RNA–Protein interactions for RNA: YOL073C

DSC2, Transcript of Multi-transmembrane subunit of the DSC ubiquitin ligase complex, yeast

Gene DSC2, Length 969 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSC2	YOL073C	YLR455W	Q06188	304 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DSC2	YOL073C	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DSC2	YOL073C	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	not detected
DSC2	YOL073C	RAD16	P31244	790 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DSC2	YOL073C	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DSC2	YOL073C	EXO84	P38261	753 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DSC2	YOL073C	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DSC2	YOL073C	SAD1	P43589	448 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DSC2	YOL073C	ASE1	P50275	885 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DSC2	YOL073C	SOL4	P53315	255 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DSC2	YOL073C	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DSC2	YOL073C	UBX4	P54730	416 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DSC2	YOL073C	CAC2	Q04199	468 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DSC2	YOL073C	ECI1	Q05871	280 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DSC2	YOL073C	BLS1	Q06071	122 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DSC2	YOL073C	CRN1	Q06440	651 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DSC2	YOL073C	GRS2	Q06817	618 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DSC2	YOL073C	POX1	P13711	748 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DSC2	YOL073C	PRE8	P23639	250 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DSC2	YOL073C	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DSC2	YOL073C	PES4	P39684	611 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DSC2	YOL073C	COG1	P53079	417 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DSC2	YOL073C	MRPL13	Q02204	264 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DSC2	YOL073C	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DSC2	YOL073C	YCL049C	P25577	312 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DSC2	YOL073C	MNN2	P38069	597 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DSC2	YOL073C	PCL6	P40038	420 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DSC2	YOL073C	SGM1	P47166	707 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DSC2	YOL073C	YNL234W	P53857	426 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DSC2	YOL073C	VPS72	Q03388	795 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DSC2	YOL073C	TMA16	Q08687	178 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DSC2	YOL073C	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DSC2	YOL073C	TY2A-F	P0CX61	438 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DSC2	YOL073C	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DSC2	YOL073C	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DSC2	YOL073C	TY2A-C	P25383	438 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DSC2	YOL073C	UTR4	P32626	227 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DSC2	YOL073C	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DSC2	YOL073C	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DSC2	YOL073C	YLR281C	Q05863	155 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DSC2	YOL073C	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DSC2	YOL073C	MCP2	Q06567	569 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DSC2	YOL073C	TY2A-B	Q12260	438 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DSC2	YOL073C	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DSC2	YOL073C	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DSC2	YOL073C	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DSC2	YOL073C	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DSC2	YOL073C	YFL068W	P0CX99	160 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DSC2	YOL073C	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DSC2	YOL073C	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DSC2	YOL073C	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
DSC2	YOL073C	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
DSC2	YOL073C	RAD24	P32641	659 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DSC2	YOL073C	TFC3	P34111	1160 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DSC2	YOL073C	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
DSC2	YOL073C	BET4	Q00618	327 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DSC2	YOL073C	SLD5	Q03406	294 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DSC2	YOL073C	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
DSC2	YOL073C	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
DSC2	YOL073C	ECM29	P38737	1868 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DSC2	YOL073C	RAP1	P11938	827 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DSC2	YOL073C	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
DSC2	YOL073C	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
DSC2	YOL073C	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
DSC2	YOL073C	SMK1	P41808	388 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DSC2	YOL073C	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
DSC2	YOL073C	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
DSC2	YOL073C	NCB2	Q92317	146 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DSC2	YOL073C	UBR2	Q07963	1872 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DSC2	YOL073C	PET111	P08468	800 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DSC2	YOL073C	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
DSC2	YOL073C	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
DSC2	YOL073C	CDC15	P27636	974 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DSC2	YOL073C	RKM3	P38222	552 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DSC2	YOL073C	PHO88	P38264	188 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
DSC2	YOL073C	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
DSC2	YOL073C	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
DSC2	YOL073C	MAF1	P41910	395 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DSC2	YOL073C	CTK2	P46962	323 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DSC2	YOL073C	YNL181W	P53878	407 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DSC2	YOL073C	FMP42	Q04991	504 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DSC2	YOL073C	ARP9	Q05123	467 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DSC2	YOL073C	SKG3	Q06315	1026 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DSC2	YOL073C	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
DSC2	YOL073C	NRT1	Q08485	598 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DSC2	YOL073C	PCD1	Q12524	340 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DSC2	YOL073C	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
DSC2	YOL073C	CUP1-1	P0CX80	61 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DSC2	YOL073C	CUP1-2	P0CX81	61 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DSC2	YOL073C	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
DSC2	YOL073C	STE50	P25344	346 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DSC2	YOL073C	GEX2	P36173	615 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DSC2	YOL073C	UME6	P39001	836 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DSC2	YOL073C	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
DSC2	YOL073C	AZR1	P50080	613 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DSC2	YOL073C	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
DSC2	YOL073C	ESBP6	P53918	673 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DSC2	YOL073C	ASI1	P54074	624 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DSC2	YOL073C	RSM28	Q03430	361 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DSC2	YOL073C	MMR1	Q06324	491 aa		4.81	□□□□□ -1.64

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