RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558954.5

RABGGTA-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 4

Gene RABGGTA, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-208ENST00000558954 SLC12A7Q9Y666 1083 aa22.01■■□□□ 1.11
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RABGGTA-208ENST00000558954 KLRF2D3W0D1 207 aa22■■□□□ 1.11
RABGGTA-208ENST00000558954 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
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RABGGTA-208ENST00000558954 CALM1P0DP23 149 aa22■■□□□ 1.11
RABGGTA-208ENST00000558954 CALM2P0DP24 149 aa22■■□□□ 1.11
RABGGTA-208ENST00000558954 CALM3P0DP25 149 aa22■■□□□ 1.11
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RABGGTA-208ENST00000558954 KIF5BP33176 963 aa22■■□□□ 1.11
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RABGGTA-208ENST00000558954 STAG2Q8N3U4 1231 aa22■■□□□ 1.11
RABGGTA-208ENST00000558954 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
RABGGTA-208ENST00000558954 PXYLP1Q8TE99 480 aa22■■□□□ 1.11
RABGGTA-208ENST00000558954 NUP133Q8WUM0 1156 aa22■■□□□ 1.11
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RABGGTA-208ENST00000558954 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
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RABGGTA-208ENST00000558954 ADCY3O60266 1144 aa21.99■■□□□ 1.11
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RABGGTA-208ENST00000558954 SLC4A3P48751 1232 aa21.99■■□□□ 1.11
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RABGGTA-208ENST00000558954 KCTD2Q14681 263 aa21.99■■□□□ 1.11
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RABGGTA-208ENST00000558954 NBPF11Q86T75 865 aa21.99■■□□□ 1.11
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RABGGTA-208ENST00000558954 USP6NLQ92738 828 aa21.99■■□□□ 1.11
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RABGGTA-208ENST00000558954 MYL10Q9BUA6 226 aa21.99■■□□□ 1.11
RABGGTA-208ENST00000558954 UBA5Q9GZZ9 404 aa21.99■■□□□ 1.11
RABGGTA-208ENST00000558954 CPVLQ9H3G5 476 aa21.99■■□□□ 1.11
RABGGTA-208ENST00000558954 CCPG1Q9ULG6 757 aa21.99■■□□□ 1.11
RABGGTA-208ENST00000558954 RIPK3Q9Y572 518 aa21.99■■□□□ 1.11
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RABGGTA-208ENST00000558954 CYP2B6P20813 491 aa21.98■■□□□ 1.11
RABGGTA-208ENST00000558954 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa21.98■■□□□ 1.11
RABGGTA-208ENST00000558954 ADGRF4Q8IZF3 695 aa21.98■■□□□ 1.11
RABGGTA-208ENST00000558954 AGBL1Q96MI9 1066 aa21.98■■□□□ 1.11
RABGGTA-208ENST00000558954 MMP19Q99542 508 aa21.98■■□□□ 1.11
RABGGTA-208ENST00000558954 TM6SF1Q9BZW5 370 aa21.98■■□□□ 1.11
RABGGTA-208ENST00000558954 HOMER2Q9NSB8 354 aa21.98■■□□□ 1.11
RABGGTA-208ENST00000558954 SLC5A4Q9NY91 659 aa21.98■■□□□ 1.11
RABGGTA-208ENST00000558954 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa21.98■■□□□ 1.11
RABGGTA-208ENST00000558954 SEC24BO95487 1268 aa21.97■■□□□ 1.11
RABGGTA-208ENST00000558954 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
RABGGTA-208ENST00000558954 APOA5Q6Q788 366 aa21.97■■□□□ 1.11
RABGGTA-208ENST00000558954 RUFY3Q7L099 469 aa21.97■■□□□ 1.11
RABGGTA-208ENST00000558954 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP21.97■■□□□ 1.11
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RABGGTA-208ENST00000558954 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
RABGGTA-208ENST00000558954 ACAD9Q9H845 621 aa21.97■■□□□ 1.11
RABGGTA-208ENST00000558954 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa21.97■■□□□ 1.11
RABGGTA-208ENST00000558954 RNF146Q9NTX7 359 aa21.97■■□□□ 1.11
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RABGGTA-208ENST00000558954 ELNP15502 786 aa21.96■■□□□ 1.11
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RABGGTA-208ENST00000558954 FBXL16Q8N461 479 aa21.96■■□□□ 1.11
RABGGTA-208ENST00000558954 SH3TC2Q8TF17 1288 aa21.96■■□□□ 1.11
RABGGTA-208ENST00000558954 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
RABGGTA-208ENST00000558954 GNAQP50148 359 aa21.95■■□□□ 1.1
RABGGTA-208ENST00000558954 RCAN1P53805 252 aa21.95■■□□□ 1.1
RABGGTA-208ENST00000558954 Q6ZUG5 572 aa21.95■■□□□ 1.1
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF333Q96JL9 665 aa21.95■■□□□ 1.1
RABGGTA-208ENST00000558954 TRERF1Q96PN7 1200 aa21.95■■□□□ 1.1
RABGGTA-208ENST00000558954 JMJD4Q9H9V9 463 aa21.95■■□□□ 1.1
RABGGTA-208ENST00000558954 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa21.94■■□□□ 1.1
RABGGTA-208ENST00000558954 ZBTB43O43298 467 aa21.94■■□□□ 1.1
RABGGTA-208ENST00000558954 RXRAP19793 462 aa21.94■■□□□ 1.1
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RABGGTA-208ENST00000558954 AGXT2Q9BYV1 514 aa21.93■■□□□ 1.1
RABGGTA-208ENST00000558954 RIOX1Q9H6W3 641 aa21.93■■□□□ 1.1
RABGGTA-208ENST00000558954 VAT1LQ9HCJ6 419 aa21.93■■□□□ 1.1
RABGGTA-208ENST00000558954 BRPF3Q9ULD4 1205 aa21.93■■□□□ 1.1
RABGGTA-208ENST00000558954 GOLGA8BA8MQT2 603 aa21.92■■□□□ 1.1
RABGGTA-208ENST00000558954 ZBTB5O15062 677 aa21.92■■□□□ 1.1
RABGGTA-208ENST00000558954 COBLO75128 1261 aa21.92■■□□□ 1.1
RABGGTA-208ENST00000558954 SMARCA1P28370 1054 aa21.92■■□□□ 1.1
RABGGTA-208ENST00000558954 USH1GQ495M9 461 aa21.92■■□□□ 1.1
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