13705 512 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-213ENST00000491264 FBXO11Q86XK2 927 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-213ENST00000491264 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-213ENST00000491264 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-213ENST00000491264 JMJD4Q9H9V9 463 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-213ENST00000491264 LY9Q9HBG7 655 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-213ENST00000491264 SENP2Q9HC62 589 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-213ENST00000491264 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-213ENST00000491264 ABCB11O95342 1321 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-213ENST00000491264 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-213ENST00000491264 DDAH1O94760 285 aa23■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-213ENST00000491264 KIF5BP33176 963 aa23■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-213ENST00000491264 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-213ENST00000491264 QRICH1Q2TAL8 776 aa23■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-213ENST00000491264 FGD4Q96M96 766 aa23■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-213ENST00000491264 NEK1Q96PY6 1258 aa23■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-213ENST00000491264 SOWAHBA6NEL2 793 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-213ENST00000491264 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-213ENST00000491264 TROAPQ12815 778 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-213ENST00000491264 TRAF1Q13077 416 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-213ENST00000491264 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-213ENST00000491264 RNF180Q86T96 592 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-213ENST00000491264 MCF2L2Q86YR7 1114 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-213ENST00000491264 ZNF654Q8IZM8 581 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-213ENST00000491264 CLEC4DQ8WXI8 215 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-213ENST00000491264 AMNQ9BXJ7 453 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-213ENST00000491264 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-213ENST00000491264 ZBTB5O15062 677 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-213ENST00000491264 HOMER1Q86YM7 354 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-213ENST00000491264 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-213ENST00000491264 SLC12A7Q9Y666 1083 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-213ENST00000491264 B4DLN1 442 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-213ENST00000491264 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-213ENST00000491264 CALM1P0DP23 149 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-213ENST00000491264 CALM2P0DP24 149 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-213ENST00000491264 CALM3P0DP25 149 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-213ENST00000491264 COL6A1P12109 1028 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-213ENST00000491264 LIFRP42702 1097 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-213ENST00000491264 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-213ENST00000491264 RPS6P62753 249 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-213ENST00000491264 SLC30A10Q6XR72 485 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-213ENST00000491264 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-213ENST00000491264 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-213ENST00000491264 RGS22Q8NE09 1264 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-213ENST00000491264 MAP3K14Q99558 947 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-213ENST00000491264 MAF1Q9H063 256 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-213ENST00000491264 SPC25Q9HBM1 224 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-213ENST00000491264 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-213ENST00000491264 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-213ENST00000491264 H0YGN5 161 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-213ENST00000491264 GNAQP50148 359 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-213ENST00000491264 FGD1P98174 961 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-213ENST00000491264 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-213ENST00000491264 LRRC41Q15345 812 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-213ENST00000491264 CCDC144BQ3MJ40 725 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-213ENST00000491264 TSGA10IPQ3SY00 556 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-213ENST00000491264 MYL10Q9BUA6 226 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-213ENST00000491264 LRRC2Q9BYS8 371 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-213ENST00000491264 PGK1P00558 417 aa22.95■■□□□ 1.26
HOXB-AS3-213ENST00000491264 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
HOXB-AS3-213ENST00000491264 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
HOXB-AS3-213ENST00000491264 RASEFQ8IZ41 740 aa22.95■■□□□ 1.26
HOXB-AS3-213ENST00000491264 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
HOXB-AS3-213ENST00000491264 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
HOXB-AS3-213ENST00000491264 LZTS2Q9BRK4 669 aa22.95■■□□□ 1.26
HOXB-AS3-213ENST00000491264 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa22.95■■□□□ 1.26
HOXB-AS3-213ENST00000491264 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
HOXB-AS3-213ENST00000491264 PDE4DQ08499 809 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXB-AS3-213ENST00000491264 EEPD1Q7L9B9 569 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXB-AS3-213ENST00000491264 C7orf61Q8IZ16 206 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXB-AS3-213ENST00000491264 DNERQ8NFT8 737 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXB-AS3-213ENST00000491264 PIGSQ96S52 555 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXB-AS3-213ENST00000491264 RIOX1Q9H6W3 641 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXB-AS3-213ENST00000491264 VTA1Q9NP79 307 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXB-AS3-213ENST00000491264 CEP290O15078 2479 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXB-AS3-213ENST00000491264 ASTN1O14525 1302 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXB-AS3-213ENST00000491264 TNFAIP2Q03169 654 aa22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms