RNA–Protein interactions for RNA: YBL018C

POP8, Transcript of Subunit of both RNase MRP and nuclear RNase P, yeast

Gene POP8, Length 402 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
POP8	YBL018C	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
POP8	YBL018C	PDR3	P33200	976 aa		4.22	□□□□□ -1.73
POP8	YBL018C	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
POP8	YBL018C	YPK3	P38070	525 aa		4.22	□□□□□ -1.73
POP8	YBL018C	YBR225W	P38321	900 aa		4.22	□□□□□ -1.73
POP8	YBL018C	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
POP8	YBL018C	EFM2	P38347	419 aa		4.22	□□□□□ -1.73
POP8	YBL018C	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
POP8	YBL018C	YNL234W	P53857	426 aa		4.22	□□□□□ -1.73
POP8	YBL018C	RSM23	Q01163	450 aa		4.22	□□□□□ -1.73
POP8	YBL018C	NUP100	Q02629	959 aa		4.22	□□□□□ -1.73
POP8	YBL018C	MSC1	Q03104	513 aa		4.22	□□□□□ -1.73
POP8	YBL018C	ECM30	Q06673	1274 aa		4.22	□□□□□ -1.73
POP8	YBL018C	SNA4	Q07549	140 aa		4.22	□□□□□ -1.73
POP8	YBL018C	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
POP8	YBL018C	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
POP8	YBL018C	RCN2	Q12044	265 aa		4.22	□□□□□ -1.73
POP8	YBL018C	SGS1	P35187	1447 aa		4.21	□□□□□ -1.73
POP8	YBL018C	SNF3	P10870	884 aa		4.21	□□□□□ -1.74
POP8	YBL018C	YCR043C	P25361	127 aa		4.21	□□□□□ -1.74
POP8	YBL018C	IMG1	P25626	169 aa		4.21	□□□□□ -1.74
POP8	YBL018C	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
POP8	YBL018C	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
POP8	YBL018C	AFG3	P39925	761 aa		4.21	□□□□□ -1.74
POP8	YBL018C	RGI2	P40188	164 aa		4.21	□□□□□ -1.74
POP8	YBL018C	RTS2	P40962	232 aa		4.21	□□□□□ -1.74
POP8	YBL018C	FET5	P43561	622 aa		4.21	□□□□□ -1.74
POP8	YBL018C	SOL4	P53315	255 aa		4.21	□□□□□ -1.74
POP8	YBL018C	BUD7	Q08754	746 aa		4.21	□□□□□ -1.74
POP8	YBL018C	GCN4	P03069	281 aa		4.2	□□□□□ -1.74
POP8	YBL018C	GID7	P25569	745 aa		4.2	□□□□□ -1.74
POP8	YBL018C	MGR1	P25573	417 aa		4.2	□□□□□ -1.74
POP8	YBL018C	YBR144C	P34215	104 aa		4.2	□□□□□ -1.74
POP8	YBL018C	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
POP8	YBL018C	YKL100C	P34248	587 aa		4.2	□□□□□ -1.74
POP8	YBL018C	NPR2	P39923	615 aa		4.2	□□□□□ -1.74
POP8	YBL018C	SNM1	P40993	198 aa		4.2	□□□□□ -1.74
POP8	YBL018C	IAH1	P41734	238 aa		4.2	□□□□□ -1.74
POP8	YBL018C	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
POP8	YBL018C	YGR127W	P53275	312 aa		4.2	□□□□□ -1.74
POP8	YBL018C	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
POP8	YBL018C	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
POP8	YBL018C	YMR254C	Q04838	102 aa		4.2	□□□□□ -1.74
POP8	YBL018C	MFB1	Q04922	465 aa		4.2	□□□□□ -1.74
POP8	YBL018C	SRL1	Q08673	210 aa		4.2	□□□□□ -1.74
POP8	YBL018C	RDR1	Q08904	546 aa		4.2	□□□□□ -1.74
POP8	YBL018C	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		4.2	□□□□□ -1.74
POP8	YBL018C	MRP13	P12686	339 aa		4.19	□□□□□ -1.74
POP8	YBL018C	CBS1	P14066	229 aa		4.19	□□□□□ -1.74
POP8	YBL018C	BOS1	P25385	244 aa		4.19	□□□□□ -1.74
POP8	YBL018C	ESL1	P40456	1118 aa		4.19	□□□□□ -1.74
POP8	YBL018C	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.19	□□□□□ -1.74	not detected
POP8	YBL018C	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
POP8	YBL018C	MAF1	P41910	395 aa		4.19	□□□□□ -1.74
POP8	YBL018C	PTR3	P43606	678 aa		4.19	□□□□□ -1.74
POP8	YBL018C	RSF1	Q05043	376 aa		4.19	□□□□□ -1.74
POP8	YBL018C	BSC1	Q12140	328 aa		4.19	□□□□□ -1.74
POP8	YBL018C	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
POP8	YBL018C	UBP11	P36026	717 aa		4.18	□□□□□ -1.74
POP8	YBL018C	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
POP8	YBL018C	SRO77	P38163	1010 aa		4.18	□□□□□ -1.74
POP8	YBL018C	REG2	P38232	338 aa		4.18	□□□□□ -1.74
POP8	YBL018C	MET30	P39014	640 aa		4.18	□□□□□ -1.74
POP8	YBL018C	NDE1	P40215	560 aa		4.18	□□□□□ -1.74
POP8	YBL018C	YIL169C	P40442	995 aa		4.18	□□□□□ -1.74
POP8	YBL018C	VID30	P53076	958 aa		4.18	□□□□□ -1.74
POP8	YBL018C	SMA1	Q02651	245 aa		4.18	□□□□□ -1.74
POP8	YBL018C	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
POP8	YBL018C	PEP3	P27801	918 aa		4.17	□□□□□ -1.74
POP8	YBL018C	SEF1	P34228	1148 aa		4.17	□□□□□ -1.74
POP8	YBL018C	ICS2	P38284	255 aa		4.17	□□□□□ -1.74
POP8	YBL018C	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
POP8	YBL018C	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
POP8	YBL018C	MRP7	P12687	371 aa		4.16	□□□□□ -1.74
POP8	YBL018C	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
POP8	YBL018C	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
POP8	YBL018C	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
POP8	YBL018C	PHD1	P36093	366 aa		4.16	□□□□□ -1.74
POP8	YBL018C	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
POP8	YBL018C	SPC34	P36131	295 aa		4.16	□□□□□ -1.74
POP8	YBL018C	ROT2	P38138	954 aa		4.16	□□□□□ -1.74
POP8	YBL018C	ERG7	P38604	731 aa		4.16	□□□□□ -1.74
POP8	YBL018C	LAG1	P38703	411 aa		4.16	□□□□□ -1.74
POP8	YBL018C	CIN4	P39110	191 aa		4.16	□□□□□ -1.74
POP8	YBL018C	YEL057C	P39983	233 aa		4.16	□□□□□ -1.74
POP8	YBL018C	YND1	P40009	630 aa		4.16	□□□□□ -1.74
POP8	YBL018C	ALG5	P40350	334 aa		4.16	□□□□□ -1.74
POP8	YBL018C	SPO22	P40511	975 aa		4.16	□□□□□ -1.74
POP8	YBL018C	YGR066C	P53242	292 aa		4.16	□□□□□ -1.74
POP8	YBL018C	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
POP8	YBL018C	IPI3	P53877	555 aa		4.16	□□□□□ -1.74
POP8	YBL018C	NUP53	Q03790	475 aa		4.16	□□□□□ -1.74
POP8	YBL018C	TDA9	Q04545	1251 aa		4.16	□□□□□ -1.74
POP8	YBL018C	YLR281C	Q05863	155 aa		4.16	□□□□□ -1.74
POP8	YBL018C	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	4.16	□□□□□ -1.74	not detected
POP8	YBL018C	RLM1	Q12224	676 aa		4.16	□□□□□ -1.74
POP8	YBL018C	INH1	P01097	85 aa		4.15	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.15	□□□□□ -1.75	not detected
POP8	YBL018C	HNM1	P19807	563 aa		4.15	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	ELO2	P25358	347 aa		4.15	□□□□□ -1.75

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