RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548567.5

CS-212, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 3,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-212ENST00000548567 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
CS-212ENST00000548567 CCT2P78371 535 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
CS-212ENST00000548567 SCLYQ96I15 445 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-212ENST00000548567 SH2D3AQ9BRG2 576 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-212ENST00000548567 KAT14Q9H8E8 782 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-212ENST00000548567 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-212ENST00000548567 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 CYP2C9P11712 490 aa8.83□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 DSG3P32926 999 aa8.83□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 TRIM60Q495X7 471 aa8.83□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 GCC1Q96CN9 775 aa8.83□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 ALG1Q9BT22 464 aa8.83□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 PRR12Q9ULL5 1215 aa8.83□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa8.83□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 GON4LQ3T8J9 2241 aa8.83□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 ADCY6O43306 1168 aa8.83□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 TBC1D12O60347 775 aa8.83□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 NUCB1Q02818 461 aa8.83□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 TLE2Q04725 743 aa8.83□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 CCDC144BQ3MJ40 725 aa8.83□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 LBX2Q6XYB7 198 aa8.83□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 CYB5R4Q7L1T6 521 aa8.83□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 PNMA1Q8ND90 353 aa8.83□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 TNKSO95271 1327 aa8.83□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 CCDC171Q6TFL3 1326 aa8.83□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 FRYLO94915 3013 aa8.83□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 IGFBP4P22692 258 aa8.82□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 PTPREP23469 700 aa8.82□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 C9orf50Q5SZB4 431 aa8.82□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP8.82□□□□□ -17e-8■■■□□ 18
CS-212ENST00000548567 WDR18Q9BV38 432 aa8.82□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 CACNA1FO60840 1977 aa8.82□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 RPTORQ8N122 1335 aa8.82□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 CYP21A2P08686 494 aa8.82□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 MYBP10242 640 aa8.82□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 GJA8P48165 433 aa8.82□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 USP17L6PQ6QN14 398 aa8.82□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 SLAIN1Q8ND83 568 aa8.82□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 NR2E3Q9Y5X4 410 aa8.82□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa8.82□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
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CS-212ENST00000548567 MARK3P27448 753 aa8.82□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 AKNAD1Q5T1N1 836 aa8.82□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 OLFML2BQ68BL8 750 aa8.82□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 IQCA1Q86XH1 822 aa8.82□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 BADQ92934 168 aa8.82□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 GJA10Q969M2 543 aa8.82□□□□□ -1
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CS-212ENST00000548567 TEX13BQ9BXU2 312 aa8.82□□□□□ -1
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CS-212ENST00000548567 NOD1Q9Y239 953 aa8.82□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 TELO2Q9Y4R8 837 aa8.82□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 UMODL1Q5DID0 1318 aa8.81□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 TPRP12270 2363 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 RAG1P15918 1043 aa8.81□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 MAPK4P31152 587 aa8.81□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 CYP2C18P33260 490 aa8.81□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 IGBP1P78318 339 aa8.81□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 LONRF3Q496Y0 759 aa8.81□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 TMEM67Q5HYA8 995 aa8.81□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 SPEGQ15772 3267 aa8.81□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 UPP2O95045 317 aa8.81□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 RARBP10826 455 aa8.81□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 ITGB8P26012 769 aa8.81□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 LY6KQ17RY6 165 aa8.81□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 MAML3Q96JK9 1138 aa8.81□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 CCDC17Q96LX7 622 aa8.81□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 PIGSQ96S52 555 aa8.81□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 TINF2Q9BSI4 451 aa8.81□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 TRPV6Q9H1D0 765 aa8.81□□□□□ -1
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CS-212ENST00000548567 A0A087WWV3 80 aa8.8□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 CTSHP09668 335 aa8.8□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 RPS6P62753 249 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
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CS-212ENST00000548567 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 ADCK5Q3MIX3 580 aa8.8□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 PFASO15067 1338 aa8.8□□□□□ -1
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