RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486840.1

CCZ1B-211, Transcript of CCZ1 homolog B, vacuolar protein trafficking and biogenesis associated, humanhuman

TSL 2

Gene CCZ1B, Length 545 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCZ1B-211ENST00000486840 NECTIN1Q15223 517 aa31.24■■■□□ 2.59
CCZ1B-211ENST00000486840 ARMCX2Q7L311 632 aa31.24■■■□□ 2.59
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CCZ1B-211ENST00000486840 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa31.24■■■□□ 2.59
CCZ1B-211ENST00000486840 ACVR2BQ13705 512 aa31.23■■■□□ 2.59
CCZ1B-211ENST00000486840 RNF207Q6ZRF8 634 aa31.23■■■□□ 2.59
CCZ1B-211ENST00000486840 RNF180Q86T96 592 aa31.23■■■□□ 2.59
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CCZ1B-211ENST00000486840 FAM133AQ8N9E0 248 aa31.23■■■□□ 2.59
CCZ1B-211ENST00000486840 NUP133Q8WUM0 1156 aa31.23■■■□□ 2.59
CCZ1B-211ENST00000486840 TMEM87BQ96K49 555 aa31.23■■■□□ 2.59
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CCZ1B-211ENST00000486840 TAF6LQ9Y6J9 622 aa31.23■■■□□ 2.59
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CCZ1B-211ENST00000486840 CALML3P27482 149 aa31.22■■■□□ 2.59
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CCZ1B-211ENST00000486840 FBXO11Q86XK2 927 aa31.22■■■□□ 2.59
CCZ1B-211ENST00000486840 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa31.22■■■□□ 2.59
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CCZ1B-211ENST00000486840 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP31.22■■■□□ 2.59
CCZ1B-211ENST00000486840 ABCB11O95342 1321 aa31.22■■■□□ 2.59
CCZ1B-211ENST00000486840 REC8O95072 547 aa31.21■■■□□ 2.59
CCZ1B-211ENST00000486840 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP31.21■■■□□ 2.59
CCZ1B-211ENST00000486840 KIF5BP33176 963 aa31.21■■■□□ 2.59
CCZ1B-211ENST00000486840 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP31.21■■■□□ 2.59
CCZ1B-211ENST00000486840 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa31.21■■■□□ 2.59
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CCZ1B-211ENST00000486840 NFIBO00712 420 aa31.19■■■□□ 2.58
CCZ1B-211ENST00000486840 GRM4Q14833 912 aa31.19■■■□□ 2.58
CCZ1B-211ENST00000486840 QRICH1Q2TAL8 776 aa31.19■■■□□ 2.58
CCZ1B-211ENST00000486840 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa31.19■■■□□ 2.58
CCZ1B-211ENST00000486840 AMNQ9BXJ7 453 aa31.19■■■□□ 2.58
CCZ1B-211ENST00000486840 H0YGN5 161 aa31.18■■■□□ 2.58
CCZ1B-211ENST00000486840 CALM1P0DP23 149 aa31.18■■■□□ 2.58
CCZ1B-211ENST00000486840 CALM2P0DP24 149 aa31.18■■■□□ 2.58
CCZ1B-211ENST00000486840 CALM3P0DP25 149 aa31.18■■■□□ 2.58
CCZ1B-211ENST00000486840 STAG2Q8N3U4 1231 aa31.18■■■□□ 2.58
CCZ1B-211ENST00000486840 NEK1Q96PY6 1258 aa31.18■■■□□ 2.58
CCZ1B-211ENST00000486840 MAF1Q9H063 256 aa31.18■■■□□ 2.58
CCZ1B-211ENST00000486840 JMJD4Q9H9V9 463 aa31.18■■■□□ 2.58
CCZ1B-211ENST00000486840 MAD2L2Q9UI95 211 aa31.18■■■□□ 2.58
CCZ1B-211ENST00000486840 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa31.17■■■□□ 2.58
CCZ1B-211ENST00000486840 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP31.17■■■□□ 2.58
CCZ1B-211ENST00000486840 SOWAHBA6NEL2 793 aa31.17■■■□□ 2.58
CCZ1B-211ENST00000486840 ANTXR2P58335 489 aa31.17■■■□□ 2.58
CCZ1B-211ENST00000486840 FGD1P98174 961 aa31.17■■■□□ 2.58
CCZ1B-211ENST00000486840 C7orf61Q8IZ16 206 aa31.17■■■□□ 2.58
CCZ1B-211ENST00000486840 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa31.16■■■□□ 2.58
CCZ1B-211ENST00000486840 DDAH1O94760 285 aa31.16■■■□□ 2.58
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CCZ1B-211ENST00000486840 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP31.16■■■□□ 2.58
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CCZ1B-211ENST00000486840 HOMER1Q86YM7 354 aa31.16■■■□□ 2.58
CCZ1B-211ENST00000486840 ZNF654Q8IZM8 581 aa31.16■■■□□ 2.58
CCZ1B-211ENST00000486840 RGS22Q8NE09 1264 aa31.16■■■□□ 2.58
CCZ1B-211ENST00000486840 SLC12A7Q9Y666 1083 aa31.16■■■□□ 2.58
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CCZ1B-211ENST00000486840 LY9Q9HBG7 655 aa31.15■■■□□ 2.58
CCZ1B-211ENST00000486840 PGK1P00558 417 aa31.14■■■□□ 2.58
CCZ1B-211ENST00000486840 COL6A1P12109 1028 aa31.14■■■□□ 2.58
CCZ1B-211ENST00000486840 LIFRP42702 1097 aa31.14■■■□□ 2.58
CCZ1B-211ENST00000486840 PDE4DQ08499 809 aa31.14■■■□□ 2.58
CCZ1B-211ENST00000486840 TROAPQ12815 778 aa31.14■■■□□ 2.58
CCZ1B-211ENST00000486840 MAP3K14Q99558 947 aa31.14■■■□□ 2.58
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CCZ1B-211ENST00000486840 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP31.13■■■□□ 2.57
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CCZ1B-211ENST00000486840 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP31.13■■■□□ 2.57
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CCZ1B-211ENST00000486840 AP5M1Q9H0R1 490 aa31.12■■■□□ 2.57
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CCZ1B-211ENST00000486840 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP31.12■■■□□ 2.57
CCZ1B-211ENST00000486840 IQSEC1Q6DN90 963 aa31.11■■■□□ 2.57
CCZ1B-211ENST00000486840 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP31.11■■■□□ 2.57
CCZ1B-211ENST00000486840 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa31.11■■■□□ 2.57
CCZ1B-211ENST00000486840 TSGA10IPQ3SY00 556 aa31.1■■■□□ 2.57
CCZ1B-211ENST00000486840 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP31.1■■■□□ 2.57
CCZ1B-211ENST00000486840 FERMT2Q96AC1 680 aa31.1■■■□□ 2.57
CCZ1B-211ENST00000486840 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP31.1■■■□□ 2.57
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