RNA–Protein interactions for RNA: YMR308C

PSE1, Transcript of Karyopherin/importin that interacts with the nuclear pore complex, yeast

Gene PSE1, Length 3,270 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PSE1	YMR308C	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	FMP42	Q04991	504 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	HUA2	Q12134	243 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	MCM16	Q12262	181 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	PCD1	Q12524	340 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	ADE6	P38972	1358 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	THO2	P53552	1597 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	CNB1	P25296	175 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	ADK2	P26364	225 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	COQ8	P27697	501 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	NDI1	P32340	513 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	YER121W	P40076	114 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	NMD5	P46970	1048 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	PAC10	P48363	199 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	MLH3	Q12083	715 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	HER1	Q12276	1246 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	YDL206W	Q12424	762 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	ISA2	Q12425	185 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	LDB19	Q12502	818 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	WIP1	Q2V2P8	89 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	RPO41	P13433	1351 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	COX6	P00427	148 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	COS2	P0CX12	379 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	COS3	P0CX13	379 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	TEC1	P18412	486 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	GEX1	P25596	615 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	MKK2	P32491	506 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	PDR3	P33200	976 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	OAF3	P36023	863 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	UBX7	P38349	436 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	CCT6	P39079	546 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	YEL068C	P39977	110 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	PRM2	P40534	656 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	YFL034W	P43564	1073 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	FMP33	P46998	180 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	LSM8	P47093	109 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	ARG7	Q04728	441 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	MFB1	Q04922	465 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	GRX6	Q12438	231 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	YMR085W	P0CF18	432 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	PPH22	P23595	377 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	TRK2	P28584	889 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	BUD17	P53727	317 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	VAC7	P53950	1165 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	ISU1	Q03020	165 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	YLR456W	Q06199	204 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	TOS4	Q06266	489 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	HAL9	Q12180	1030 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	ROM2	P51862	1356 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	NUP170	P38181	1502 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	DST1	P07273	309 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	CBS2	P14905	389 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	POL30	P15873	258 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	ADY2	P25613	283 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	GSH1	P32477	678 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	ALY1	P36117	915 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	AME1	P38313	324 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	FKH1	P40466	484 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	DOT5	P40553	215 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	MET28	P40573	187 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	PET130	P47065	347 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	RTA1	P53047	317 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	VOA1	P53262	265 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	PEX29	Q03370	554 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	SLD5	Q03406	294 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	ATG9	Q12142	997 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	OCA6	Q12454	224 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	YLR278C	Q05854	1341 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	SEM1	O94742	89 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	SRB2	P34162	210 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	RCR1	P38212	213 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	DUN1	P39009	513 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	SOK1	P40317	901 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	SIP4	P46954	829 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	YJL016W	P47072	561 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	AIM14	P53109	570 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	PKP2	P53170	491 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	VPS62	P53285	467 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	AIM32	Q04689	311 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PSE1	YMR308C	YLR413W	Q06689	675 aa		4.91	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.1 ms