RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 KCNA10Q16322 511 aa28.55■■■□□ 2.16
CAPNS1-216ENST00000628306 OSBP2Q969R2 916 aa28.55■■■□□ 2.16
CAPNS1-216ENST00000628306 EVI5LQ96CN4 794 aa28.55■■■□□ 2.16
CAPNS1-216ENST00000628306 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
CAPNS1-216ENST00000628306 STARD7Q9NQZ5 370 aa28.55■■■□□ 2.16
CAPNS1-216ENST00000628306 MOXD2PA6NHM9 499 aa28.54■■■□□ 2.16
CAPNS1-216ENST00000628306 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa28.54■■■□□ 2.16
CAPNS1-216ENST00000628306 FOSL2P15408 326 aa28.54■■■□□ 2.16
CAPNS1-216ENST00000628306 CST5P28325 142 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
CAPNS1-216ENST00000628306 CDK7P50613 346 aa28.54■■■□□ 2.16
CAPNS1-216ENST00000628306 GRIN2CQ14957 1233 aa28.54■■■□□ 2.16
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
CAPNS1-216ENST00000628306 CHD7Q9P2D1 2997 aa28.54■■■□□ 2.16
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM184BQ9ULE4 1060 aa28.54■■■□□ 2.16
CAPNS1-216ENST00000628306 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-216ENST00000628306 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-216ENST00000628306 GIMAP6Q6P9H5 292 aa28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-216ENST00000628306 C16orf59Q7L2K0 433 aa28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-216ENST00000628306 STK11IPQ8N1F8 1099 aa28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-216ENST00000628306 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-216ENST00000628306 CHMLP26374 656 aa28.52■■■□□ 2.16
CAPNS1-216ENST00000628306 RBM25P49756 843 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
CAPNS1-216ENST00000628306 USP38Q8NB14 1042 aa28.52■■■□□ 2.16
CAPNS1-216ENST00000628306 KATNBL1Q9H079 304 aa28.52■■■□□ 2.16
CAPNS1-216ENST00000628306 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa28.52■■■□□ 2.16
CAPNS1-216ENST00000628306 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
CAPNS1-216ENST00000628306 MYH4Q9Y623 1939 aa28.52■■■□□ 2.16
CAPNS1-216ENST00000628306 CTAGE5O15320 804 aa28.51■■■□□ 2.16
CAPNS1-216ENST00000628306 TIMP1P01033 207 aa28.51■■■□□ 2.16
CAPNS1-216ENST00000628306 DNAJB2P25686 324 aa28.51■■■□□ 2.16
CAPNS1-216ENST00000628306 NUP133Q8WUM0 1156 aa28.51■■■□□ 2.16
CAPNS1-216ENST00000628306 MKL1Q969V6 931 aa28.51■■■□□ 2.16
CAPNS1-216ENST00000628306 RILPL2Q969X0 211 aa28.51■■■□□ 2.16
CAPNS1-216ENST00000628306 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP28.51■■■□□ 2.164e-6■□□□□ 9.2
CAPNS1-216ENST00000628306 C22orf23Q9BZE7 217 aa28.51■■■□□ 2.16
CAPNS1-216ENST00000628306 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.16
CAPNS1-216ENST00000628306 DCDC2CA8MYV0 355 aa28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-216ENST00000628306 REC8O95072 547 aa28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-216ENST00000628306 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-216ENST00000628306 ACVR2BQ13705 512 aa28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-216ENST00000628306 RASIP1Q5U651 963 aa28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-216ENST00000628306 CPXCR1Q8N123 301 aa28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-216ENST00000628306 DDX11Q96FC9 970 aa28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-216ENST00000628306 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-216ENST00000628306 CLIP2Q9UDT6 1046 aa28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-216ENST00000628306 ELP1O95163 1332 aa28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-216ENST00000628306 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-216ENST00000628306 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-216ENST00000628306 HIP1O00291 1037 aa28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-216ENST00000628306 KBTBD3Q8NAB2 608 aa28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-216ENST00000628306 GJA9P57773 515 aa28.49■■■□□ 2.15
CAPNS1-216ENST00000628306 MFSD5Q6N075 450 aa28.49■■■□□ 2.15
CAPNS1-216ENST00000628306 CEP95Q96GE4 821 aa28.49■■■□□ 2.15
CAPNS1-216ENST00000628306 MKNK2Q9HBH9 465 aa28.49■■■□□ 2.15
CAPNS1-216ENST00000628306 MINDY4BA8MYZ0 360 aa28.48■■■□□ 2.15
CAPNS1-216ENST00000628306 ASGR1P07306 291 aa28.48■■■□□ 2.15
CAPNS1-216ENST00000628306 NKX3-2P78367 333 aa28.48■■■□□ 2.15
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC144BQ3MJ40 725 aa28.48■■■□□ 2.15
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM240Q5SV17 173 aa28.48■■■□□ 2.15
CAPNS1-216ENST00000628306 APPBP2Q92624 585 aa28.48■■■□□ 2.15
CAPNS1-216ENST00000628306 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
CAPNS1-216ENST00000628306 MTMR4Q9NYA4 1195 aa28.48■■■□□ 2.15
CAPNS1-216ENST00000628306 PRDM1O75626 825 aa28.47■■■□□ 2.15
CAPNS1-216ENST00000628306 KIFC2Q96AC6 838 aa28.47■■■□□ 2.15
CAPNS1-216ENST00000628306 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa28.47■■■□□ 2.15
CAPNS1-216ENST00000628306 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa28.47■■■□□ 2.15
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF576Q9H609 170 aa28.47■■■□□ 2.15
CAPNS1-216ENST00000628306 PLIN4Q96Q06 1357 aa28.46■■■□□ 2.15
CAPNS1-216ENST00000628306 M0R2C6 588 aa28.46■■■□□ 2.15
CAPNS1-216ENST00000628306 GPAA1O43292 621 aa28.46■■■□□ 2.15
CAPNS1-216ENST00000628306 ZBED4O75132 1171 aa28.46■■■□□ 2.15
CAPNS1-216ENST00000628306 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
CAPNS1-216ENST00000628306 ARMCX2Q7L311 632 aa28.46■■■□□ 2.15
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM126BQ8IXS8 530 aa28.46■■■□□ 2.15
CAPNS1-216ENST00000628306 GLT1D1Q96MS3 346 aa28.46■■■□□ 2.15
CAPNS1-216ENST00000628306 REV3LO60673 3130 aa28.46■■■□□ 2.15
CAPNS1-216ENST00000628306 ARVCFO00192 962 aa28.45■■■□□ 2.14
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC4A3P48751 1232 aa28.45■■■□□ 2.14
CAPNS1-216ENST00000628306 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
CAPNS1-216ENST00000628306 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa28.45■■■□□ 2.14
CAPNS1-216ENST00000628306 CHST13Q8NET6 341 aa28.45■■■□□ 2.14
CAPNS1-216ENST00000628306 FEM1BQ9UK73 627 aa28.45■■■□□ 2.14
CAPNS1-216ENST00000628306 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa28.45■■■□□ 2.14
CAPNS1-216ENST00000628306 ASTN1O14525 1302 aa28.45■■■□□ 2.14
CAPNS1-216ENST00000628306 GRXCR1A8MXD5 290 aa28.44■■■□□ 2.14
CAPNS1-216ENST00000628306 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
CAPNS1-216ENST00000628306 PBX2P40425 430 aa28.44■■■□□ 2.14
CAPNS1-216ENST00000628306 OAZ1P54368 228 aa28.44■■■□□ 2.14
CAPNS1-216ENST00000628306 CNTN2Q02246 1040 aa28.44■■■□□ 2.14
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa28.44■■■□□ 2.14
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM133AQ8N9E0 248 aa28.44■■■□□ 2.14
CAPNS1-216ENST00000628306 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
CAPNS1-216ENST00000628306 RUFY2Q8WXA3 655 aa28.44■■■□□ 2.14
CAPNS1-216ENST00000628306 TIFAQ96CG3 184 aa28.44■■■□□ 2.14
CAPNS1-216ENST00000628306 USP26Q9BXU7 913 aa28.44■■■□□ 2.14
CAPNS1-216ENST00000628306 MROH7Q68CQ1 1323 aa28.44■■■□□ 2.14
CAPNS1-216ENST00000628306 CD4P01730 458 aa28.43■■■□□ 2.14
CAPNS1-216ENST00000628306 CSF2RAP15509 400 aa28.43■■■□□ 2.14
CAPNS1-216ENST00000628306 ANKRD35Q8N283 1001 aa28.43■■■□□ 2.14
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