RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361320.4

LRRTM3-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM3, Length 4,358 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM3-201ENST00000361320 RDXP35241 583 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 CAP2P40123 477 aa7.89□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 ADGRF4Q8IZF3 695 aa7.89□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 STAG2Q8N3U4 1231 aa7.89□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 RDH13Q8NBN7 331 aa7.89□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 USP28Q96RU2 1077 aa7.89□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 EXOC7Q9UPT5 735 aa7.89□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 PIK3C2AO00443 1686 aa7.89□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 IFT172Q9UG01 1749 aa7.89□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 ZNF609O15014 1411 aa7.89□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa7.89□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 IGSF3O75054 1194 aa7.89□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 ERLIN2O94905 339 aa7.89□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 DNA2P51530 1060 aa7.89□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 ARID5AQ03989 594 aa7.89□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 TXLNBQ8N3L3 684 aa7.89□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 ARID3AQ99856 593 aa7.89□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 APOL6Q9BWW8 343 aa7.89□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 DNAJC25Q9H1X3 360 aa7.89□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 FBXO28Q9NVF7 368 aa7.89□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 NWD1Q149M9 1564 aa7.88□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 KRT19P08727 400 aa7.88□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 FDX1P10109 184 aa7.88□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 FAM160A1Q05DH4 1040 aa7.88□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 CRY2Q49AN0 593 aa7.88□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa7.88□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 SBK1Q52WX2 424 aa7.88□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 ABI1Q8IZP0 508 aa7.88□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 MNS1Q8NEH6 495 aa7.88□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 OPTNQ96CV9 577 aa7.88□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 ATG4CQ96DT6 458 aa7.88□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 CEP170P1Q96L14 293 aa7.88□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 ADPGKQ9BRR6 497 aa7.88□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 WDR11Q9BZH6 1224 aa7.88□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 GJB4Q9NTQ9 266 aa7.88□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 USP25Q9UHP3 1055 aa7.88□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 KIAA1024Q9UPX6 916 aa7.88□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 KCNH4Q9UQ05 1017 aa7.88□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 GLTPD2A6NH11 291 aa7.88□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 hCG_1984214I3L0E3 225 aa7.88□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 EXOC3O60645 756 aa7.88□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 LPXNO60711 386 aa7.88□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa7.88□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 TRPC3Q13507 836 aa7.88□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 MTERF2Q49AM1 385 aa7.88□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 C16orf86Q6ZW13 317 aa7.88□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 PLCD3Q8N3E9 789 aa7.88□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa7.88□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 CDCA5Q96FF9 252 aa7.88□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 BLZF1Q9H2G9 400 aa7.88□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 NYAP2Q9P242 653 aa7.88□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 BRPF3Q9ULD4 1205 aa7.88□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 FAM205AQ6ZU69 1335 aa7.88□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 BICDL2A1A5D9 508 aa7.88□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 CDC25AP30304 524 aa7.88□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 SPDYE2Q495Y8 402 aa7.88□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 CHADLQ6NUI6 762 aa7.88□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa7.88□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 AMIGO3Q86WK7 504 aa7.88□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 CCDC102AQ96A19 550 aa7.88□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 NMRK2Q9NPI5 230 aa7.88□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa7.87□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 SPAG1Q07617 926 aa7.87□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 MTMR1Q13613 665 aa7.87□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 ANO6Q4KMQ2 910 aa7.87□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 CNNM4Q6P4Q7 775 aa7.87□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 TRPM4Q8TD43 1214 aa7.87□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 CPA4Q9UI42 421 aa7.87□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 PCDHA6Q9UN73 950 aa7.87□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa7.87□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 MEIS1O00470 390 aa7.87□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 YEATS4O95619 227 aa7.87□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 VIL1P09327 827 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 TTLL4Q14679 1199 aa7.87□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 FAM83AQ86UY5 434 aa7.87□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 FAM178BQ8IXR5 827 aa7.87□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 AOPEPQ8N6M6 819 aa7.87□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 RETREG2Q8NC44 543 aa7.87□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 GRPEL1Q9HAV7 217 aa7.87□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 LY9Q9HBG7 655 aa7.87□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 KNDC1Q76NI1 1749 aa7.87□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 ZNF202O95125 648 aa7.87□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.2 ms