RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590694.5

NEDD4L-231, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 5

Gene NEDD4L, Length 165 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-231	ENST00000590694	SHISA3	A0PJX4	238 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694		H0Y8X5	98 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	MEIS1	O00470	390 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	PLD2	O14939	933 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	RFPL3	O75679	317 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	F13B	P05160	661 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	AMPD2	Q01433	879 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	NFIA	Q12857	509 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	7.39	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	C21orf62-AS1	Q17RA5	79 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	NINJ1	Q92982	152 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	CCDC140	Q96MF4	163 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	HDAC8	Q9BY41	377 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	BRINP2	Q9C0B6	783 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	TPSG1	Q9NRR2	321 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	GRIN2B	Q13224	1484 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	RAPGEF3	O95398	923 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	GSN	P06396	782 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	SNRPB2	P08579	225 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	ITIH2	P19823	946 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	HOXC12	P31275	282 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	MASP1	P48740	699 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	GFRA1	P56159	465 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	KCNMA1	Q12791	1236 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	FNDC3B	Q53EP0	1204 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	NIM1K	Q8IY84	436 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	KCTD13	Q8WZ19	329 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	MFSD3	Q96ES6	412 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	GPR55	Q9Y2T6	319 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	DLX3	O60479	287 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	VAMP4	O75379	141 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	SRF	P11831	508 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	CTSK	P43235	329 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	KCNJ6	P48051	423 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	OXCT1	P55809	520 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	POU4F1	Q01851	419 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	RASSF7	Q02833	373 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	MAP4K2	Q12851	820 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	SF1	Q15637	639 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	CRTC3	Q6UUV7	619 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	ZNF655	Q8N720	491 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	TRIT1	Q9H3H1	467 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	GPATCH2	Q9NW75	528 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	WDR64	B1ANS9	1081 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	GSC2	O15499	205 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	CP	P00450	1065 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	SCG5	P05408	212 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	CPSF6	Q16630	551 aa	Known RBP eCLIP	7.36	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	DPY19L1	Q2PZI1	675 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	PLA2G4E	Q3MJ16	856 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	TM4SF20	Q53R12	229 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	FAM181A	Q8N9Y4	354 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	TMEM145	Q8NBT3	493 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	OSBPL1A	Q9BXW6	950 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	DUSP15	Q9H1R2	295 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	ATG3	Q9NT62	314 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	ST14	Q9Y5Y6	855 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694		U3KQE9	123 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	STXBP3	O00186	592 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	IGLV1-40	P01703	118 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	CD3E	P07766	207 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	ECI1	P42126	302 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	GSK3A	P49840	483 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	IGBP1	P78318	339 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	NKPD1	Q17RQ9	610 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	PCDH12	Q9NPG4	1184 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	ITGB2	P05107	769 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	CEACAM5	P06731	702 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	FST	P19883	344 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	BMP8B	P34820	402 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
NEDD4L-231	ENST00000590694	ANAPC15	P60006	121 aa		7.34	□□□□□ -1.23

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