RNA–Protein interactions for RNA: YPL079W

RPL21B, Transcript of Ribosomal 60S subunit protein L21B, yeast

Gene RPL21B, Length 483 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPL21B	YPL079W	SGT1	Q08446	395 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	YIG1	Q08956	461 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	PST1	Q12355	444 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	SEC39	Q12745	709 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	HEM2	P05373	342 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	SPT3	P06844	337 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	REV1	P12689	985 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	FUN30	P31380	1131 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	PEP12	P32854	288 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	STE5	P32917	917 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	SDH3	P33421	198 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	YBR259W	P38338	688 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	SAF1	P38352	637 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	SIC1	P38634	284 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	HEM14	P40012	539 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	GVP36	P40531	326 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	IRR1	P40541	1150 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	NUP85	P46673	744 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	MNT2	P53059	558 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	GET1	P53192	235 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	AAT1	Q01802	451 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	NHP10	Q03435	203 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	SPO71	Q03868	1245 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	HSP31	Q04432	237 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	YPR114W	Q06107	315 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	NUT2	Q06213	157 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	RAD34	Q06665	692 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	NKP1	Q12493	238 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	ARG3	P05150	338 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	HMG2	P12684	1045 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	UGA1	P17649	471 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	NGG1	P32494	702 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	FRE2	P36033	711 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	CAF4	P36130	643 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	SOL2	P37262	315 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	ROT2	P38138	954 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	IST2	P38250	946 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	DUN1	P39009	513 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	IAH1	P41734	238 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	IME4	P41833	600 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	FMP32	P43557	207 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	YGL176C	P46945	554 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	SIP4	P46954	829 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	YJR124C	P47159	448 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	HST3	P53687	447 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	PRM1	P53835	661 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	YNL033W	P53964	284 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	YNL019C	P53975	284 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	ORC3	P54790	616 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	TOF2	Q02208	771 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	REH1	Q06709	432 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	YOR342C	Q12182	319 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	ATG34	Q12292	412 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	SAS5	Q99314	248 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	TPK2	P06245	380 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	MSF1	P08425	469 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	SNF4	P12904	322 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	URA4	P20051	364 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	MNE1	P24720	663 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	CSM1	P25651	190 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	PHO91	P27514	894 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	BRF1	P29056	596 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	TIP20	P33891	701 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	MRPL17	P36528	281 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	PCL5	P38794	229 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	PEX28	P38848	579 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	CYC2	P38909	366 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	FAD1	P38913	306 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	IMA5	P40884	581 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	GCD10	P41814	478 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	MEP2	P41948	499 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	GLG2	P47011	380 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	BFA1	P47113	574 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	SHY1	P53266	389 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	GPI1	P53306	609 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	ECM9	Q02202	377 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPL21B	YPL079W	YKU80	Q04437	629 aa		5.05	□□□□□ -1.6

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