RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487849.7

HOXB-AS3-212, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 2

Gene HOXB-AS3, Length 428 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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HOXB-AS3-212ENST00000487849 PIGSQ96S52 555 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXB-AS3-212ENST00000487849 RIOX1Q9H6W3 641 aa22.94■■□□□ 1.26
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