RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463022.1

SP110-208, Transcript of SP110 nuclear body protein, human

TSL 2

Gene SP110, Length 405 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SP110-208	ENST00000463022	MFSD14C	Q5VZR4	134 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	CHST13	Q8NET6	341 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	TRIB2	Q92519	343 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	MAF1	Q9H063	256 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	RNF208	Q9H0X6	261 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	TNKS	O95271	1327 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022		B4E1Z4	1266 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	MSC	O60682	206 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	CDC45	O75419	566 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	SGPL1	O95470	568 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	ICAM1	P05362	532 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	PDHB	P11177	359 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	LSM11	P83369	360 aa	Known RBP eCLIP	5.05	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	ZNF543	Q08ER8	600 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	KCTD2	Q14681	263 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	SEC23A	Q15436	765 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	CCDC96	Q2M329	555 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	WDR78	Q5VTH9	848 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	PADI6	Q6TGC4	694 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	DPP9	Q86TI2	863 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	PNMA1	Q8ND90	353 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	NCOA7	Q8NI08	942 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	KIFC2	Q96AC6	838 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	MMP19	Q99542	508 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	5.05	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	KAT14	Q9H8E8	782 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	CENPF	P49454	3210 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	CEP290	O15078	2479 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	PFAS	O15067	1338 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	ZNF536	O15090	1300 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	ERICH2	A1L162	156 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	PPP1R3G	B7ZBB8	358 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022		E7EWF7	191 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	SMAP	O00193	183 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	COBL	O75128	1261 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	CYBA	P13498	195 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	NECTIN1	Q15223	517 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	CCL14	Q16627	93 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	RNF20	Q5VTR2	975 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	KCTD1	Q719H9	257 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	TMTC2	Q8N394	836 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	NLRP7	Q8WX94	980 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	SHISA4	Q96DD7	197 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	DDX11	Q96FC9	970 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	MAML3	Q96JK9	1138 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	PHOX2B	Q99453	314 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	MAP3K14	Q99558	947 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	ACAD9	Q9H845	621 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	VPS9D1	Q9Y2B5	631 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
SP110-208	ENST00000463022	SLC27A2	O14975	620 aa		5.03	□□□□□ -1.6

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