RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000057254.5

Ubqln3-201, Transcript of Ubiquilin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ubqln3, Length 2,376 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Tpm2P58774 284 aa9.96□□□□□ -0.81
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Mcm6P97311 821 aa9.96□□□□□ -0.81
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Tbx2Q60707 711 aa9.96□□□□□ -0.81
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Hoxa13Q62424 386 aa9.96□□□□□ -0.81
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Txndc16Q7TN22 820 aa9.96□□□□□ -0.81
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Galnt17Q7TT15 598 aa9.96□□□□□ -0.81
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Fermt2Q8CIB5 680 aa9.96□□□□□ -0.81
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Mss51Q9D5Z5 446 aa9.96□□□□□ -0.81
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Krt34Q9D646 392 aa9.96□□□□□ -0.81
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Herc3A6H6S0 1050 aa9.96□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Slc27a3O88561 667 aa9.96□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Sox5P35710 763 aa9.96□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Man1a2P39098 641 aa9.96□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Stat3P42227 770 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Krt87Q6IMF0 495 aa9.96□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Ccdc172Q810N9 267 aa9.96□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Scfd1Q8BRF7 639 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Fam161bQ8CB59 589 aa9.96□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Apol10aQ8CCA5 318 aa9.96□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Ppm1fQ8CGA0 452 aa9.96□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Frat2Q8K025 231 aa9.96□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Bhmt2Q91WS4 363 aa9.96□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Pcdha7Q91Y13 937 aa9.96□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 MymkQ9D1N4 221 aa9.96□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Desi2Q9D291 194 aa9.96□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Cul5Q9D5V5 780 aa9.96□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Itga2bQ9QUM0 1033 aa9.96□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Sorbs3Q9R1Z8 733 aa9.96□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 IkQ9Z1M8 557 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Dock2Q8C3J5 1828 aa9.96□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Ankrd35E9Q9D8 996 aa9.95□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Pak1O88643 545 aa9.95□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Nol4P60954 483 aa9.95□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Specc1lQ2KN98 1118 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Stxbp3Q60770 592 aa9.95□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Gm2163Q6PCY5 473 aa9.95□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Dnph1Q80VJ3 173 aa9.95□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Trim9Q8C7M3 817 aa9.95□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Depdc1aQ8CIG0 804 aa9.95□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Dnaaf4Q8R368 420 aa9.95□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Tc2nQ91XT6 489 aa9.95□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Kremen1Q99N43 473 aa9.95□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Slc5a5Q99PN0 618 aa9.95□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Taf1dQ9D4V4 322 aa9.95□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Vmn2r71L7N2D8 855 aa9.95□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 GmnnO88513 206 aa9.95□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 OatP29758 439 aa9.95□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Samsn1P57725 372 aa9.95□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Pcif1P59114 706 aa9.95□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Meis2P97367 477 aa9.95□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Siah1bQ06985 282 aa9.95□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 D630036H23RikQ3UQD6 204 aa9.95□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Foxn3Q499D0 457 aa9.95□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Nab2Q61127 525 aa9.95□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Asic1Q6NXK8 526 aa9.95□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Smarca1Q6PGB8 1046 aa9.95□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Ccdc122Q8BVN0 290 aa9.95□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Dennd2aQ8C4S8 1000 aa9.95□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Spire2Q8K1S6 718 aa9.95□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Arl6ip4Q9JM93 229 aa9.95□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Tspoap1Q7TNF8 1846 aa9.95□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 A0A1L1SQF0 893 aa9.94□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 GpiP06745 558 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Trim30aP15533 496 aa9.94□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Gucy2cQ3UWA6 1072 aa9.94□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Foxd1Q61345 456 aa9.94□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Panx2Q6IMP4 677 aa9.94□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Igdcc3Q8BQC3 813 aa9.94□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Riox2Q8CD15 465 aa9.94□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Tdrd3Q91W18 743 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Tgs1Q923W1 853 aa9.94□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Grpel1Q99LP6 217 aa9.94□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 4921524L21RikQ9D5T2 438 aa9.94□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 SelenooQ9DBC0 667 aa9.94□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Abcb6Q9DC29 842 aa9.94□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Pcdh11xF6ZNL5 1338 aa9.94□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Smchd1Q6P5D8 2007 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Prl2c3P04768 224 aa9.94□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Parp1P11103 1013 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Wdr70Q3TWF6 657 aa9.94□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Grik5Q61626 979 aa9.94□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Scaf8Q6DID3 1268 aa9.94□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Olfr832Q7TRG9 312 aa9.94□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Fbxo28Q8BIG4 368 aa9.94□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Rps6ka5Q8C050 863 aa9.94□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Ccdc38Q8CDN8 563 aa9.94□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Cacnb1Q8R3Z5 597 aa9.94□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Elf2Q9JHC9 593 aa9.94□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Scn3aA2ASI5 1947 aa9.93□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Ttc6G3UYY4 1857 aa9.93□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Zfand4D3Z3C6 739 aa9.93□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Surf1P09925 306 aa9.93□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Pbx1P41778 430 aa9.93□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Olfr121Q5CZY0 321 aa9.93□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Cyp4f39Q8BGU0 532 aa9.93□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Ano2Q8CFW1 1002 aa9.93□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Lrrc41Q8K1C9 807 aa9.93□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Dcaf8Q8N7N5 591 aa9.93□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Gys2Q8VCB3 704 aa9.93□□□□□ -0.82
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Ears2Q9CXJ1 523 aa9.93□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 34.5 ms