RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588345.1

CTIF-206, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-206ENST00000588345 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
CTIF-206ENST00000588345 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
CTIF-206ENST00000588345 TKFCQ3LXA3 575 aa21.63■■□□□ 1.05
CTIF-206ENST00000588345 KLHDC9Q8NEP7 349 aa21.63■■□□□ 1.05
CTIF-206ENST00000588345 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa21.63■■□□□ 1.05
CTIF-206ENST00000588345 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
CTIF-206ENST00000588345 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
CTIF-206ENST00000588345 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
CTIF-206ENST00000588345 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa21.62■■□□□ 1.05
CTIF-206ENST00000588345 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
CTIF-206ENST00000588345 A0A1W2PQY0 241 aa21.62■■□□□ 1.05
CTIF-206ENST00000588345 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
CTIF-206ENST00000588345 ACVR2BQ13705 512 aa21.62■■□□□ 1.05
CTIF-206ENST00000588345 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
CTIF-206ENST00000588345 KCTD1Q719H9 257 aa21.62■■□□□ 1.05
CTIF-206ENST00000588345 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
CTIF-206ENST00000588345 FAM133AQ8N9E0 248 aa21.62■■□□□ 1.05
CTIF-206ENST00000588345 AGBL1Q96MI9 1066 aa21.62■■□□□ 1.05
CTIF-206ENST00000588345 OSBPL3Q9H4L5 887 aa21.62■■□□□ 1.05
CTIF-206ENST00000588345 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
CTIF-206ENST00000588345 RNF146Q9NTX7 359 aa21.62■■□□□ 1.05
CTIF-206ENST00000588345 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
CTIF-206ENST00000588345 CCDC171Q6TFL3 1326 aa21.61■■□□□ 1.05
CTIF-206ENST00000588345 CST5P28325 142 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
CTIF-206ENST00000588345 TLE2Q04725 743 aa21.61■■□□□ 1.05
CTIF-206ENST00000588345 IKQ13123 557 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
CTIF-206ENST00000588345 ARMCX2Q7L311 632 aa21.61■■□□□ 1.05
CTIF-206ENST00000588345 DCAF4Q8WV16 495 aa21.61■■□□□ 1.05
CTIF-206ENST00000588345 KATNBL1Q9H079 304 aa21.61■■□□□ 1.05
CTIF-206ENST00000588345 HOMER2Q9NSB8 354 aa21.61■■□□□ 1.05
CTIF-206ENST00000588345 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa21.61■■□□□ 1.05
CTIF-206ENST00000588345 PRR12Q9ULL5 1215 aa21.61■■□□□ 1.05
CTIF-206ENST00000588345 TRIM43BA6NCK2 446 aa21.6■■□□□ 1.05
CTIF-206ENST00000588345 MOXD2PA6NHM9 499 aa21.6■■□□□ 1.05
CTIF-206ENST00000588345 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa21.6■■□□□ 1.05
CTIF-206ENST00000588345 ACLYP53396 1101 aa21.6■■□□□ 1.05
CTIF-206ENST00000588345 CNTN2Q02246 1040 aa21.6■■□□□ 1.05
CTIF-206ENST00000588345 RASGRP2Q7LDG7 609 aa21.6■■□□□ 1.05
CTIF-206ENST00000588345 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa21.6■■□□□ 1.05
CTIF-206ENST00000588345 CHD1LQ86WJ1 897 aa21.6■■□□□ 1.05
CTIF-206ENST00000588345 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
CTIF-206ENST00000588345 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
CTIF-206ENST00000588345 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
CTIF-206ENST00000588345 POTEB2H3BUK9 544 aa21.59■■□□□ 1.05
CTIF-206ENST00000588345 ADCY6O43306 1168 aa21.59■■□□□ 1.05
CTIF-206ENST00000588345 IGHDP01880 384 aa21.59■■□□□ 1.05
CTIF-206ENST00000588345 PCP11498 1178 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
CTIF-206ENST00000588345 BTNL9Q6UXG8 535 aa21.59■■□□□ 1.05
CTIF-206ENST00000588345 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa21.59■■□□□ 1.05
CTIF-206ENST00000588345 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa21.59■■□□□ 1.05
CTIF-206ENST00000588345 DEFB123Q8N688 67 aa21.59■■□□□ 1.05
CTIF-206ENST00000588345 RILPL2Q969X0 211 aa21.59■■□□□ 1.05
CTIF-206ENST00000588345 TRERF1Q96PN7 1200 aa21.59■■□□□ 1.05
CTIF-206ENST00000588345 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
CTIF-206ENST00000588345 CLTBP09497 229 aa21.58■■□□□ 1.05
CTIF-206ENST00000588345 TOP1P11387 765 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
CTIF-206ENST00000588345 ALAS1P13196 640 aa21.58■■□□□ 1.05
CTIF-206ENST00000588345 SDSP20132 328 aa21.58■■□□□ 1.05
CTIF-206ENST00000588345 GJA9P57773 515 aa21.58■■□□□ 1.05
CTIF-206ENST00000588345 NKX3-2P78367 333 aa21.58■■□□□ 1.05
CTIF-206ENST00000588345 NUCB1Q02818 461 aa21.58■■□□□ 1.05
CTIF-206ENST00000588345 CCDC144BQ3MJ40 725 aa21.58■■□□□ 1.05
CTIF-206ENST00000588345 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa21.58■■□□□ 1.05
CTIF-206ENST00000588345 NUP133Q8WUM0 1156 aa21.58■■□□□ 1.05
CTIF-206ENST00000588345 BADQ92934 168 aa21.58■■□□□ 1.05
CTIF-206ENST00000588345 CHMP4CQ96CF2 233 aa21.58■■□□□ 1.05
CTIF-206ENST00000588345 TOX2Q96NM4 488 aa21.58■■□□□ 1.05
CTIF-206ENST00000588345 TMEM47Q9BQJ4 181 aa21.58■■□□□ 1.05
CTIF-206ENST00000588345 TOMM22Q9NS69 142 aa21.58■■□□□ 1.05
CTIF-206ENST00000588345 LRRC37A2A6NM11 1700 aa21.58■■□□□ 1.04
CTIF-206ENST00000588345 MYADML2A6NDP7 307 aa21.57■■□□□ 1.04
CTIF-206ENST00000588345 SOWAHBA6NEL2 793 aa21.57■■□□□ 1.04
CTIF-206ENST00000588345 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
CTIF-206ENST00000588345 KCNA10Q16322 511 aa21.57■■□□□ 1.04
CTIF-206ENST00000588345 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
CTIF-206ENST00000588345 CCDC174Q6PII3 467 aa21.57■■□□□ 1.04
CTIF-206ENST00000588345 Q7L0L9 218 aa21.57■■□□□ 1.04
CTIF-206ENST00000588345 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa21.57■■□□□ 1.04
CTIF-206ENST00000588345 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
CTIF-206ENST00000588345 STARD7Q9NQZ5 370 aa21.57■■□□□ 1.04
CTIF-206ENST00000588345 LCTP09848 1927 aa21.57■■□□□ 1.04
CTIF-206ENST00000588345 ASB14A6NK59 587 aa21.56■■□□□ 1.04
CTIF-206ENST00000588345 KIAA0355O15063 1070 aa21.56■■□□□ 1.04
CTIF-206ENST00000588345 ICAM1P05362 532 aa21.56■■□□□ 1.04
CTIF-206ENST00000588345 SNAP25P60880 206 aa21.56■■□□□ 1.04
CTIF-206ENST00000588345 CCDC96Q2M329 555 aa21.56■■□□□ 1.04
CTIF-206ENST00000588345 AKNAD1Q5T1N1 836 aa21.56■■□□□ 1.04
CTIF-206ENST00000588345 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
CTIF-206ENST00000588345 TTC14Q96N46 770 aa21.56■■□□□ 1.04
CTIF-206ENST00000588345 MTMR10Q9NXD2 777 aa21.56■■□□□ 1.04
CTIF-206ENST00000588345 CYP39A1Q9NYL5 469 aa21.56■■□□□ 1.04
CTIF-206ENST00000588345 LAMA4Q16363 1823 aa21.56■■□□□ 1.04
CTIF-206ENST00000588345 ASTN1O14525 1302 aa21.55■■□□□ 1.04
CTIF-206ENST00000588345 ELP1O95163 1332 aa21.55■■□□□ 1.04
CTIF-206ENST00000588345 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
CTIF-206ENST00000588345 ITGB8P26012 769 aa21.55■■□□□ 1.04
CTIF-206ENST00000588345 HAND2P61296 217 aa21.55■■□□□ 1.04
CTIF-206ENST00000588345 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
CTIF-206ENST00000588345 SHHQ15465 462 aa21.55■■□□□ 1.04
CTIF-206ENST00000588345 MUM1L1Q5H9M0 696 aa21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms