RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa4.53□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 PACS2Q86VP3 889 aa4.53□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 FERMT2Q96AC1 680 aa4.53□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 IDI2Q9BXS1 227 aa4.53□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 DNAJC18Q9H819 358 aa4.53□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 TUBE1Q9UJT0 475 aa4.53□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 PCDHA6Q9UN73 950 aa4.53□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa4.53□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 DLEC1Q9Y238 1755 aa4.53□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa4.53□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 KCNA3P22001 575 aa4.53□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 CDC25AP30304 524 aa4.53□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC16A2P36021 539 aa4.53□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 POSTNQ15063 836 aa4.53□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 CCDC96Q2M329 555 aa4.53□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 TTBK2Q6IQ55 1244 aa4.53□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 KCTD1Q719H9 257 aa4.53□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 RTKN2Q8IZC4 609 aa4.53□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC16A10Q8TF71 515 aa4.53□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 COA7Q96BR5 231 aa4.53□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 CCDC17Q96LX7 622 aa4.53□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 PRR14Q9BWN1 585 aa4.53□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 C6orf50Q9HD87 102 aa4.53□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 NRBP1Q9UHY1 535 aa4.53□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 A0A087X0B3 334 aa4.52□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 CLRN2A0PK11 232 aa4.52□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 TCP10L2B9ZVM9 353 aa4.52□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 PSMD14O00487 310 aa4.52□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 GDF11O95390 407 aa4.52□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 GNA11P29992 359 aa4.52□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 ASPRV1Q53RT3 343 aa4.52□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa4.52□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 GALNT17Q6IS24 598 aa4.52□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 THSD4Q6ZMP0 1018 aa4.52□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 CCDC186Q7Z3E2 898 aa4.52□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 PLA2G4DQ86XP0 818 aa4.52□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 STAMQ92783 540 aa4.52□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 ZMYND12Q9H0C1 365 aa4.52□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 EHD4Q9H223 541 aa4.52□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 RIOX1Q9H6W3 641 aa4.52□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa4.52□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 PLIN4Q96Q06 1357 aa4.52□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 SMTNL1A8MU46 457 aa4.52□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 M0R2N6 131 aa4.52□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 EEF2P13639 858 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 PTGS1P23219 599 aa4.52□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 SMARCA1P28370 1054 aa4.52□□□□□ -1.69
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LRRTM4-201ENST00000409088 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF543Q08ER8 600 aa4.52□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 SEPT2Q15019 361 aa4.52□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 IL17AQ16552 155 aa4.52□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 LETM2Q2VYF4 491 aa4.52□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 KANK3Q6NY19 840 aa4.52□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 OGFOD1Q8N543 542 aa4.52□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 DAGLBQ8NCG7 672 aa4.52□□□□□ -1.69
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LRRTM4-201ENST00000409088 SMARCE1Q969G3 411 aa4.52□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 CCDC34Q96HJ3 373 aa4.52□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 CSRNP1Q96S65 589 aa4.52□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM60Q9H2L4 133 aa4.52□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 MYO3BQ8WXR4 1341 aa4.52□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 SCN9AQ15858 1988 aa4.52□□□□□ -1.69
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LRRTM4-201ENST00000409088 SNHG28P0DPA3 235 aa4.52□□□□□ -1.69
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LRRTM4-201ENST00000409088 DLGAP5Q15398 846 aa4.52□□□□□ -1.69
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LRRTM4-201ENST00000409088 SARM1Q6SZW1 724 aa4.52□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 ADGRF4Q8IZF3 695 aa4.52□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 C4orf32Q8N8J7 132 aa4.52□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 KCNK17Q96T54 332 aa4.52□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 PSMD1Q99460 953 aa4.52□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 BPIFA3Q9BQP9 254 aa4.52□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 KANSL2Q9H9L4 492 aa4.52□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 JMJD4Q9H9V9 463 aa4.52□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 TMOD2Q9NZR1 351 aa4.52□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 MAN1B1Q9UKM7 699 aa4.52□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 HDAC9Q9UKV0 1011 aa4.52□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa4.51□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 C10orf71Q711Q0 1435 aa4.51□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 SOWAHBA6NEL2 793 aa4.51□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 USP17L10C9JJH3 530 aa4.51□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
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