RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253193.8

LRP3-201, Transcript of LDL receptor related protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP3, Length 3,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP3-201ENST00000253193 UBXN6Q9BZV1 441 aa20.61■□□□□ 0.89
LRP3-201ENST00000253193 HAUS4Q9H6D7 363 aa20.61■□□□□ 0.89
LRP3-201ENST00000253193 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa20.61■□□□□ 0.89
LRP3-201ENST00000253193 LRWD1Q9UFC0 647 aa20.61■□□□□ 0.89
LRP3-201ENST00000253193 FCER1AP12319 257 aa20.6■□□□□ 0.89
LRP3-201ENST00000253193 KLK7P49862 253 aa20.6■□□□□ 0.89
LRP3-201ENST00000253193 ARID5AQ03989 594 aa20.6■□□□□ 0.89
LRP3-201ENST00000253193 TUBB2AQ13885 445 aa20.6■□□□□ 0.89
LRP3-201ENST00000253193 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
LRP3-201ENST00000253193 C2CD5Q86YS7 1000 aa20.6■□□□□ 0.89
LRP3-201ENST00000253193 TUBB2BQ9BVA1 445 aa20.6■□□□□ 0.89
LRP3-201ENST00000253193 ADAM21Q9UKJ8 722 aa20.6■□□□□ 0.89
LRP3-201ENST00000253193 LGALS16A8MUM7 142 aa20.6■□□□□ 0.89
LRP3-201ENST00000253193 TULP2O00295 520 aa20.6■□□□□ 0.89
LRP3-201ENST00000253193 BTDP43251 543 aa20.6■□□□□ 0.89
LRP3-201ENST00000253193 TBCKQ8TEA7 893 aa20.6■□□□□ 0.89
LRP3-201ENST00000253193 ZSCAN26Q16670 478 aa20.6■□□□□ 0.89
LRP3-201ENST00000253193 KRT25Q7Z3Z0 450 aa20.6■□□□□ 0.89
LRP3-201ENST00000253193 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa20.6■□□□□ 0.89
LRP3-201ENST00000253193 EHBP1Q8NDI1 1231 aa20.6■□□□□ 0.89
LRP3-201ENST00000253193 TNFRSF25Q93038 417 aa20.6■□□□□ 0.89
LRP3-201ENST00000253193 PIGSQ96S52 555 aa20.6■□□□□ 0.89
LRP3-201ENST00000253193 IL17RBQ9NRM6 502 aa20.6■□□□□ 0.89
LRP3-201ENST00000253193 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
LRP3-201ENST00000253193 NEK8Q86SG6 692 aa20.59■□□□□ 0.89
LRP3-201ENST00000253193 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
LRP3-201ENST00000253193 RCSD1Q6JBY9 416 aa20.59■□□□□ 0.89
LRP3-201ENST00000253193 PLCD3Q8N3E9 789 aa20.59■□□□□ 0.89
LRP3-201ENST00000253193 P2RX5Q93086 422 aa20.59■□□□□ 0.89
LRP3-201ENST00000253193 TBC1D7Q9P0N9 293 aa20.59■□□□□ 0.89
LRP3-201ENST00000253193 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa20.59■□□□□ 0.89
LRP3-201ENST00000253193 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
LRP3-201ENST00000253193 MAP9Q49MG5 647 aa20.59■□□□□ 0.89
LRP3-201ENST00000253193 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
LRP3-201ENST00000253193 FAN1Q9Y2M0 1017 aa20.59■□□□□ 0.89
LRP3-201ENST00000253193 CCDC40Q4G0X9 1142 aa20.58■□□□□ 0.89
LRP3-201ENST00000253193 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
LRP3-201ENST00000253193 RIMBP2O15034 1052 aa20.58■□□□□ 0.89
LRP3-201ENST00000253193 C10orf67Q8IYJ2 551 aa20.58■□□□□ 0.89
LRP3-201ENST00000253193 CNBD1Q8NA66 436 aa20.58■□□□□ 0.89
LRP3-201ENST00000253193 COA7Q96BR5 231 aa20.58■□□□□ 0.89
LRP3-201ENST00000253193 RAB34Q9BZG1 259 aa20.58■□□□□ 0.89
LRP3-201ENST00000253193 NUP188Q5SRE5 1749 aa20.58■□□□□ 0.88
LRP3-201ENST00000253193 STK4Q13043 487 aa20.58■□□□□ 0.88
LRP3-201ENST00000253193 IKQ13123 557 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
LRP3-201ENST00000253193 CNNM4Q6P4Q7 775 aa20.58■□□□□ 0.88
LRP3-201ENST00000253193 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
LRP3-201ENST00000253193 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
LRP3-201ENST00000253193 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
LRP3-201ENST00000253193 AKAP11Q9UKA4 1901 aa20.58■□□□□ 0.88
LRP3-201ENST00000253193 ITIH6Q6UXX5 1313 aa20.58■□□□□ 0.88
LRP3-201ENST00000253193 LRRC41Q15345 812 aa20.57■□□□□ 0.88
LRP3-201ENST00000253193 CALCRLQ16602 461 aa20.57■□□□□ 0.88
LRP3-201ENST00000253193 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa20.57■□□□□ 0.88
LRP3-201ENST00000253193 BARHL2Q9NY43 387 aa20.57■□□□□ 0.88
LRP3-201ENST00000253193 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
LRP3-201ENST00000253193 CASP8Q14790 479 aa20.57■□□□□ 0.88
LRP3-201ENST00000253193 GRM4Q14833 912 aa20.57■□□□□ 0.88
LRP3-201ENST00000253193 KRT79Q5XKE5 535 aa20.57■□□□□ 0.88
LRP3-201ENST00000253193 ANKRD40Q6AI12 368 aa20.57■□□□□ 0.88
LRP3-201ENST00000253193 TMEM260Q9NX78 707 aa20.57■□□□□ 0.88
LRP3-201ENST00000253193 PBX1P40424 430 aa20.57■□□□□ 0.88
LRP3-201ENST00000253193 NFIXQ14938 502 aa20.57■□□□□ 0.88
LRP3-201ENST00000253193 RRAGAQ7L523 313 aa20.57■□□□□ 0.88
LRP3-201ENST00000253193 RUFY1Q96T51 708 aa20.57■□□□□ 0.88
LRP3-201ENST00000253193 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP20.57■□□□□ 0.88
LRP3-201ENST00000253193 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa20.57■□□□□ 0.88
LRP3-201ENST00000253193 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
LRP3-201ENST00000253193 MFSD14BQ5SR56 506 aa20.56■□□□□ 0.88
LRP3-201ENST00000253193 SLC51AQ86UW1 340 aa20.56■□□□□ 0.88
LRP3-201ENST00000253193 SNX29Q8TEQ0 813 aa20.56■□□□□ 0.88
LRP3-201ENST00000253193 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
LRP3-201ENST00000253193 THAP9Q9H5L6 903 aa20.56■□□□□ 0.88
LRP3-201ENST00000253193 MYO1AQ9UBC5 1043 aa20.56■□□□□ 0.88
LRP3-201ENST00000253193 MAD2L2Q9UI95 211 aa20.56■□□□□ 0.88
LRP3-201ENST00000253193 GLI3P10071 1580 aa20.56■□□□□ 0.88
LRP3-201ENST00000253193 SBK1Q52WX2 424 aa20.56■□□□□ 0.88
LRP3-201ENST00000253193 KRT26Q7Z3Y9 468 aa20.56■□□□□ 0.88
LRP3-201ENST00000253193 TSG101Q99816 390 aa20.56■□□□□ 0.88
LRP3-201ENST00000253193 NLRC4Q9NPP4 1024 aa20.56■□□□□ 0.88
LRP3-201ENST00000253193 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
LRP3-201ENST00000253193 NID2Q14112 1375 aa20.56■□□□□ 0.88
LRP3-201ENST00000253193 TACC1O75410 805 aa20.56■□□□□ 0.88
LRP3-201ENST00000253193 CCNE1P24864 410 aa20.56■□□□□ 0.88
LRP3-201ENST00000253193 CDK8P49336 464 aa20.56■□□□□ 0.88
LRP3-201ENST00000253193 TUBB4BP68371 445 aa20.56■□□□□ 0.88
LRP3-201ENST00000253193 FOXR1Q6PIV2 292 aa20.56■□□□□ 0.88
LRP3-201ENST00000253193 SH3GLB2Q9NR46 395 aa20.56■□□□□ 0.88
LRP3-201ENST00000253193 ANKRD65E5RJM6 399 aa20.55■□□□□ 0.88
LRP3-201ENST00000253193 IQCEQ6IPM2 695 aa20.55■□□□□ 0.88
LRP3-201ENST00000253193 PTF1AQ7RTS3 328 aa20.55■□□□□ 0.88
LRP3-201ENST00000253193 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
LRP3-201ENST00000253193 NUP58Q9BVL2 599 aa20.55■□□□□ 0.88
LRP3-201ENST00000253193 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
LRP3-201ENST00000253193 CYTH3O43739 400 aa20.55■□□□□ 0.88
LRP3-201ENST00000253193 CXCR5P32302 372 aa20.55■□□□□ 0.88
LRP3-201ENST00000253193 TRAPPC3LQ5T215 181 aa20.55■□□□□ 0.88
LRP3-201ENST00000253193 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
LRP3-201ENST00000253193 NARFQ9UHQ1 456 aa20.55■□□□□ 0.88
LRP3-201ENST00000253193 DUSP10Q9Y6W6 482 aa20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.1 ms