RNA–Protein interactions for RNA: YHR081W

LRP1, Transcript of Nuclear exosome-associated nucleic acid binding protein, yeast

Gene LRP1, Length 555 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LRP1	YHR081W	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	LCL3	P53153	274 aa		3.08	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	MEP3	P53390	489 aa		3.08	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	CRZ1	P53968	678 aa		3.08	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	RTT103	Q05543	409 aa		3.08	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	NBP2	Q12163	236 aa		3.08	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	ARG81	P05085	880 aa		3.07	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	KAR3	P17119	729 aa		3.07	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	VMA16	P23968	213 aa		3.07	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	ATS1	P31386	333 aa		3.07	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	RTS1	P38903	757 aa		3.07	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	KRE9	P39005	276 aa		3.07	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	YPL014W	Q02606	381 aa		3.07	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	MSS11	Q03825	758 aa		3.07	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	YMR087W	Q04299	284 aa		3.07	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	TCO89	Q08921	799 aa		3.07	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	RER1	P25560	188 aa		3.06	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	MIC60	P36112	540 aa		3.06	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	YJL068C	P40363	299 aa		3.06	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	BSC5	P53755	489 aa		3.06	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	SSK1	Q07084	712 aa		3.06	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	SKM1	Q12469	655 aa		3.06	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	POL4	P25615	582 aa		3.05	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	MCM10	P32354	571 aa		3.05	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	YEL068C	P39977	110 aa		3.05	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	NKP1	Q12493	238 aa		3.05	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	TYR1	P20049	452 aa		3.04	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	ADH7	P25377	361 aa		3.04	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	IKS1	P47042	667 aa		3.04	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	BUD32	P53323	261 aa		3.04	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	DUG3	P53871	357 aa		3.04	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	MSC1	Q03104	513 aa		3.04	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	YML037C	Q03703	340 aa		3.04	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	YMR160W	Q03823	816 aa		3.04	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	YMR018W	Q04364	514 aa		3.04	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	YPL272C	Q08984	517 aa		3.04	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	SPE4	Q12455	300 aa		3.04	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	YCK1	P23291	538 aa		3.03	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	CHS3	P29465	1165 aa		3.03	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	SNC1	P31109	117 aa		3.03	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	UBP11	P36026	717 aa		3.03	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	NUP133	P36161	1157 aa		3.03	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	AGP2	P38090	596 aa		3.03	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	LAG1	P38703	411 aa		3.03	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	EFM6	P53970	246 aa		3.03	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	NGL3	Q03210	505 aa		3.03	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	ARP6	Q12509	438 aa		3.03	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	SEC62	P21825	274 aa		3.02	□□□□□ -1.93
LRP1	YHR081W	PRE8	P23639	250 aa		3.02	□□□□□ -1.93
LRP1	YHR081W	IMG1	P25626	169 aa		3.02	□□□□□ -1.93
LRP1	YHR081W	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
LRP1	YHR081W	YKL100C	P34248	587 aa		3.02	□□□□□ -1.93
LRP1	YHR081W	ECM15	P35195	104 aa		3.02	□□□□□ -1.93
LRP1	YHR081W	VPS52	P39904	641 aa		3.02	□□□□□ -1.93
LRP1	YHR081W	AFG3	P39925	761 aa		3.02	□□□□□ -1.93
LRP1	YHR081W	PTR3	P43606	678 aa		3.02	□□□□□ -1.93
LRP1	YHR081W	SAM50	P53969	484 aa		3.02	□□□□□ -1.93
LRP1	YHR081W	YKU80	Q04437	629 aa		3.02	□□□□□ -1.93
LRP1	YHR081W	SCW10	Q04951	389 aa		3.02	□□□□□ -1.93
LRP1	YHR081W	THI20	Q08224	551 aa		3.02	□□□□□ -1.93
LRP1	YHR081W	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		3.02	□□□□□ -1.93
LRP1	YHR081W	SGS1	P35187	1447 aa		3.02	□□□□□ -1.93
LRP1	YHR081W	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
LRP1	YHR081W	CDC16	P09798	840 aa		3.01	□□□□□ -1.93
LRP1	YHR081W	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
LRP1	YHR081W	SSH4	P32343	579 aa		3.01	□□□□□ -1.93
LRP1	YHR081W	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
LRP1	YHR081W	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
LRP1	YHR081W	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
LRP1	YHR081W	SNG1	P46950	547 aa		3.01	□□□□□ -1.93
LRP1	YHR081W	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
LRP1	YHR081W	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
LRP1	YHR081W	RHO4	Q00246	291 aa		3.01	□□□□□ -1.93
LRP1	YHR081W	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
LRP1	YHR081W	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
LRP1	YHR081W	YDL057W	Q07379	328 aa		3.01	□□□□□ -1.93
LRP1	YHR081W	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
LRP1	YHR081W	YEH2	Q07950	538 aa		3.01	□□□□□ -1.93
LRP1	YHR081W	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		3.01	□□□□□ -1.93

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 90.2 ms