RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589585.1

CTIF-207, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 4

Gene CTIF, Length 564 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-207ENST00000589585 CYP2C19P33261 490 aa16.08■□□□□ 0.16
CTIF-207ENST00000589585 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa16.08■□□□□ 0.16
CTIF-207ENST00000589585 BTNL9Q6UXG8 535 aa16.08■□□□□ 0.16
CTIF-207ENST00000589585 CHST3Q7LGC8 479 aa16.08■□□□□ 0.16
CTIF-207ENST00000589585 SNHG28P0DPA3 235 aa16.07■□□□□ 0.16
CTIF-207ENST00000589585 ALAS1P13196 640 aa16.07■□□□□ 0.16
CTIF-207ENST00000589585 SART3Q15020 963 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
CTIF-207ENST00000589585 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
CTIF-207ENST00000589585 OLFML2BQ68BL8 750 aa16.07■□□□□ 0.16
CTIF-207ENST00000589585 CREB3L3Q68CJ9 461 aa16.07■□□□□ 0.16
CTIF-207ENST00000589585 ANKRD35Q8N283 1001 aa16.07■□□□□ 0.16
CTIF-207ENST00000589585 CHST13Q8NET6 341 aa16.07■□□□□ 0.16
CTIF-207ENST00000589585 SHISA4Q96DD7 197 aa16.07■□□□□ 0.16
CTIF-207ENST00000589585 FBXO40Q9UH90 709 aa16.07■□□□□ 0.16
CTIF-207ENST00000589585 CCPG1Q9ULG6 757 aa16.07■□□□□ 0.16
CTIF-207ENST00000589585 ZNF536O15090 1300 aa16.06■□□□□ 0.16
CTIF-207ENST00000589585 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
CTIF-207ENST00000589585 CNGA1P29973 690 aa16.06■□□□□ 0.16
CTIF-207ENST00000589585 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
CTIF-207ENST00000589585 NECTIN1Q15223 517 aa16.06■□□□□ 0.16
CTIF-207ENST00000589585 SEC23AQ15436 765 aa16.06■□□□□ 0.16
CTIF-207ENST00000589585 TMEM67Q5HYA8 995 aa16.06■□□□□ 0.16
CTIF-207ENST00000589585 RNF20Q5VTR2 975 aa16.06■□□□□ 0.16
CTIF-207ENST00000589585 MAML3Q96JK9 1138 aa16.06■□□□□ 0.16
CTIF-207ENST00000589585 TRERF1Q96PN7 1200 aa16.06■□□□□ 0.16
CTIF-207ENST00000589585 UBA5Q9GZZ9 404 aa16.06■□□□□ 0.16
CTIF-207ENST00000589585 CPVLQ9H3G5 476 aa16.06■□□□□ 0.16
CTIF-207ENST00000589585 ACAD9Q9H845 621 aa16.06■□□□□ 0.16
CTIF-207ENST00000589585 RNF146Q9NTX7 359 aa16.06■□□□□ 0.16
CTIF-207ENST00000589585 ICAM1P05362 532 aa16.05■□□□□ 0.16
CTIF-207ENST00000589585 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
CTIF-207ENST00000589585 WTAPQ15007 396 aa16.05■□□□□ 0.16
CTIF-207ENST00000589585 ZNF792Q3KQV3 632 aa16.05■□□□□ 0.16
CTIF-207ENST00000589585 TKFCQ3LXA3 575 aa16.05■□□□□ 0.16
CTIF-207ENST00000589585 ASPRV1Q53RT3 343 aa16.05■□□□□ 0.16
CTIF-207ENST00000589585 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
CTIF-207ENST00000589585 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
CTIF-207ENST00000589585 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
CTIF-207ENST00000589585 ANTXR2P58335 489 aa16.04■□□□□ 0.16
CTIF-207ENST00000589585 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa16.04■□□□□ 0.16
CTIF-207ENST00000589585 SENP2Q9HC62 589 aa16.04■□□□□ 0.16
CTIF-207ENST00000589585 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
CTIF-207ENST00000589585 PRC1O43663 620 aa16.03■□□□□ 0.16
CTIF-207ENST00000589585 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
CTIF-207ENST00000589585 MCM5P33992 734 aa16.03■□□□□ 0.16
CTIF-207ENST00000589585 MUM1L1Q5H9M0 696 aa16.03■□□□□ 0.16
CTIF-207ENST00000589585 TRPV1Q8NER1 839 aa16.03■□□□□ 0.16
CTIF-207ENST00000589585 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa16.03■□□□□ 0.16
CTIF-207ENST00000589585 TINF2Q9BSI4 451 aa16.03■□□□□ 0.16
CTIF-207ENST00000589585 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa16.03■□□□□ 0.16
CTIF-207ENST00000589585 VAT1LQ9HCJ6 419 aa16.03■□□□□ 0.16
CTIF-207ENST00000589585 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa16.02■□□□□ 0.16
CTIF-207ENST00000589585 POTEB2H3BUK9 544 aa16.02■□□□□ 0.16
CTIF-207ENST00000589585 IGHA2P01877 340 aa16.02■□□□□ 0.16
CTIF-207ENST00000589585 CYBAP13498 195 aa16.02■□□□□ 0.16
CTIF-207ENST00000589585 NSMFQ6X4W1 530 aa16.02■□□□□ 0.16
CTIF-207ENST00000589585 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP16.02■□□□□ 0.16
CTIF-207ENST00000589585 CATIPQ7Z7H3 387 aa16.02■□□□□ 0.16
CTIF-207ENST00000589585 ADGRF4Q8IZF3 695 aa16.02■□□□□ 0.16
CTIF-207ENST00000589585 STAG2Q8N3U4 1231 aa16.02■□□□□ 0.16
CTIF-207ENST00000589585 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
CTIF-207ENST00000589585 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
CTIF-207ENST00000589585 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
CTIF-207ENST00000589585 ZNF236Q9UL36 1845 aa16.02■□□□□ 0.16
CTIF-207ENST00000589585 CEP290O15078 2479 aa16.01■□□□□ 0.15
CTIF-207ENST00000589585 KLRF2D3W0D1 207 aa16.01■□□□□ 0.15
CTIF-207ENST00000589585 CAPN2P17655 700 aa16.01■□□□□ 0.15
CTIF-207ENST00000589585 CNTN2Q02246 1040 aa16.01■□□□□ 0.15
CTIF-207ENST00000589585 USH1GQ495M9 461 aa16.01■□□□□ 0.15
CTIF-207ENST00000589585 NFXL1Q6ZNB6 911 aa16.01■□□□□ 0.15
CTIF-207ENST00000589585 NUP133Q8WUM0 1156 aa16.01■□□□□ 0.15
CTIF-207ENST00000589585 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
CTIF-207ENST00000589585 PNMA2Q9UL42 364 aa16.01■□□□□ 0.15
CTIF-207ENST00000589585 CNPY2Q9Y2B0 182 aa16.01■□□□□ 0.15
CTIF-207ENST00000589585 PFASO15067 1338 aa16■□□□□ 0.15
CTIF-207ENST00000589585 H0YGN5 161 aa16■□□□□ 0.15
CTIF-207ENST00000589585 REC8O95072 547 aa16■□□□□ 0.15
CTIF-207ENST00000589585 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP16■□□□□ 0.15
CTIF-207ENST00000589585 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
CTIF-207ENST00000589585 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
CTIF-207ENST00000589585 ANO1Q5XXA6 986 aa16■□□□□ 0.15
CTIF-207ENST00000589585 LHX8Q68G74 356 aa16■□□□□ 0.15
CTIF-207ENST00000589585 RASEFQ8IZ41 740 aa16■□□□□ 0.15
CTIF-207ENST00000589585 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
CTIF-207ENST00000589585 TMEM87BQ96K49 555 aa16■□□□□ 0.15
CTIF-207ENST00000589585 NEK1Q96PY6 1258 aa16■□□□□ 0.15
CTIF-207ENST00000589585 LRRC2Q9BYS8 371 aa16■□□□□ 0.15
CTIF-207ENST00000589585 LY9Q9HBG7 655 aa16■□□□□ 0.15
CTIF-207ENST00000589585 MAD2L2Q9UI95 211 aa16■□□□□ 0.15
CTIF-207ENST00000589585 OGDHLQ9ULD0 1010 aa16■□□□□ 0.15
CTIF-207ENST00000589585 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
CTIF-207ENST00000589585 PTPDC1A2A3K4 754 aa15.99■□□□□ 0.15
CTIF-207ENST00000589585 CCDC69A6NI79 296 aa15.99■□□□□ 0.15
CTIF-207ENST00000589585 NFIBO00712 420 aa15.99■□□□□ 0.15
CTIF-207ENST00000589585 MSCO60682 206 aa15.99■□□□□ 0.15
CTIF-207ENST00000589585 KRT32Q14532 448 aa15.99■□□□□ 0.15
CTIF-207ENST00000589585 GRM4Q14833 912 aa15.99■□□□□ 0.15
CTIF-207ENST00000589585 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
CTIF-207ENST00000589585 TMTC2Q8N394 836 aa15.99■□□□□ 0.15
CTIF-207ENST00000589585 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms