RNA–Protein interactions for RNA: YKL163W

PIR3, Transcript of O-glycosylated covalently-bound cell wall protein, yeast

Gene PIR3, Length 978 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PIR3	YKL163W	TCO89	Q08921	799 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PIR3	YKL163W	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
PIR3	YKL163W	TY2A-B	Q12260	438 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PIR3	YKL163W	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PIR3	YKL163W	PSY3	Q12318	242 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PIR3	YKL163W	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PIR3	YKL163W	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PIR3	YKL163W	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PIR3	YKL163W	AFI1	Q99222	893 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PIR3	YKL163W	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PIR3	YKL163W	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	ARG1	P22768	420 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	LTV1	P34078	463 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.21	□□□□□ -1.74	not detected
PIR3	YKL163W	HEL1	P36113	551 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	YEL057C	P39983	233 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	PKP1	P40530	394 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	NAS2	P40555	220 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	MET28	P40573	187 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	SSY5	P47002	699 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	ERG5	P54781	538 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	MUB1	Q03162	620 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	YML037C	Q03703	340 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	ROY1	Q04847	553 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	ADY4	Q05955	493 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	SGO1	Q08490	590 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	YRM1	Q12340	786 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	SEC12	P11655	471 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	ERG8	P24521	451 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	PHO91	P27514	894 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	YUH1	P35127	236 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	ALY1	P36117	915 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	MRPL40	P36534	297 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	YDR089W	P38966	869 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	PZF1	P39933	429 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	FET5	P43561	622 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	STU2	P46675	888 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	TCB2	P48231	1178 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	STB4	P50104	949 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	RPN14	P53196	417 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	YGR111W	P53265	400 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	VTC3	Q02725	835 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	MCP2	Q06567	569 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	PEX19	Q07418	342 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	VAM6	Q07468	1049 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	YEH1	Q07804	573 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	DCI1	Q08558	271 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	YDR524C-B	Q3E6R4	66 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	HMG2	P12684	1045 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	ERV1	P27882	189 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	SYN8	P31377	255 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	SRB2	P34162	210 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	APT2	P36973	181 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	UBP13	P38187	747 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	FMP10	P40098	244 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	SLZ1	P40167	298 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	SDP1	P40479	209 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	EPL1	P43572	832 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	SHE4	P51534	789 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	YNL144C	P53907	740 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	REC102	Q02721	264 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	MUK1	Q02866	612 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	KAP120	Q02932	1032 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	TMN2	Q04562	672 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	MMR1	Q06324	491 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	TMA16	Q08687	178 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	AIM41	Q12032	185 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	ATG29	Q12092	213 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	ALG7	P07286	448 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	GAL7	P08431	366 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	MER1	P16523	270 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	PET123	P17558	318 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	IME1	P21190	360 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	SEC15	P22224	910 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	CDC15	P27636	974 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	MRP4	P32902	394 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	SEF1	P34228	1148 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	COY1	P34237	679 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	PCH2	P38126	564 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	MAL33	P38157	468 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	MUP3	P38734	546 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	CTM1	P38818	585 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	JHD1	P40034	492 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PIR3	YKL163W	MRX1	P40050	688 aa		4.18	□□□□□ -1.74

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