RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019749.3

Hoxd8-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd8, Length 2,634 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Bicdl2Q8CHW5 507 aa29.34■■■□□ 2.29
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 TicrrQ8BQ33 1889 aa29.33■■■□□ 2.29
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Meis3P97368 378 aa29.33■■■□□ 2.29
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fkbp3Q62446 224 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Jade2Q6ZQF7 829 aa29.33■■■□□ 2.29
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Map3k11Q80XI6 850 aa29.33■■■□□ 2.29
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Arhgef19Q8BWA8 802 aa29.33■■■□□ 2.29
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sash3Q8K352 380 aa29.33■■■□□ 2.29
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Eif2ak3Q9Z2B5 1114 aa29.33■■■□□ 2.29
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Nme9A0A1L1SUL6 329 aa29.33■■■□□ 2.29
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Kcnj11Q61743 390 aa29.33■■■□□ 2.29
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lca5Q80ST9 704 aa29.33■■■□□ 2.29
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tor1aip1Q921T2 595 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Vmn2r68L7N2B3 851 aa29.32■■■□□ 2.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sema3fO88632 785 aa29.32■■■□□ 2.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Map9Q3TRR0 646 aa29.32■■■□□ 2.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 LbrQ3U9G9 626 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Slc9a2Q3ZAS0 814 aa29.32■■■□□ 2.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lrrn2Q6PHP6 730 aa29.32■■■□□ 2.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Etnk2A7MCT6 385 aa29.32■■■□□ 2.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pabpc4Q6PHQ9 660 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cdan1Q8CC12 1239 aa29.32■■■□□ 2.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gtf2iQ9ESZ8 998 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Bpifb4A2BGH0 617 aa29.31■■■□□ 2.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fam186bD3Z420 943 aa29.31■■■□□ 2.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tmem35bQ3U0Y2 150 aa29.31■■■□□ 2.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Txnrd3Q99MD6 652 aa29.31■■■□□ 2.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ppp1r3gQ9CW07 347 aa29.31■■■□□ 2.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Efhd1Q9D4J1 240 aa29.31■■■□□ 2.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Grin3bQ91ZU9 1003 aa29.31■■■□□ 2.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Plcb1Q9Z1B3 1216 aa29.31■■■□□ 2.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Scgb2b11A0A087WR49 112 aa29.3■■■□□ 2.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 SarsP26638 512 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cct6aP80317 531 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Glg1Q61543 1175 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 MypopQ8R4U1 393 aa29.3■■■□□ 2.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 CpzQ8R4V4 654 aa29.3■■■□□ 2.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 St5Q924W7 1134 aa29.3■■■□□ 2.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Smc1aQ9CU62 1233 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Syce1Q9D495 329 aa29.3■■■□□ 2.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Atp6v0a2P15920 856 aa29.3■■■□□ 2.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Man1a2P39098 641 aa29.3■■■□□ 2.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gdf10P97737 476 aa29.3■■■□□ 2.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tmem232Q5K6N0 675 aa29.3■■■□□ 2.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mtmr4Q91XS1 1190 aa29.3■■■□□ 2.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Kctd10Q922M3 315 aa29.3■■■□□ 2.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Dbndd2Q9CRD4 158 aa29.3■■■□□ 2.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm5114W4VSN8 858 aa29.3■■■□□ 2.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 RaraP11416 462 aa29.29■■■□□ 2.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lrrc55Q3UY51 311 aa29.29■■■□□ 2.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cct6bQ61390 531 aa29.29■■■□□ 2.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Clca4aQ6Q473 924 aa29.29■■■□□ 2.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Bbs9Q811G0 885 aa29.29■■■□□ 2.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Hpcal4Q8BGZ1 191 aa29.29■■■□□ 2.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Terf1P70371 421 aa29.29■■■□□ 2.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Dok7Q18PE0 504 aa29.29■■■□□ 2.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lrrfip1Q3UZ39 729 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Dpp8Q80YA7 892 aa29.29■■■□□ 2.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cracr2bQ80ZJ8 394 aa29.29■■■□□ 2.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 GsdmeQ9Z2D3 512 aa29.29■■■□□ 2.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Kifc2O08672 792 aa29.28■■■□□ 2.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Islr2Q5RKR3 745 aa29.28■■■□□ 2.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Glra4Q61603 456 aa29.28■■■□□ 2.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mcm7Q61881 719 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ankrd13dQ6PD24 605 aa29.28■■■□□ 2.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mindy1Q76LS9 468 aa29.28■■■□□ 2.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Zfp781Q0P5U5 243 aa29.28■■■□□ 2.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Acot10Q32MW3 439 aa29.28■■■□□ 2.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ccdc172Q810N9 267 aa29.28■■■□□ 2.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lcmt1A0A0U1RNF2 332 aa29.27■■■□□ 2.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lrrc32G3XA59 663 aa29.27■■■□□ 2.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Eef2P58252 858 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tcp11Q01755 566 aa29.27■■■□□ 2.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Oxr1Q4KMM3 866 aa29.27■■■□□ 2.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tubb2aQ7TMM9 445 aa29.27■■■□□ 2.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 SltmQ8CH25 1031 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sumf1Q8R0F3 372 aa29.27■■■□□ 2.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Stap2Q8R0L1 411 aa29.27■■■□□ 2.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 HyiQ8R1F5 277 aa29.27■■■□□ 2.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Dnajc19Q9CQV7 116 aa29.27■■■□□ 2.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rhobtb3Q9CTN4 611 aa29.27■■■□□ 2.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tubb2bQ9CWF2 445 aa29.27■■■□□ 2.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 UncxO08934 530 aa29.27■■■□□ 2.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rtel1Q0VGM9 1203 aa29.27■■■□□ 2.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Znf280dQ68FE8 974 aa29.27■■■□□ 2.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Phf20l1Q8CCJ9 1013 aa29.27■■■□□ 2.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Atp1a1Q8VDN2 1023 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 AgtP11859 477 aa29.26■■■□□ 2.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Jakmip3Q5DTN8 844 aa29.26■■■□□ 2.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sertad1Q9JL10 236 aa29.26■■■□□ 2.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Msh3P13705 1091 aa29.26■■■□□ 2.27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Slc9b1Q8C0X2 565 aa29.26■■■□□ 2.27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Srgap2Q91Z67 1071 aa29.26■■■□□ 2.27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 NpcdF8VQB8 469 aa29.25■■■□□ 2.27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ctnna3Q65CL1 895 aa29.25■■■□□ 2.27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Card14Q99KF0 999 aa29.25■■■□□ 2.27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ubr3Q5U430 1889 aa29.25■■■□□ 2.27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 1700003F12RikA2AKE5 210 aa29.25■■■□□ 2.27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Chrna9G3X8Z7 479 aa29.25■■■□□ 2.27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pip4k2aO70172 405 aa29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 17.1 ms