RNA–Protein interactions for RNA: YKL049C

CSE4, Transcript of Centromere protein that resembles histone H3, yeast

Gene CSE4, Length 690 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CSE4	YKL049C	ROT2	P38138	954 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	YJL070C	P40361	888 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	AXL1	P40851	1208 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	LYS14	P40971	790 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	GUF1	P46943	645 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	CRZ1	P53968	678 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	MSS11	Q03825	758 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	SSK1	Q07084	712 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	TIP41	Q12199	356 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	PHO2	P07269	559 aa		2.96	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	PMS1	P14242	873 aa		2.96	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	TYR1	P20049	452 aa		2.96	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	SNC1	P31109	117 aa		2.96	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	ACH1	P32316	526 aa		2.96	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	RGT1	P32862	1170 aa		2.96	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	YKL100C	P34248	587 aa		2.96	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	2.96	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	YBL029W	P38201	376 aa		2.96	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	YEL068C	P39977	110 aa		2.96	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	YGR127W	P53275	312 aa		2.96	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	2.96	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	RSM23	Q01163	450 aa		2.96	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	YMR160W	Q03823	816 aa		2.96	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	FMP45	Q07651	309 aa		2.96	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	ARP6	Q12509	438 aa		2.96	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	2.95	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	CDC16	P09798	840 aa		2.95	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	YML002W	P0CF17	737 aa		2.95	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	KAR3	P17119	729 aa		2.95	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	YCK1	P23291	538 aa		2.95	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	2.95	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	IMG1	P25626	169 aa		2.95	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	YIH1	P25637	258 aa		2.95	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	SYN8	P31377	255 aa		2.95	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	NUP133	P36161	1157 aa		2.95	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	LAG1	P38703	411 aa		2.95	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	YER130C	P39959	443 aa		2.95	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	YJL068C	P40363	299 aa		2.95	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	PTR3	P43606	678 aa		2.95	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	FAR3	P46671	204 aa		2.95	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	EFM6	P53970	246 aa		2.95	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	YML037C	Q03703	340 aa		2.95	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	DAP1	Q12091	152 aa		2.95	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		2.94	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	POL4	P25615	582 aa		2.94	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	2.94	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	ICS2	P38284	255 aa		2.94	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	AFG3	P39925	761 aa		2.94	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	YGL082W	P53155	381 aa		2.94	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	YPL014W	Q02606	381 aa		2.94	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	RBA50	Q04418	439 aa		2.94	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	YKU80	Q04437	629 aa		2.94	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	RTT103	Q05543	409 aa		2.94	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	2.94	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	DIC1	Q06143	298 aa		2.94	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	2.94	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	YEH2	Q07950	538 aa		2.94	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	YPL272C	Q08984	517 aa		2.94	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		2.94	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	BOS1	P25385	244 aa		2.93	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	YTA12	P40341	825 aa		2.93	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	LCL3	P53153	274 aa		2.93	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	DUG3	P53871	357 aa		2.93	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	RHO4	Q00246	291 aa		2.93	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	HUA2	Q12134	243 aa		2.93	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	SPE4	Q12455	300 aa		2.93	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	YMR230W-A	Q3E7B5	62 aa		2.93	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	SEC62	P21825	274 aa		2.92	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	PAH1	P32567	862 aa		2.92	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	VPS17	P32913	551 aa		2.92	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	YBR144C	P34215	104 aa		2.92	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	ECM15	P35195	104 aa		2.92	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	UBP11	P36026	717 aa		2.92	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	VID27	P40157	782 aa		2.92	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	IKS1	P47042	667 aa		2.92	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	SAM50	P53969	484 aa		2.92	□□□□□ -1.94
CSE4	YKL049C	NGL3	Q03210	505 aa		2.92	□□□□□ -1.94

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