RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000322326.12

IFT20-201, Transcript of intraflagellar transport 20, humanhuman

TSL 2

Gene IFT20, Length 820 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT20-201ENST00000322326 TOP1P11387 765 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
IFT20-201ENST00000322326 ADCYAP1R1P41586 468 aa18.55■□□□□ 0.56
IFT20-201ENST00000322326 LRRC41Q15345 812 aa18.55■□□□□ 0.56
IFT20-201ENST00000322326 SHHQ15465 462 aa18.55■□□□□ 0.56
IFT20-201ENST00000322326 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa18.55■□□□□ 0.56
IFT20-201ENST00000322326 RCSD1Q6JBY9 416 aa18.55■□□□□ 0.56
IFT20-201ENST00000322326 CATIPQ7Z7H3 387 aa18.55■□□□□ 0.56
IFT20-201ENST00000322326 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
IFT20-201ENST00000322326 NYAP2Q9P242 653 aa18.55■□□□□ 0.56
IFT20-201ENST00000322326 NRBP1Q9UHY1 535 aa18.55■□□□□ 0.56
IFT20-201ENST00000322326 SLC12A7Q9Y666 1083 aa18.55■□□□□ 0.56
IFT20-201ENST00000322326 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
IFT20-201ENST00000322326 COL6A3P12111 3177 aa18.54■□□□□ 0.56
IFT20-201ENST00000322326 GOLGA8BA8MQT2 603 aa18.54■□□□□ 0.56
IFT20-201ENST00000322326 NOVP48745 357 aa18.54■□□□□ 0.56
IFT20-201ENST00000322326 EVCP57679 992 aa18.54■□□□□ 0.56
IFT20-201ENST00000322326 C1orf53Q5VUE5 145 aa18.54■□□□□ 0.56
IFT20-201ENST00000322326 APOA5Q6Q788 366 aa18.54■□□□□ 0.56
IFT20-201ENST00000322326 CLEC10AQ8IUN9 316 aa18.54■□□□□ 0.56
IFT20-201ENST00000322326 BADQ92934 168 aa18.54■□□□□ 0.56
IFT20-201ENST00000322326 FERMT2Q96AC1 680 aa18.54■□□□□ 0.56
IFT20-201ENST00000322326 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
IFT20-201ENST00000322326 PDLIM7Q9NR12 457 aa18.54■□□□□ 0.56
IFT20-201ENST00000322326 PARP14Q460N5 1801 aa18.53■□□□□ 0.56
IFT20-201ENST00000322326 DDAH1O94760 285 aa18.53■□□□□ 0.56
IFT20-201ENST00000322326 CALM1P0DP23 149 aa18.53■□□□□ 0.56
IFT20-201ENST00000322326 CALM2P0DP24 149 aa18.53■□□□□ 0.56
IFT20-201ENST00000322326 CALM3P0DP25 149 aa18.53■□□□□ 0.56
IFT20-201ENST00000322326 RARBP10826 455 aa18.53■□□□□ 0.56
IFT20-201ENST00000322326 RCAN1P53805 252 aa18.53■□□□□ 0.56
IFT20-201ENST00000322326 TMEM132BQ14DG7 1078 aa18.53■□□□□ 0.56
IFT20-201ENST00000322326 SIAH1Q8IUQ4 282 aa18.53■□□□□ 0.56
IFT20-201ENST00000322326 ZNF654Q8IZM8 581 aa18.53■□□□□ 0.56
IFT20-201ENST00000322326 PNMA1Q8ND90 353 aa18.53■□□□□ 0.56
IFT20-201ENST00000322326 CHMP4CQ96CF2 233 aa18.53■□□□□ 0.56
IFT20-201ENST00000322326 MMP19Q99542 508 aa18.53■□□□□ 0.56
IFT20-201ENST00000322326 TMEM47Q9BQJ4 181 aa18.53■□□□□ 0.56
IFT20-201ENST00000322326 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
IFT20-201ENST00000322326 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
IFT20-201ENST00000322326 SENP2Q9HC62 589 aa18.53■□□□□ 0.56
IFT20-201ENST00000322326 CLIP2Q9UDT6 1046 aa18.53■□□□□ 0.56
IFT20-201ENST00000322326 BRPF3Q9ULD4 1205 aa18.53■□□□□ 0.56
IFT20-201ENST00000322326 TPCN1Q9ULQ1 816 aa18.53■□□□□ 0.56
IFT20-201ENST00000322326 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa18.53■□□□□ 0.56
IFT20-201ENST00000322326 CUL9Q8IWT3 2517 aa18.53■□□□□ 0.56
IFT20-201ENST00000322326 ZBTB43O43298 467 aa18.52■□□□□ 0.56
IFT20-201ENST00000322326 EEF2P13639 858 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
IFT20-201ENST00000322326 KCTD2Q14681 263 aa18.52■□□□□ 0.56
IFT20-201ENST00000322326 C9orf50Q5SZB4 431 aa18.52■□□□□ 0.56
IFT20-201ENST00000322326 RNF180Q86T96 592 aa18.52■□□□□ 0.56
IFT20-201ENST00000322326 TMX3Q96JJ7 454 aa18.52■□□□□ 0.56
IFT20-201ENST00000322326 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
IFT20-201ENST00000322326 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa18.52■□□□□ 0.56
IFT20-201ENST00000322326 PHF24Q9UPV7 400 aa18.52■□□□□ 0.56
IFT20-201ENST00000322326 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
IFT20-201ENST00000322326 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
IFT20-201ENST00000322326 COPB2P35606 906 aa18.51■□□□□ 0.55
IFT20-201ENST00000322326 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
IFT20-201ENST00000322326 ME3Q16798 604 aa18.51■□□□□ 0.55
IFT20-201ENST00000322326 MICU3Q86XE3 530 aa18.51■□□□□ 0.55
IFT20-201ENST00000322326 RIOX2Q8IUF8 465 aa18.51■□□□□ 0.55
IFT20-201ENST00000322326 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
IFT20-201ENST00000322326 MKL1Q969V6 931 aa18.51■□□□□ 0.55
IFT20-201ENST00000322326 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
IFT20-201ENST00000322326 TINF2Q9BSI4 451 aa18.51■□□□□ 0.55
IFT20-201ENST00000322326 GOPCQ9HD26 462 aa18.51■□□□□ 0.55
IFT20-201ENST00000322326 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
IFT20-201ENST00000322326 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa18.51■□□□□ 0.55
IFT20-201ENST00000322326 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
IFT20-201ENST00000322326 SMCHD1A6NHR9 2005 aa18.5■□□□□ 0.55
IFT20-201ENST00000322326 TRIM43BA6NCK2 446 aa18.5■□□□□ 0.55
IFT20-201ENST00000322326 GOLGA8AA7E2F4 631 aa18.5■□□□□ 0.55
IFT20-201ENST00000322326 PFKFB2O60825 505 aa18.5■□□□□ 0.55
IFT20-201ENST00000322326 STAT3P40763 770 aa18.5■□□□□ 0.55
IFT20-201ENST00000322326 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP18.5■□□□□ 0.55
IFT20-201ENST00000322326 TLE2Q04725 743 aa18.5■□□□□ 0.55
IFT20-201ENST00000322326 STK3Q13188 491 aa18.5■□□□□ 0.55
IFT20-201ENST00000322326 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa18.5■□□□□ 0.55
IFT20-201ENST00000322326 NUP133Q8WUM0 1156 aa18.5■□□□□ 0.55
IFT20-201ENST00000322326 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
IFT20-201ENST00000322326 SEMA6BQ9H3T3 888 aa18.5■□□□□ 0.55
IFT20-201ENST00000322326 NID2Q14112 1375 aa18.5■□□□□ 0.55
IFT20-201ENST00000322326 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa18.5■□□□□ 0.55
IFT20-201ENST00000322326 RAD21O60216 631 aa18.49■□□□□ 0.55
IFT20-201ENST00000322326 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
IFT20-201ENST00000322326 LARGE1O95461 756 aa18.49■□□□□ 0.55
IFT20-201ENST00000322326 PGK2P07205 417 aa18.49■□□□□ 0.55
IFT20-201ENST00000322326 CLTBP09497 229 aa18.49■□□□□ 0.55
IFT20-201ENST00000322326 AKR1A1P14550 325 aa18.49■□□□□ 0.55
IFT20-201ENST00000322326 KIF5BP33176 963 aa18.49■□□□□ 0.55
IFT20-201ENST00000322326 PPP2R5BQ15173 497 aa18.49■□□□□ 0.55
IFT20-201ENST00000322326 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
IFT20-201ENST00000322326 GTF3C6Q969F1 213 aa18.49■□□□□ 0.55
IFT20-201ENST00000322326 MAP3K14Q99558 947 aa18.49■□□□□ 0.55
IFT20-201ENST00000322326 MYL10Q9BUA6 226 aa18.49■□□□□ 0.55
IFT20-201ENST00000322326 FBXO28Q9NVF7 368 aa18.49■□□□□ 0.55
IFT20-201ENST00000322326 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa18.49■□□□□ 0.55
IFT20-201ENST00000322326 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa18.48■□□□□ 0.55
IFT20-201ENST00000322326 VWA5AO00534 786 aa18.48■□□□□ 0.55
IFT20-201ENST00000322326 PGK1P00558 417 aa18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms