RNA–Protein interactions for RNA: Q0144

Q0144, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene Q0144, Length 330 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
Q0144	Q0144	CSM2	P40465	213 aa		4.1	□□□□□ -1.75
Q0144	Q0144	ZDS2	P54786	942 aa		4.1	□□□□□ -1.75
Q0144	Q0144	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
Q0144	Q0144	PUT2	P07275	575 aa		4.09	□□□□□ -1.75
Q0144	Q0144	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
Q0144	Q0144	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
Q0144	Q0144	WSC2	P53832	503 aa		4.09	□□□□□ -1.75
Q0144	Q0144	MET14	Q02196	202 aa		4.09	□□□□□ -1.75
Q0144	Q0144	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
Q0144	Q0144	ENT4	Q07872	247 aa		4.09	□□□□□ -1.75
Q0144	Q0144	YOR387C	Q08910	206 aa		4.09	□□□□□ -1.75
Q0144	Q0144	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
Q0144	Q0144	YER078W-A	Q3E7A2	54 aa		4.09	□□□□□ -1.75
Q0144	Q0144	ARG81	P05085	880 aa		4.08	□□□□□ -1.76
Q0144	Q0144	YME1	P32795	747 aa		4.08	□□□□□ -1.76
Q0144	Q0144	PRS1	P32895	427 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
Q0144	Q0144	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
Q0144	Q0144	YPL014W	Q02606	381 aa		4.08	□□□□□ -1.76
Q0144	Q0144	GLO2	Q05584	274 aa		4.08	□□□□□ -1.76
Q0144	Q0144	NKP1	Q12493	238 aa		4.08	□□□□□ -1.76
Q0144	Q0144	VCX1	Q99385	411 aa		4.08	□□□□□ -1.76
Q0144	Q0144	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
Q0144	Q0144	SPR1	P32603	445 aa		4.07	□□□□□ -1.76
Q0144	Q0144	PSF2	P40359	213 aa		4.07	□□□□□ -1.76
Q0144	Q0144	PCD1	Q12524	340 aa		4.07	□□□□□ -1.76
Q0144	Q0144	YOR019W	Q99248	730 aa		4.07	□□□□□ -1.76
Q0144	Q0144	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
Q0144	Q0144	DBP8	P38719	431 aa		4.06	□□□□□ -1.76
Q0144	Q0144	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
Q0144	Q0144	RHO4	Q00246	291 aa		4.06	□□□□□ -1.76
Q0144	Q0144	GAL1	P04385	528 aa		4.05	□□□□□ -1.76
Q0144	Q0144	NAM9	P27929	486 aa		4.05	□□□□□ -1.76
Q0144	Q0144	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
Q0144	Q0144	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
Q0144	Q0144	YGR210C	P42942	411 aa		4.05	□□□□□ -1.76
Q0144	Q0144	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
Q0144	Q0144	TIS11	P47977	285 aa		4.05	□□□□□ -1.76
Q0144	Q0144	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.04	□□□□□ -1.76	not detected
Q0144	Q0144	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
Q0144	Q0144	SHO1	P40073	367 aa		4.04	□□□□□ -1.76
Q0144	Q0144	ALG8	P40351	577 aa		4.04	□□□□□ -1.76
Q0144	Q0144	SGM1	P47166	707 aa		4.04	□□□□□ -1.76
Q0144	Q0144	YNR061C	P53747	219 aa		4.04	□□□□□ -1.76
Q0144	Q0144	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
Q0144	Q0144	APE1	P14904	514 aa		4.03	□□□□□ -1.76
Q0144	Q0144	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
Q0144	Q0144	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
Q0144	Q0144	YCL049C	P25577	312 aa		4.03	□□□□□ -1.76
Q0144	Q0144	YCR022C	P25620	114 aa		4.03	□□□□□ -1.76
Q0144	Q0144	YIM1	P28625	365 aa		4.03	□□□□□ -1.76
Q0144	Q0144	YBL059W	P34224	193 aa		4.03	□□□□□ -1.76
Q0144	Q0144	TSC10	P38342	320 aa		4.03	□□□□□ -1.76
Q0144	Q0144	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
Q0144	Q0144	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
Q0144	Q0144	INN1	P53901	409 aa		4.03	□□□□□ -1.76
Q0144	Q0144	YLR152C	P54072	576 aa		4.03	□□□□□ -1.76
Q0144	Q0144	SDH5	Q08230	162 aa		4.03	□□□□□ -1.76
Q0144	Q0144	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
Q0144	Q0144	YDL009C	Q12210	107 aa		4.03	□□□□□ -1.76
Q0144	Q0144	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
Q0144	Q0144	PTP2	P29461	750 aa		4.02	□□□□□ -1.77
Q0144	Q0144	CBF2	P32504	956 aa		4.02	□□□□□ -1.77
Q0144	Q0144	NDT80	P38830	627 aa		4.02	□□□□□ -1.77
Q0144	Q0144	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
Q0144	Q0144	PEX8	P53248	589 aa		4.02	□□□□□ -1.77
Q0144	Q0144	SYO1	Q07395	620 aa		4.02	□□□□□ -1.77
Q0144	Q0144	YBR085C-A	O43137	85 aa		4.01	□□□□□ -1.77
Q0144	Q0144	SUP35	P05453	685 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
Q0144	Q0144	ERG8	P24521	451 aa		4.01	□□□□□ -1.77
Q0144	Q0144	IME4	P41833	600 aa		4.01	□□□□□ -1.77
Q0144	Q0144	REG1	Q00816	1014 aa		4.01	□□□□□ -1.77
Q0144	Q0144	RAD16	P31244	790 aa		4	□□□□□ -1.77
Q0144	Q0144	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
Q0144	Q0144	ECM30	Q06673	1274 aa		4	□□□□□ -1.77
Q0144	Q0144	PSK2	Q08217	1101 aa		4	□□□□□ -1.77
Q0144	Q0144	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
Q0144	Q0144	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
Q0144	Q0144	VPS4	P52917	437 aa		3.98	□□□□□ -1.77
Q0144	Q0144	RSM23	Q01163	450 aa		3.98	□□□□□ -1.77
Q0144	Q0144	NUS1	Q12063	375 aa		3.98	□□□□□ -1.77
Q0144	Q0144	CTF3	Q12748	733 aa		3.98	□□□□□ -1.77
Q0144	Q0144	HHF1	P02309	103 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
Q0144	Q0144	NUC1	P08466	329 aa		3.97	□□□□□ -1.77
Q0144	Q0144	PHO81	P17442	1178 aa		3.97	□□□□□ -1.77
Q0144	Q0144	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
Q0144	Q0144	ELO1	P39540	310 aa		3.97	□□□□□ -1.77
Q0144	Q0144	BUR6	P40096	142 aa		3.97	□□□□□ -1.77
Q0144	Q0144	BNA5	Q05979	453 aa		3.97	□□□□□ -1.77
Q0144	Q0144	HRT3	Q12347	344 aa		3.97	□□□□□ -1.77
Q0144	Q0144	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
Q0144	Q0144	YHL041W	P38730	149 aa		3.96	□□□□□ -1.78
Q0144	Q0144	FMP10	P40098	244 aa		3.96	□□□□□ -1.78
Q0144	Q0144	ALT2	P52892	507 aa		3.96	□□□□□ -1.78
Q0144	Q0144	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
Q0144	Q0144	INA17	Q02888	182 aa		3.96	□□□□□ -1.78
Q0144	Q0144	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
Q0144	Q0144	RRN11	Q04712	507 aa		3.96	□□□□□ -1.78
Q0144	Q0144	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	3.96	□□□□□ -1.78
Q0144	Q0144	TMS1	Q12116	473 aa		3.96	□□□□□ -1.78
Q0144	Q0144	ERV2	Q12284	196 aa		3.96	□□□□□ -1.78

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 21.2 ms