RNA–Protein interactions for RNA: YKR088C

TVP38, Transcript of Integral membrane protein, yeast

Gene TVP38, Length 1,014 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TVP38	YKR088C	MAD3	P47074	515 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	NUP84	P52891	726 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	RTA1	P53047	317 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	TEP1	P53916	434 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	GUD1	Q07729	489 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	IMA2	Q08295	589 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	FLC1	Q08967	793 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	VIK1	Q12045	647 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	MSH5	Q12175	901 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	ECM3	Q99252	613 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	RAD18	P10862	487 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	ATR1	P13090	542 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	SEC63	P14906	663 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	NUP1	P20676	1076 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	SLY1	P22213	666 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	SAN1	P22470	610 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	TFC1	P32367	649 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	SPR1	P32603	445 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	NPL6	P32832	435 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	BCS1	P32839	456 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	BUD2	P33314	1104 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	TGL1	P34163	548 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	PDX3	P38075	228 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	SLM4	P38247	162 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	FLC2	P39719	783 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	SAW1	P39735	261 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	SCC4	P40090	624 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	KHA1	P40309	873 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	CAB2	P40506	365 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	FAR3	P46671	204 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	YGL108C	P53139	140 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	YTP1	P53584	459 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	ALG12	P53730	551 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	TMA20	P89886	181 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	FMP30	Q02883	468 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	TVP15	Q03860	143 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	ASA1	Q06822	443 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	MLH3	Q12083	715 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	IES3	Q12345	250 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	RIF1	P29539	1916 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	DIF1	O13577	133 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	CNA1	P23287	553 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	FUB1	P25659	250 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	MRP4	P32902	394 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	RIB7	P33312	244 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	NUF2	P33895	451 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	SWC5	P38326	303 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	LYS9	P38999	446 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	PEP8	P40335	379 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	SNL1	P40548	159 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	STB1	P42845	420 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	SNZ3	P43545	298 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	FMP32	P43557	207 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	LAM5	P43560	674 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	POL31	P46957	487 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	ZAP1	P47043	880 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	ORC5	P50874	479 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	RTT102	P53330	157 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	SNZ2	P53824	298 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	YKR005C	Q02203	525 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	NDL1	Q06568	189 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	IES4	Q08561	116 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	CIR2	Q08822	631 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	HRT3	Q12347	344 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	GPA2	P10823	449 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	KIN82	P25341	720 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	MEI4	P29467	408 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	TIM23	P32897	222 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	CYM1	P32898	989 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	ATO2	P32907	282 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	GMH1	P36125	273 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	STV1	P37296	890 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	YHR112C	P38716	378 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	CKB2	P38930	258 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	COG2	P53271	262 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TVP38	YKR088C	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 28.2 ms