RNA–Protein interactions for RNA: YER113C

TMN3, Transcript of Protein with a role in cellular adhesion and filamentous growth, yeastyeast

Gene TMN3, Length 2,121 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TMN3YER113C PDE1P22434 369 aa2.48□□□□□ -2.01
TMN3YER113C DPB3P27344 201 aa2.48□□□□□ -2.01
TMN3YER113C NTH1P32356 751 aa2.48□□□□□ -2.01
TMN3YER113C YBL055CP34220 418 aaPredicted RBP2.48□□□□□ -2.01
TMN3YER113C ECM13P38195 257 aa2.48□□□□□ -2.01
TMN3YER113C YBR225WP38321 900 aa2.48□□□□□ -2.01
TMN3YER113C PCA1P38360 1216 aa2.48□□□□□ -2.01
TMN3YER113C ERP2P39704 215 aa2.48□□□□□ -2.01
TMN3YER113C LCP5P40079 357 aaPredicted RBP2.48□□□□□ -2.01
TMN3YER113C CDC1P40986 491 aa2.48□□□□□ -2.01
TMN3YER113C PXA1P41909 870 aa2.48□□□□□ -2.01
TMN3YER113C RNR4P49723 345 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
TMN3YER113C PEX31P53203 462 aa2.48□□□□□ -2.01
TMN3YER113C MAL13P53338 473 aa2.48□□□□□ -2.01
TMN3YER113C ATG4P53867 494 aa2.48□□□□□ -2.01
TMN3YER113C MTD1Q02046 320 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
TMN3YER113C GYL1Q04322 720 aa2.48□□□□□ -2.01
TMN3YER113C UFO1Q04511 668 aa2.48□□□□□ -2.01
TMN3YER113C RGC1Q06108 1083 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
TMN3YER113C KAP95Q06142 861 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
TMN3YER113C YPS7Q06325 596 aa2.48□□□□□ -2.01
TMN3YER113C TRE2Q08693 809 aa2.48□□□□□ -2.01
TMN3YER113C LCB4Q12246 624 aa2.48□□□□□ -2.01
TMN3YER113C THR1P17423 357 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
TMN3YER113C CAP1P28495 268 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
TMN3YER113C MMS21P38632 267 aa2.47□□□□□ -2.01
TMN3YER113C SMF1P38925 575 aa2.47□□□□□ -2.01
TMN3YER113C YJL206CP39529 758 aa2.47□□□□□ -2.01
TMN3YER113C AVT2P39981 480 aa2.47□□□□□ -2.01
TMN3YER113C KHA1P40309 873 aa2.47□□□□□ -2.01
TMN3YER113C ATF1P40353 525 aa2.47□□□□□ -2.01
TMN3YER113C YIL054WP40524 105 aa2.47□□□□□ -2.01
TMN3YER113C SAP185P40856 1058 aa2.47□□□□□ -2.01
TMN3YER113C RPC17P47076 161 aa2.47□□□□□ -2.01
TMN3YER113C RFX1P48743 811 aa2.47□□□□□ -2.01
TMN3YER113C NSE5Q03718 556 aa2.47□□□□□ -2.01
TMN3YER113C SND1Q04007 877 aa2.47□□□□□ -2.01
TMN3YER113C YMR114CQ04471 368 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
TMN3YER113C YDR278CQ05612 105 aa2.47□□□□□ -2.01
TMN3YER113C DAP1Q12091 152 aa2.47□□□□□ -2.01
TMN3YER113C MSL5Q12186 476 aaKnown RBP RIP-Chip data2.47□□□□□ -2.01not detected
TMN3YER113C NDJ1Q12366 352 aa2.47□□□□□ -2.01
TMN3YER113C RMP1Q12530 201 aa2.47□□□□□ -2.01
TMN3YER113C RPS21AP0C0V8 87 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
TMN3YER113C GLN4P13188 809 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
TMN3YER113C PEX34P25584 144 aa2.47□□□□□ -2.01
TMN3YER113C PAP1P29468 568 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
TMN3YER113C GCG1P32656 232 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
TMN3YER113C GLG1P36143 616 aa2.47□□□□□ -2.01
TMN3YER113C FUI1P38196 639 aa2.47□□□□□ -2.01
TMN3YER113C COS111P38308 924 aa2.47□□□□□ -2.01
TMN3YER113C YHR131CP38835 850 aa2.47□□□□□ -2.01
TMN3YER113C END3P39013 349 aa2.47□□□□□ -2.01
TMN3YER113C PRM9P39551 298 aa2.47□□□□□ -2.01
TMN3YER113C DUG1P43616 481 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
TMN3YER113C MPS3P47069 682 aa2.47□□□□□ -2.01
TMN3YER113C MRX6P48564 524 aa2.47□□□□□ -2.01
TMN3YER113C CWC22P53333 577 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
TMN3YER113C YNL040WP53960 456 aaPredicted RBP2.47□□□□□ -2.01
TMN3YER113C KTR6P54070 446 aa2.47□□□□□ -2.01
TMN3YER113C RPL22BP56628 122 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
TMN3YER113C MTG1Q03151 367 aaPredicted RBP2.47□□□□□ -2.01
TMN3YER113C VPS60Q03390 229 aa2.47□□□□□ -2.01
TMN3YER113C SPG3Q04398 127 aaPredicted RBP2.47□□□□□ -2.01
TMN3YER113C THI7Q05998 598 aa2.47□□□□□ -2.01
TMN3YER113C YSH1Q06224 779 aaPredicted RBP2.47□□□□□ -2.01
TMN3YER113C BSP1Q06604 576 aa2.47□□□□□ -2.01
TMN3YER113C STP4Q07351 490 aa2.47□□□□□ -2.01
TMN3YER113C YDL086WQ07505 273 aa2.47□□□□□ -2.01
TMN3YER113C AAD4Q07747 329 aa2.47□□□□□ -2.01
TMN3YER113C YPQ1Q12010 308 aa2.47□□□□□ -2.01
TMN3YER113C ARP7Q12406 477 aa2.47□□□□□ -2.01
TMN3YER113C IZH4Q99393 312 aa2.47□□□□□ -2.01
TMN3YER113C RAD10P06838 210 aa2.46□□□□□ -2.02
TMN3YER113C PPH22P23595 377 aa2.46□□□□□ -2.02
TMN3YER113C YIH1P25637 258 aa2.46□□□□□ -2.02
TMN3YER113C SEC6P32844 805 aa2.46□□□□□ -2.02
TMN3YER113C CNS1P33313 385 aa2.46□□□□□ -2.02
TMN3YER113C BYE1P36106 594 aa2.46□□□□□ -2.02
TMN3YER113C DUG2P38149 878 aa2.46□□□□□ -2.02
TMN3YER113C FAT1P38225 669 aa2.46□□□□□ -2.02
TMN3YER113C ATG12P38316 186 aa2.46□□□□□ -2.02
TMN3YER113C FSH1P38777 243 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
TMN3YER113C BUD8P41698 603 aa2.46□□□□□ -2.02
TMN3YER113C RTT101P47050 842 aa2.46□□□□□ -2.02
TMN3YER113C YJR079WP47126 109 aa2.46□□□□□ -2.02
TMN3YER113C TAF4P50105 388 aa2.46□□□□□ -2.02
TMN3YER113C YML6P51998 286 aa2.46□□□□□ -2.02
TMN3YER113C YGR151CP53287 111 aa2.46□□□□□ -2.02
TMN3YER113C COP1P53622 1201 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
TMN3YER113C ELP3Q02908 557 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
TMN3YER113C PIR3Q03180 325 aa2.46□□□□□ -2.02
TMN3YER113C URH1Q04179 340 aa2.46□□□□□ -2.02
TMN3YER113C VTI1Q04338 217 aa2.46□□□□□ -2.02
TMN3YER113C TDA9Q04545 1251 aa2.46□□□□□ -2.02
TMN3YER113C ECI1Q05871 280 aa2.46□□□□□ -2.02
TMN3YER113C GRX8Q05926 109 aa2.46□□□□□ -2.02
TMN3YER113C YFT2Q06676 274 aa2.46□□□□□ -2.02
TMN3YER113C AIM41Q12032 185 aa2.46□□□□□ -2.02
TMN3YER113C YDR018CQ12185 396 aa2.46□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 17.4 ms