RNA–Protein interactions for RNA: YDR093W

DNF2, Transcript of Aminophospholipid translocase (flippase), yeast

Gene DNF2, Length 4,839 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DNF2	YDR093W	YLR278C	Q05854	1341 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	RIM11	P38615	370 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	VPS29	P38759	282 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	IDS2	P46958	469 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	RTS3	P53289	263 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	PEX25	Q02969	394 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	BNA5	Q05979	453 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	YEH1	Q07804	573 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	FEX1	Q08913	375 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	VPS54	Q12071	889 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	PUT4	P15380	627 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	RAD57	P25301	460 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	CWH43	P25618	953 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	URK1	P27515	501 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	SBE22	P38814	852 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	DLD3	P39976	496 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	YJL068C	P40363	299 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	ASG1	P40467	964 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	PEX8	P53248	589 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	COQ6	P53318	479 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	GPI17	Q04080	534 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	SPE4	Q12455	300 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	SAS5	Q99314	248 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	YHR131C	P38835	850 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	YHR182W	P38870	785 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	PIK1	P39104	1066 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	FLC2	P39719	783 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	ARG2	P40360	574 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	MAD3	P47074	515 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	MRPL50	P53724	139 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	ASI1	P54074	624 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	SUC2	P00724	532 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	TPK1	P06244	397 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	OAR1	P35731	278 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	PPE1	P38796	400 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	FMP10	P40098	244 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	PHB1	P40961	287 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	IME4	P41833	600 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	SUM1	P46676	1062 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	COS1	P53822	381 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	RSC9	Q03124	581 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	APC4	Q04601	652 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	YDR338C	Q05497	695 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	ACM1	Q08981	209 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	SFG1	Q12507	346 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	ECM3	Q99252	613 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	FUI1	P38196	639 aa		4.84	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	YBL029W	P38201	376 aa		4.84	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	PHO89	P38361	574 aa		4.84	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	VPS52	P39904	641 aa		4.84	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	YPR003C	P53394	754 aa		4.84	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	BIO4	P53630	237 aa		4.84	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	VID22	Q05934	901 aa		4.84	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	YOR223W	Q12015	292 aa		4.84	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	YPR089W	O13585	888 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	NTG1	P31378	399 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	MDV1	P47025	714 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	MDE1	P47095	244 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	BOL2	P53082	120 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	ADA2	Q02336	434 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	ELP4	Q02884	456 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	YOR114W	Q12219	294 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	YDR061W	Q12298	539 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	UTP10	P42945	1769 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	REP1	P03871	373 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	NUP120	P35729	1037 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	THI6	P41835	540 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	SWP82	P43554	623 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	YDR018C	Q12185	396 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	NDJ1	Q12366	352 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	CIN8	P27895	1000 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	NTH1	P32356	751 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	ATP11	P32453	318 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	NIC96	P34077	839 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	RRN7	P40992	514 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	ASG7	P46993	209 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	HDA1	P53973	706 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64

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