RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477112.1

DDX17-208, Transcript of DEAD-box helicase 17, human

TSL 2

Gene DDX17, Length 654 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX17-208	ENST00000477112	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		3.76	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		3.76	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	WASH4P	A8MWX3	477 aa		3.75	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	ABLIM1	O14639	778 aa		3.75	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	ITGB3	P05106	788 aa		3.75	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	LTK	P29376	864 aa		3.75	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	EIF4A3	P38919	411 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	GJA8	P48165	433 aa		3.75	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	CDR1	P51861	262 aa		3.75	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	HSPA2	P54652	639 aa		3.75	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	RPS26	P62854	115 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	PAK2	Q13177	524 aa		3.75	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	MYBPC2	Q14324	1141 aa		3.75	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	ZNF394	Q53GI3	561 aa		3.75	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		3.75	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		3.75	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	PI16	Q6UXB8	463 aa		3.75	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		3.75	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	DPH6	Q7L8W6	267 aa		3.75	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		3.75	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		3.75	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	C8orf49	Q96NF6	230 aa		3.75	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	TMEM74	Q96NL1	305 aa		3.75	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	CRBN	Q96SW2	442 aa		3.75	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	MTA3	Q9BTC8	594 aa		3.75	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		3.75	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	ABCB6	Q9NP58	842 aa		3.75	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	RNF19A	Q9NV58	838 aa		3.75	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		3.75	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		3.75	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	PPFIA4	O75335	1185 aa		3.74	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	PEX14	O75381	377 aa		3.74	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	RBL2	Q08999	1139 aa		3.74	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	SNAP47	Q5SQN1	464 aa		3.74	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		3.74	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	RINL	Q6ZS11	566 aa		3.74	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	SMC5	Q8IY18	1101 aa		3.74	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	CHST13	Q8NET6	341 aa		3.74	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	RIN3	Q8TB24	985 aa		3.74	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		3.74	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	MORC4	Q8TE76	937 aa		3.74	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		3.74	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	MRFAP1L1	Q96HT8	127 aa		3.74	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	C1QTNF3	Q9BXJ4	246 aa		3.74	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	UACA	Q9BZF9	1416 aa		3.74	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	TMX1	Q9H3N1	280 aa		3.74	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		3.74	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	PCDHGB7	Q9Y5F8	929 aa		3.74	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		3.74	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		3.73	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		3.73	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	ABCA8	O94911	1581 aa		3.73	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		3.73	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	BPNT1	O95861	308 aa		3.73	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	IMPDH2	P12268	514 aa		3.73	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	CNR2	P34972	360 aa		3.73	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	RACK1	P63244	317 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	LMNB2	Q03252	620 aa		3.73	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	MLEC	Q14165	292 aa		3.73	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	GAB4	Q2WGN9	574 aa		3.73	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	LONRF3	Q496Y0	759 aa		3.73	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	TNNI3K	Q59H18	835 aa		3.73	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		3.73	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112		Q8N1X5	172 aa		3.73	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		3.73	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	NKD1	Q969G9	470 aa		3.73	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	3.73	□□□□□ -1.81	1e-11	■□□□□ 9.5
DDX17-208	ENST00000477112	SHISA4	Q96DD7	197 aa		3.73	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		3.73	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		3.73	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		3.73	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	CYP8B1	Q9UNU6	501 aa		3.73	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		3.73	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		3.73	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	PTPRM	P28827	1452 aa		3.73	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		3.72	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	KIF27	Q86VH2	1401 aa		3.72	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		3.72	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	FFAR3	O14843	346 aa		3.72	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	NME2	P22392	152 aa		3.72	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	TNNI2	P48788	182 aa		3.72	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	RING1	Q06587	406 aa		3.72	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	APOBR	Q0VD83	1088 aa		3.72	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	SLC14A2	Q15849	920 aa		3.72	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		3.72	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		3.72	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		3.72	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		3.72	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	SPRED1	Q7Z699	444 aa		3.72	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	CDH24	Q86UP0	819 aa		3.72	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		3.72	□□□□□ -1.81
DDX17-208	ENST00000477112	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		3.72	□□□□□ -1.81

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