RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000314583.7

HCLS1-201, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HCLS1, Length 2,000 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-201ENST00000314583 KARSQ15046 597 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
HCLS1-201ENST00000314583 SPATA1Q5VX52 437 aa20.88■□□□□ 0.93
HCLS1-201ENST00000314583 RASSF8Q8NHQ8 419 aa20.88■□□□□ 0.93
HCLS1-201ENST00000314583 CNTNAP1P78357 1384 aa20.88■□□□□ 0.93
HCLS1-201ENST00000314583 ICA1Q05084 483 aa20.87■□□□□ 0.93
HCLS1-201ENST00000314583 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
HCLS1-201ENST00000314583 VSTM4Q8IW00 320 aa20.87■□□□□ 0.93
HCLS1-201ENST00000314583 OGFOD1Q8N543 542 aa20.87■□□□□ 0.93
HCLS1-201ENST00000314583 CUL5Q93034 780 aa20.87■□□□□ 0.93
HCLS1-201ENST00000314583 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
HCLS1-201ENST00000314583 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP20.87■□□□□ 0.93
HCLS1-201ENST00000314583 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
HCLS1-201ENST00000314583 ARID5BQ14865 1188 aa20.87■□□□□ 0.93
HCLS1-201ENST00000314583 ABCB5Q2M3G0 1257 aa20.87■□□□□ 0.93
HCLS1-201ENST00000314583 TTBK2Q6IQ55 1244 aa20.87■□□□□ 0.93
HCLS1-201ENST00000314583 FAM151AQ8WW52 585 aa20.87■□□□□ 0.93
HCLS1-201ENST00000314583 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa20.87■□□□□ 0.93
HCLS1-201ENST00000314583 CASP1P29466 404 aa20.86■□□□□ 0.93
HCLS1-201ENST00000314583 FKBP1CQ5VVH2 108 aa20.86■□□□□ 0.93
HCLS1-201ENST00000314583 SLFN13Q68D06 897 aa20.86■□□□□ 0.93
HCLS1-201ENST00000314583 KCTD1Q719H9 257 aa20.86■□□□□ 0.93
HCLS1-201ENST00000314583 SIAH1Q8IUQ4 282 aa20.86■□□□□ 0.93
HCLS1-201ENST00000314583 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
HCLS1-201ENST00000314583 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa20.86■□□□□ 0.93
HCLS1-201ENST00000314583 DPF2Q92785 391 aa20.86■□□□□ 0.93
HCLS1-201ENST00000314583 MTRQ99707 1265 aa20.86■□□□□ 0.93
HCLS1-201ENST00000314583 KCND1Q9NSA2 647 aa20.86■□□□□ 0.93
HCLS1-201ENST00000314583 TMEM260Q9NX78 707 aa20.86■□□□□ 0.93
HCLS1-201ENST00000314583 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
HCLS1-201ENST00000314583 LTBP3Q9NS15 1303 aa20.85■□□□□ 0.93
HCLS1-201ENST00000314583 CLRN2A0PK11 232 aa20.85■□□□□ 0.93
HCLS1-201ENST00000314583 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa20.85■□□□□ 0.93
HCLS1-201ENST00000314583 RPN1P04843 607 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
HCLS1-201ENST00000314583 SLC1A4P43007 532 aa20.85■□□□□ 0.93
HCLS1-201ENST00000314583 PTGER2P43116 358 aa20.85■□□□□ 0.93
HCLS1-201ENST00000314583 KCNJ6P48051 423 aa20.85■□□□□ 0.93
HCLS1-201ENST00000314583 CLK2P49760 499 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
HCLS1-201ENST00000314583 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
HCLS1-201ENST00000314583 CIAPIN1Q6FI81 312 aa20.85■□□□□ 0.93
HCLS1-201ENST00000314583 CABP7Q86V35 215 aa20.85■□□□□ 0.93
HCLS1-201ENST00000314583 TCP10L2B9ZVM9 353 aa20.85■□□□□ 0.93
HCLS1-201ENST00000314583 USP17L10C9JJH3 530 aa20.85■□□□□ 0.93
HCLS1-201ENST00000314583 SEPT2Q15019 361 aa20.85■□□□□ 0.93
HCLS1-201ENST00000314583 NAALADL2Q58DX5 795 aa20.85■□□□□ 0.93
HCLS1-201ENST00000314583 STAMQ92783 540 aa20.85■□□□□ 0.93
HCLS1-201ENST00000314583 MED15Q96RN5 788 aa20.85■□□□□ 0.93
HCLS1-201ENST00000314583 CSRNP1Q96S65 589 aa20.85■□□□□ 0.93
HCLS1-201ENST00000314583 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
HCLS1-201ENST00000314583 BLZF1Q9H2G9 400 aa20.85■□□□□ 0.93
HCLS1-201ENST00000314583 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
HCLS1-201ENST00000314583 CD44P16070 742 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
HCLS1-201ENST00000314583 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
HCLS1-201ENST00000314583 KCNB1Q14721 858 aa20.84■□□□□ 0.93
HCLS1-201ENST00000314583 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
HCLS1-201ENST00000314583 ARMCX5Q6P1M9 558 aa20.84■□□□□ 0.93
HCLS1-201ENST00000314583 CCDC112Q8NEF3 446 aa20.84■□□□□ 0.93
HCLS1-201ENST00000314583 CDC25AP30304 524 aa20.83■□□□□ 0.93
HCLS1-201ENST00000314583 SLC16A2P36021 539 aa20.83■□□□□ 0.93
HCLS1-201ENST00000314583 JAG1P78504 1218 aa20.83■□□□□ 0.93
HCLS1-201ENST00000314583 TMEM266Q2M3C6 531 aa20.83■□□□□ 0.93
HCLS1-201ENST00000314583 GMCL1Q96IK5 515 aa20.83■□□□□ 0.93
HCLS1-201ENST00000314583 KBTBD4Q9NVX7 518 aa20.83■□□□□ 0.93
HCLS1-201ENST00000314583 PP2D1A8MPX8 630 aa20.83■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP20.83■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 CALCRLQ16602 461 aa20.83■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 PPP4R3AQ6IN85 833 aa20.83■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 IGSF22Q8N9C0 903 aa20.83■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 MTMR9Q96QG7 549 aa20.83■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 CTAGE1Q96RT6 745 aa20.83■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 RAB34Q9BZG1 259 aa20.83■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 RWDD2AQ9UIY3 292 aa20.83■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 GDF11O95390 407 aa20.82■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 MCTP2Q6DN12 878 aa20.82■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 KLHL10Q6JEL2 608 aa20.82■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 POTEDQ86YR6 584 aa20.82■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 JDP2Q8WYK2 163 aa20.82■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP20.82■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 MYH7BA7E2Y1 1941 aa20.82■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 MMP14P50281 582 aa20.82■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 QRICH1Q2TAL8 776 aa20.82■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 CDKAL1Q5VV42 579 aa20.82■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 FAM83AQ86UY5 434 aa20.82■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 CALML4Q96GE6 196 aa20.82■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 PSTPIP2Q9H939 334 aa20.82■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 INTS13Q9NVM9 706 aa20.82■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 CTNND2Q9UQB3 1225 aa20.82■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 TNNI2P48788 182 aa20.81■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 PAK1Q13153 545 aa20.81■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 TNIP1Q15025 636 aa20.81■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 PGAP2Q9UHJ9 254 aa20.81■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 UQCRHLA0A096LP55 91 aa20.8■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 A0A1B0GTH6 734 aa20.8■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 F5H6K3 240 aa20.8■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 UQCRHP07919 91 aa20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.2 ms