RNA–Protein interactions for RNA: YOR115C

TRS33, Transcript of Core component of transport protein particle (TRAPP) complexes I-III, yeast

Gene TRS33, Length 807 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRS33	YOR115C	KTR6	P54070	446 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
TRS33	YOR115C	ENA2	Q01896	1091 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	ARP9	Q05123	467 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	MLC2	Q06580	163 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	YDL121C	Q07541	149 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	SLD7	Q08457	257 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	NRT1	Q08485	598 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	DDC1	Q08949	612 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	YPR202W	Q08993	238 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	YOR022C	Q12204	715 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	LDB17	Q12342	491 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	ENA5	Q12691	1091 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	RTP1	Q12751	981 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	RGS2	Q99188	309 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	RIF1	P29539	1916 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	YAK1	P14680	807 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	GAC1	P28006	793 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	CSE2	P33308	149 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	NIC96	P34077	839 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	HES1	P35843	434 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	YKR051W	P36142	418 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	HOS4	P40480	1083 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	MAM33	P40513	266 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	MIG2	P53035	382 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	SPC105	P53148	917 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	BUD32	P53323	261 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.63	not detected
TRS33	YOR115C	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	RPM2	Q02773	1202 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	SPO19	Q03029	223 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	FAR10	Q06001	478 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	ENT4	Q07872	247 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	AAD15	Q08361	143 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	CIR2	Q08822	631 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	NKP1	Q12493	238 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	KCS1	Q12494	1050 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	TPK1	P06244	397 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	HSF1	P10961	833 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	SNA3	P14359	133 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
TRS33	YOR115C	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	MRPS28	P21771	286 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	SAN1	P22470	610 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	VPS3	P23643	1011 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	PHA2	P32452	334 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	CTP1	P38152	299 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	YBR053C	P38235	358 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	ATG12	P38316	186 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	YHI9	P38765	294 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	TVP23	P38962	199 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	FRT2	P39734	528 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	EMP65	P40085	556 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	GVP36	P40531	326 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	CDC1	P40986	491 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	GUF1	P46943	645 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	PEX31	P53203	462 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	RCF2	P53721	224 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	VPS9	P54787	451 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	STP1	Q00947	519 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	YMR155W	Q03795	547 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	GIS1	Q03833	894 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	ARA2	Q04212	335 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	HRD3	Q05787	833 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	CDC123	Q05791	360 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	BCP1	Q06338	283 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	AAD4	Q07747	329 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	MEU1	Q07938	337 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
TRS33	YOR115C	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	RUP1	Q12242	671 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	STE2	D6VTK4	431 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	YPR089W	O13585	888 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	not detected
TRS33	YOR115C	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	SPR1	P32603	445 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	PEX5	P35056	612 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	AST1	P35183	429 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	KDX1	P36005	433 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	PDX3	P38075	228 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	YBR056W	P38081	501 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	BZZ1	P38822	633 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	MEF2	P39677	819 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	YEL028W	P39989	153 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRS33	YOR115C	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63

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