RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 GIPC1O14908 333 aa9.37□□□□□ -0.91
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PTPRB-208ENST00000550358 USP17L21D6R901 530 aa9.37□□□□□ -0.91
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PTPRB-208ENST00000550358 MED7O43513 233 aa9.35□□□□□ -0.91
PTPRB-208ENST00000550358 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP9.35□□□□□ -0.91
PTPRB-208ENST00000550358 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
PTPRB-208ENST00000550358 SH2D4BQ5SQS7 431 aa9.35□□□□□ -0.91
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