RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589497.5

GIPC1-210, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 5

Gene GIPC1, Length 853 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-210ENST00000589497 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
GIPC1-210ENST00000589497 LAMA4Q16363 1823 aa22.13■■□□□ 1.13
GIPC1-210ENST00000589497 GOLGA8HP0CJ92 632 aa22.12■■□□□ 1.13
GIPC1-210ENST00000589497 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
GIPC1-210ENST00000589497 RNF20Q5VTR2 975 aa22.12■■□□□ 1.13
GIPC1-210ENST00000589497 CYB5R4Q7L1T6 521 aa22.12■■□□□ 1.13
GIPC1-210ENST00000589497 SHISA4Q96DD7 197 aa22.12■■□□□ 1.13
GIPC1-210ENST00000589497 TRERF1Q96PN7 1200 aa22.12■■□□□ 1.13
GIPC1-210ENST00000589497 PNMA2Q9UL42 364 aa22.12■■□□□ 1.13
GIPC1-210ENST00000589497 CCPG1Q9ULG6 757 aa22.12■■□□□ 1.13
GIPC1-210ENST00000589497 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
GIPC1-210ENST00000589497 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
GIPC1-210ENST00000589497 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
GIPC1-210ENST00000589497 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
GIPC1-210ENST00000589497 RNF146Q9NTX7 359 aa22.11■■□□□ 1.13
GIPC1-210ENST00000589497 MSCO60682 206 aa22.1■■□□□ 1.13
GIPC1-210ENST00000589497 ICAM1P05362 532 aa22.1■■□□□ 1.13
GIPC1-210ENST00000589497 SNHG28P0DPA3 235 aa22.1■■□□□ 1.13
GIPC1-210ENST00000589497 WTAPQ15007 396 aa22.1■■□□□ 1.13
GIPC1-210ENST00000589497 ZNF792Q3KQV3 632 aa22.1■■□□□ 1.13
GIPC1-210ENST00000589497 ASPRV1Q53RT3 343 aa22.1■■□□□ 1.13
GIPC1-210ENST00000589497 UBA5Q9GZZ9 404 aa22.1■■□□□ 1.13
GIPC1-210ENST00000589497 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa22.1■■□□□ 1.13
GIPC1-210ENST00000589497 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
GIPC1-210ENST00000589497 TMEM67Q5HYA8 995 aa22.09■■□□□ 1.13
GIPC1-210ENST00000589497 CHST3Q7LGC8 479 aa22.09■■□□□ 1.13
GIPC1-210ENST00000589497 DPF3Q92784 378 aa22.09■■□□□ 1.13
GIPC1-210ENST00000589497 TINF2Q9BSI4 451 aa22.09■■□□□ 1.13
GIPC1-210ENST00000589497 HTATIP2Q9BUP3 242 aa22.09■■□□□ 1.13
GIPC1-210ENST00000589497 CNPY2Q9Y2B0 182 aa22.09■■□□□ 1.13
GIPC1-210ENST00000589497 ZNF536O15090 1300 aa22.08■■□□□ 1.13
GIPC1-210ENST00000589497 POTEB2H3BUK9 544 aa22.08■■□□□ 1.13
GIPC1-210ENST00000589497 SLC27A2O14975 620 aa22.08■■□□□ 1.13
GIPC1-210ENST00000589497 CREB3L3Q68CJ9 461 aa22.08■■□□□ 1.13
GIPC1-210ENST00000589497 ANKLE1Q8NAG6 615 aa22.08■■□□□ 1.13
GIPC1-210ENST00000589497 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
GIPC1-210ENST00000589497 SEC23AQ15436 765 aa22.07■■□□□ 1.12
GIPC1-210ENST00000589497 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa22.07■■□□□ 1.12
GIPC1-210ENST00000589497 STOX1Q6ZVD7 989 aa22.07■■□□□ 1.12
GIPC1-210ENST00000589497 NECAB2Q7Z6G3 386 aa22.07■■□□□ 1.12
GIPC1-210ENST00000589497 VAT1LQ9HCJ6 419 aa22.07■■□□□ 1.12
GIPC1-210ENST00000589497 OGDHLQ9ULD0 1010 aa22.07■■□□□ 1.12
GIPC1-210ENST00000589497 TAF6LQ9Y6J9 622 aa22.07■■□□□ 1.12
GIPC1-210ENST00000589497 PFASO15067 1338 aa22.06■■□□□ 1.12
GIPC1-210ENST00000589497 ZNF236Q9UL36 1845 aa22.06■■□□□ 1.12
GIPC1-210ENST00000589497 CYBAP13498 195 aa22.06■■□□□ 1.12
GIPC1-210ENST00000589497 MCM5P33992 734 aa22.06■■□□□ 1.12
GIPC1-210ENST00000589497 NECTIN1Q15223 517 aa22.06■■□□□ 1.12
GIPC1-210ENST00000589497 NSMFQ6X4W1 530 aa22.06■■□□□ 1.12
GIPC1-210ENST00000589497 CATIPQ7Z7H3 387 aa22.06■■□□□ 1.12
GIPC1-210ENST00000589497 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
GIPC1-210ENST00000589497 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
GIPC1-210ENST00000589497 NRBP1Q9UHY1 535 aa22.06■■□□□ 1.12
GIPC1-210ENST00000589497 LHX8Q68G74 356 aa22.05■■□□□ 1.12
GIPC1-210ENST00000589497 NFXL1Q6ZNB6 911 aa22.05■■□□□ 1.12
GIPC1-210ENST00000589497 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP22.05■■□□□ 1.12
GIPC1-210ENST00000589497 CPVLQ9H3G5 476 aa22.05■■□□□ 1.12
GIPC1-210ENST00000589497 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa22.04■■□□□ 1.12
GIPC1-210ENST00000589497 SEPT4O43236 478 aa22.04■■□□□ 1.12
GIPC1-210ENST00000589497 PRC1O43663 620 aa22.04■■□□□ 1.12
GIPC1-210ENST00000589497 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
GIPC1-210ENST00000589497 MUM1L1Q5H9M0 696 aa22.04■■□□□ 1.12
GIPC1-210ENST00000589497 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
GIPC1-210ENST00000589497 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
GIPC1-210ENST00000589497 ADGRF4Q8IZF3 695 aa22.04■■□□□ 1.12
GIPC1-210ENST00000589497 TMTC2Q8N394 836 aa22.04■■□□□ 1.12
GIPC1-210ENST00000589497 TRPV1Q8NER1 839 aa22.04■■□□□ 1.12
GIPC1-210ENST00000589497 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
GIPC1-210ENST00000589497 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
GIPC1-210ENST00000589497 PTPDC1A2A3K4 754 aa22.03■■□□□ 1.12
GIPC1-210ENST00000589497 KLRF2D3W0D1 207 aa22.03■■□□□ 1.12
GIPC1-210ENST00000589497 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
GIPC1-210ENST00000589497 USH1GQ495M9 461 aa22.03■■□□□ 1.12
GIPC1-210ENST00000589497 ARRDC4Q8NCT1 418 aa22.03■■□□□ 1.12
GIPC1-210ENST00000589497 NUP133Q8WUM0 1156 aa22.03■■□□□ 1.12
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GIPC1-210ENST00000589497 IGHA2P01877 340 aa22.02■■□□□ 1.12
GIPC1-210ENST00000589497 CNTN2Q02246 1040 aa22.02■■□□□ 1.12
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GIPC1-210ENST00000589497 MTA3Q9BTC8 594 aa22.02■■□□□ 1.12
GIPC1-210ENST00000589497 CYP39A1Q9NYL5 469 aa22.02■■□□□ 1.12
GIPC1-210ENST00000589497 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
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GIPC1-210ENST00000589497 RARBP10826 455 aa22.01■■□□□ 1.11
GIPC1-210ENST00000589497 ANTXR2P58335 489 aa22.01■■□□□ 1.11
GIPC1-210ENST00000589497 KRT32Q14532 448 aa22.01■■□□□ 1.11
GIPC1-210ENST00000589497 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa22.01■■□□□ 1.11
GIPC1-210ENST00000589497 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
GIPC1-210ENST00000589497 NEK1Q96PY6 1258 aa22.01■■□□□ 1.11
GIPC1-210ENST00000589497 WDR19Q8NEZ3 1342 aa22.01■■□□□ 1.11
GIPC1-210ENST00000589497 AKR1A1P14550 325 aa22■■□□□ 1.11
GIPC1-210ENST00000589497 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
GIPC1-210ENST00000589497 CALML3P27482 149 aa22■■□□□ 1.11
GIPC1-210ENST00000589497 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
GIPC1-210ENST00000589497 GRM4Q14833 912 aa22■■□□□ 1.11
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