RNA–Protein interactions for RNA: YKR065C

PAM17, Transcript of Constituent of the TIM23 complex, yeast

Gene PAM17, Length 594 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PAM17	YKR065C	CNS1	P33313	385 aa		7.46	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	CTP1	P38152	299 aa		7.46	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	YBR225W	P38321	900 aa		7.46	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	PCA1	P38360	1216 aa		7.46	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	PRM9	P39551	298 aa		7.46	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	PAC2	P39937	518 aa		7.46	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	YIL054W	P40524	105 aa		7.46	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	MPS3	P47069	682 aa		7.46	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	CWC22	P53333	577 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	SLG1	P54867	378 aa		7.46	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	GYL1	Q04322	720 aa		7.46	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	AIM32	Q04689	311 aa		7.46	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	THI7	Q05998	598 aa		7.46	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	VPS36	Q06696	566 aa		7.46	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	AAD4	Q07747	329 aa		7.46	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	ARP7	Q12406	477 aa		7.46	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	YLR422W	Q06409	1932 aa		7.45	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	NTH1	P32356	751 aa		7.45	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	ATG12	P38316	186 aa		7.45	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	AVT2	P39981	480 aa		7.45	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	TMA108	P40462	946 aa		7.45	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	BIT61	P47041	543 aa		7.45	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	HLJ1	P48353	224 aa		7.45	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	RPL22B	P56628	122 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	HRD3	Q05787	833 aa		7.45	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	GRX8	Q05926	109 aa		7.45	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	KAR3	P17119	729 aa		7.44	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	PEX34	P25584	144 aa		7.44	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	RAD16	P31244	790 aa		7.44	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	ECM13	P38195	257 aa		7.44	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	FUI1	P38196	639 aa		7.44	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	YIL077C	P40508	320 aa		7.44	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	RTT101	P47050	842 aa		7.44	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	RFX1	P48743	811 aa		7.44	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	YML6	P51998	286 aa		7.44	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	YNL040W	P53960	456 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	HER2	Q03557	464 aa		7.44	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	RIO1	Q12196	484 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	APE1	P14904	514 aa		7.43	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	KHA1	P40309	873 aa		7.43	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	RET2	P43621	546 aa		7.43	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	YJL132W	P47014	750 aa		7.43	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	YJR079W	P47126	109 aa		7.43	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	BRO1	P48582	844 aa		7.43	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	TOF2	Q02208	771 aa		7.43	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	VTI1	Q04338	217 aa		7.43	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	UFO1	Q04511	668 aa		7.43	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	ECI1	Q05871	280 aa		7.43	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	YFT2	Q06676	274 aa		7.43	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	AIM41	Q12032	185 aa		7.43	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	SLY1	P22213	666 aa		7.42	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	YIH1	P25637	258 aa		7.42	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	SGE1	P33335	543 aa		7.42	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	APL3	P38065	1025 aa		7.42	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	YBR056W	P38081	501 aa		7.42	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	MMS21	P38632	267 aa		7.42	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	SMF1	P38925	575 aa		7.42	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	TCB2	P48231	1178 aa		7.42	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	YMR210W	Q03649	449 aa		7.42	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	RRD2	Q12461	358 aa		7.42	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	YPR117W	Q06116	2489 aa		7.42	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	CDC8	P00572	216 aa		7.41	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	MEI4	P29467	408 aa		7.41	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	NFU1	P32860	256 aa		7.41	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	COS111	P38308	924 aa		7.41	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	END3	P39013	349 aa		7.41	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	MNN1	P39106	762 aa		7.41	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	ASG7	P46993	209 aa		7.41	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	KTR6	P54070	446 aa		7.41	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	VPS9	P54787	451 aa		7.41	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	DAP1	Q12091	152 aa		7.41	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	SEY1	Q99287	776 aa		7.41	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	SIF2	P38262	535 aa		7.4	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	CKB2	P38930	258 aa		7.4	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	YMR134W	P40207	237 aa		7.4	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	UFE1	P41834	346 aa		7.4	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
PAM17	YKR065C	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22

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