RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517351.5

TCEA1-202, Transcript of transcription elongation factor A1, humanhuman

TSL 4

Gene TCEA1, Length 539 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1-202ENST00000517351 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
TCEA1-202ENST00000517351 OGDHLQ9ULD0 1010 aa30.04■■■□□ 2.4
TCEA1-202ENST00000517351 TAF6LQ9Y6J9 622 aa30.04■■■□□ 2.4
TCEA1-202ENST00000517351 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa30.04■■■□□ 2.4
TCEA1-202ENST00000517351 CYBAP13498 195 aa30.03■■■□□ 2.4
TCEA1-202ENST00000517351 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
TCEA1-202ENST00000517351 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
TCEA1-202ENST00000517351 ANKRD35Q8N283 1001 aa30.03■■■□□ 2.4
TCEA1-202ENST00000517351 ANKLE1Q8NAG6 615 aa30.03■■■□□ 2.4
TCEA1-202ENST00000517351 TRPV1Q8NER1 839 aa30.03■■■□□ 2.4
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TCEA1-202ENST00000517351 RNF146Q9NTX7 359 aa30.03■■■□□ 2.4
TCEA1-202ENST00000517351 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa30.03■■■□□ 2.4
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TCEA1-202ENST00000517351 TKFCQ3LXA3 575 aa30.02■■■□□ 2.4
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TCEA1-202ENST00000517351 LHX8Q68G74 356 aa30.02■■■□□ 2.4
TCEA1-202ENST00000517351 NCOA7Q8NI08 942 aa30.02■■■□□ 2.4
TCEA1-202ENST00000517351 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa30.01■■■□□ 2.39
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TCEA1-202ENST00000517351 TRERF1Q96PN7 1200 aa30.01■■■□□ 2.39
TCEA1-202ENST00000517351 ANO2Q9NQ90 1003 aa30.01■■■□□ 2.39
TCEA1-202ENST00000517351 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
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TCEA1-202ENST00000517351 CDC45O75419 566 aa30■■■□□ 2.39
TCEA1-202ENST00000517351 ICAM1P05362 532 aa30■■■□□ 2.39
TCEA1-202ENST00000517351 SEC23AQ15436 765 aa30■■■□□ 2.39
TCEA1-202ENST00000517351 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa30■■■□□ 2.39
TCEA1-202ENST00000517351 CASC1Q6TDU7 716 aa30■■■□□ 2.39
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TCEA1-202ENST00000517351 HTATIP2Q9BUP3 242 aa29.99■■■□□ 2.39
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TCEA1-202ENST00000517351 NECAB2Q7Z6G3 386 aa29.98■■■□□ 2.39
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TCEA1-202ENST00000517351 ASPRV1Q53RT3 343 aa29.97■■■□□ 2.39
TCEA1-202ENST00000517351 UBA5Q9GZZ9 404 aa29.97■■■□□ 2.39
TCEA1-202ENST00000517351 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
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TCEA1-202ENST00000517351 SEPT4O43236 478 aa29.96■■■□□ 2.39
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TCEA1-202ENST00000517351 MUM1L1Q5H9M0 696 aa29.96■■■□□ 2.39
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TCEA1-202ENST00000517351 PPP4R2Q9NY27 417 aa29.96■■■□□ 2.39
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TCEA1-202ENST00000517351 FRMPD3Q5JV73 1810 aa29.96■■■□□ 2.39
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TCEA1-202ENST00000517351 CHST3Q7LGC8 479 aa29.95■■■□□ 2.39
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TCEA1-202ENST00000517351 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
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TCEA1-202ENST00000517351 CNPY2Q9Y2B0 182 aa29.94■■■□□ 2.38
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TCEA1-202ENST00000517351 SMCHD1A6NHR9 2005 aa29.93■■■□□ 2.38
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TCEA1-202ENST00000517351 ANO1Q5XXA6 986 aa29.93■■■□□ 2.38
TCEA1-202ENST00000517351 FGD4Q96M96 766 aa29.93■■■□□ 2.38
TCEA1-202ENST00000517351 C11orf49Q9H6J7 331 aa29.93■■■□□ 2.38
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TCEA1-202ENST00000517351 TMEM67Q5HYA8 995 aa29.92■■■□□ 2.38
TCEA1-202ENST00000517351 NSMFQ6X4W1 530 aa29.92■■■□□ 2.38
TCEA1-202ENST00000517351 FAM133AQ8N9E0 248 aa29.92■■■□□ 2.38
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TCEA1-202ENST00000517351 WDR19Q8NEZ3 1342 aa29.92■■■□□ 2.38
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TCEA1-202ENST00000517351 CYP39A1Q9NYL5 469 aa29.91■■■□□ 2.38
TCEA1-202ENST00000517351 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
TCEA1-202ENST00000517351 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
TCEA1-202ENST00000517351 STAG2Q8N3U4 1231 aa29.9■■■□□ 2.38
TCEA1-202ENST00000517351 NFIBO00712 420 aa29.89■■■□□ 2.38
TCEA1-202ENST00000517351 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.38
TCEA1-202ENST00000517351 RNF20Q5VTR2 975 aa29.89■■■□□ 2.38
TCEA1-202ENST00000517351 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa29.89■■■□□ 2.38
TCEA1-202ENST00000517351 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.38
TCEA1-202ENST00000517351 SOWAHBA6NEL2 793 aa29.88■■■□□ 2.37
TCEA1-202ENST00000517351 ARMCX2Q7L311 632 aa29.88■■■□□ 2.37
TCEA1-202ENST00000517351 VAT1LQ9HCJ6 419 aa29.88■■■□□ 2.37
TCEA1-202ENST00000517351 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
TCEA1-202ENST00000517351 KLRF2D3W0D1 207 aa29.87■■■□□ 2.37
TCEA1-202ENST00000517351 PRC1O43663 620 aa29.87■■■□□ 2.37
TCEA1-202ENST00000517351 AKR1A1P14550 325 aa29.87■■■□□ 2.37
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