RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329553.2

RIPPLY3-201, Transcript of ripply transcriptional repressor 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RIPPLY3, Length 2,235 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3-201ENST00000329553 UBE2SQ16763 222 aa23.01■■□□□ 1.27
RIPPLY3-201ENST00000329553 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
RIPPLY3-201ENST00000329553 KIAA1524Q8TCG1 905 aa23.01■■□□□ 1.27
RIPPLY3-201ENST00000329553 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
RIPPLY3-201ENST00000329553 PSTPIP2Q9H939 334 aa23.01■■□□□ 1.27
RIPPLY3-201ENST00000329553 GOPCQ9HD26 462 aa23.01■■□□□ 1.27
RIPPLY3-201ENST00000329553 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
RIPPLY3-201ENST00000329553 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
RIPPLY3-201ENST00000329553 CLK2P49760 499 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
RIPPLY3-201ENST00000329553 RBM10P98175 930 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
RIPPLY3-201ENST00000329553 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
RIPPLY3-201ENST00000329553 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
RIPPLY3-201ENST00000329553 CUL5Q93034 780 aa23.01■■□□□ 1.27
RIPPLY3-201ENST00000329553 PRIMPOLQ96LW4 560 aa23.01■■□□□ 1.27
RIPPLY3-201ENST00000329553 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
RIPPLY3-201ENST00000329553 IQCB1Q15051 598 aa23■■□□□ 1.27
RIPPLY3-201ENST00000329553 MYRIPQ8NFW9 859 aa23■■□□□ 1.27
RIPPLY3-201ENST00000329553 GPRC5DQ9NZD1 345 aa23■■□□□ 1.27
RIPPLY3-201ENST00000329553 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
RIPPLY3-201ENST00000329553 EDIL3O43854 480 aa23■■□□□ 1.27
RIPPLY3-201ENST00000329553 GPC2Q8N158 579 aa23■■□□□ 1.27
RIPPLY3-201ENST00000329553 DHX58Q96C10 678 aa23■■□□□ 1.27
RIPPLY3-201ENST00000329553 VCPKMTQ9H867 229 aa23■■□□□ 1.27
RIPPLY3-201ENST00000329553 NLRP12P59046 1061 aa22.99■■□□□ 1.27
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RIPPLY3-201ENST00000329553 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
RIPPLY3-201ENST00000329553 DPCR1Q3MIW9 517 aa22.99■■□□□ 1.27
RIPPLY3-201ENST00000329553 FAM83BQ5T0W9 1011 aa22.99■■□□□ 1.27
RIPPLY3-201ENST00000329553 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
RIPPLY3-201ENST00000329553 DTHD1Q6ZMT9 781 aa22.99■■□□□ 1.27
RIPPLY3-201ENST00000329553 SPC24Q8NBT2 197 aa22.99■■□□□ 1.27
RIPPLY3-201ENST00000329553 TRPM4Q8TD43 1214 aa22.99■■□□□ 1.27
RIPPLY3-201ENST00000329553 PRR12Q9ULL5 1215 aa22.99■■□□□ 1.27
RIPPLY3-201ENST00000329553 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa22.99■■□□□ 1.27
RIPPLY3-201ENST00000329553 LONP1P36776 959 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
RIPPLY3-201ENST00000329553 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa22.98■■□□□ 1.27
RIPPLY3-201ENST00000329553 ISM2Q6H9L7 571 aa22.98■■□□□ 1.27
RIPPLY3-201ENST00000329553 MAP7D2Q96T17 732 aa22.98■■□□□ 1.27
RIPPLY3-201ENST00000329553 SYT17Q9BSW7 474 aa22.98■■□□□ 1.27
RIPPLY3-201ENST00000329553 AMNQ9BXJ7 453 aa22.98■■□□□ 1.27
RIPPLY3-201ENST00000329553 SBF1O95248 1867 aa22.98■■□□□ 1.27
RIPPLY3-201ENST00000329553 LAD1O00515 517 aa22.98■■□□□ 1.27
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RIPPLY3-201ENST00000329553 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa22.98■■□□□ 1.27
RIPPLY3-201ENST00000329553 PRR29P0C7W0 189 aa22.97■■□□□ 1.27
RIPPLY3-201ENST00000329553 CDC25AP30304 524 aa22.97■■□□□ 1.27
RIPPLY3-201ENST00000329553 STAT2P52630 851 aa22.97■■□□□ 1.27
RIPPLY3-201ENST00000329553 POSTNQ15063 836 aa22.97■■□□□ 1.27
RIPPLY3-201ENST00000329553 FBXO11Q86XK2 927 aa22.97■■□□□ 1.27
RIPPLY3-201ENST00000329553 CEP57L1Q8IYX8 460 aa22.97■■□□□ 1.27
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RIPPLY3-201ENST00000329553 USP17L15C9J2P7 530 aa22.97■■□□□ 1.27
RIPPLY3-201ENST00000329553 USP17L13C9JLJ4 530 aa22.97■■□□□ 1.27
RIPPLY3-201ENST00000329553 USP17L11C9JVI0 530 aa22.97■■□□□ 1.27
RIPPLY3-201ENST00000329553 USP17L18D6R9N7 530 aa22.97■■□□□ 1.27
RIPPLY3-201ENST00000329553 USP17L22D6RA61 530 aa22.97■■□□□ 1.27
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RIPPLY3-201ENST00000329553 EPS15P42566 896 aa22.97■■□□□ 1.27
RIPPLY3-201ENST00000329553 USP17L24Q0WX57 530 aa22.97■■□□□ 1.27
RIPPLY3-201ENST00000329553 KANK3Q6NY19 840 aa22.97■■□□□ 1.27
RIPPLY3-201ENST00000329553 USP17L6PQ6QN14 398 aa22.97■■□□□ 1.27
RIPPLY3-201ENST00000329553 SH2D4AQ9H788 454 aa22.97■■□□□ 1.27
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RIPPLY3-201ENST00000329553 SLFN14P0C7P3 912 aa22.96■■□□□ 1.27
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RIPPLY3-201ENST00000329553 USH1GQ495M9 461 aa22.96■■□□□ 1.27
RIPPLY3-201ENST00000329553 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa22.96■■□□□ 1.27
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RIPPLY3-201ENST00000329553 GLT8D2Q9H1C3 349 aa22.96■■□□□ 1.27
RIPPLY3-201ENST00000329553 ATAD5Q96QE3 1844 aa22.96■■□□□ 1.27
RIPPLY3-201ENST00000329553 OR52Z1P0C646 297 aa22.95■■□□□ 1.26
RIPPLY3-201ENST00000329553 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP22.95■■□□□ 1.26
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RIPPLY3-201ENST00000329553 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
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RIPPLY3-201ENST00000329553 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
RIPPLY3-201ENST00000329553 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
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RIPPLY3-201ENST00000329553 ZNF75DP51815 510 aa22.94■■□□□ 1.26
RIPPLY3-201ENST00000329553 E2F4Q16254 413 aa22.94■■□□□ 1.26
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RIPPLY3-201ENST00000329553 PP2D1A8MPX8 630 aa22.93■■□□□ 1.26
RIPPLY3-201ENST00000329553 MEIS2O14770 477 aa22.93■■□□□ 1.26
RIPPLY3-201ENST00000329553 DDNO94850 711 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
RIPPLY3-201ENST00000329553 TDP2O95551 362 aa22.93■■□□□ 1.26
RIPPLY3-201ENST00000329553 INPP5BP32019 993 aa22.93■■□□□ 1.26
RIPPLY3-201ENST00000329553 POTEDQ86YR6 584 aa22.93■■□□□ 1.26
RIPPLY3-201ENST00000329553 CHURC1Q8WUH1 139 aa22.93■■□□□ 1.26
RIPPLY3-201ENST00000329553 BECN2A8MW95 431 aa22.93■■□□□ 1.26
RIPPLY3-201ENST00000329553 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP22.93■■□□□ 1.26
RIPPLY3-201ENST00000329553 PTGS1P23219 599 aa22.93■■□□□ 1.26
RIPPLY3-201ENST00000329553 AFMP43652 599 aa22.93■■□□□ 1.26
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