RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502974.1

CXCL3-202, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

TSL 2

Gene CXCL3, Length 630 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-202ENST00000502974 RIPK3Q9Y572 518 aa29.27■■■□□ 2.28
CXCL3-202ENST00000502974 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa29.26■■■□□ 2.27
CXCL3-202ENST00000502974 SNHG28P0DPA3 235 aa29.26■■■□□ 2.27
CXCL3-202ENST00000502974 SEC23AQ15436 765 aa29.26■■■□□ 2.27
CXCL3-202ENST00000502974 SYDE2Q5VT97 1194 aa29.26■■■□□ 2.27
CXCL3-202ENST00000502974 CHST3Q7LGC8 479 aa29.26■■■□□ 2.27
CXCL3-202ENST00000502974 HTATIP2Q9BUP3 242 aa29.26■■■□□ 2.27
CXCL3-202ENST00000502974 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
CXCL3-202ENST00000502974 CCDC174Q6PII3 467 aa29.25■■■□□ 2.27
CXCL3-202ENST00000502974 BTNL9Q6UXG8 535 aa29.25■■■□□ 2.27
CXCL3-202ENST00000502974 ANKLE1Q8NAG6 615 aa29.25■■■□□ 2.27
CXCL3-202ENST00000502974 ERICH2A1L162 156 aa29.24■■■□□ 2.27
CXCL3-202ENST00000502974 PGK2P07205 417 aa29.24■■■□□ 2.27
CXCL3-202ENST00000502974 GOLGA8HP0CJ92 632 aa29.24■■■□□ 2.27
CXCL3-202ENST00000502974 CNGA1P29973 690 aa29.24■■■□□ 2.27
CXCL3-202ENST00000502974 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
CXCL3-202ENST00000502974 MAML3Q96JK9 1138 aa29.24■■■□□ 2.27
CXCL3-202ENST00000502974 OGDHLQ9ULD0 1010 aa29.24■■■□□ 2.27
CXCL3-202ENST00000502974 SART3Q15020 963 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
CXCL3-202ENST00000502974 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
CXCL3-202ENST00000502974 RNF20Q5VTR2 975 aa29.23■■■□□ 2.27
CXCL3-202ENST00000502974 AGBL1Q96MI9 1066 aa29.23■■■□□ 2.27
CXCL3-202ENST00000502974 HOMER2Q9NSB8 354 aa29.23■■■□□ 2.27
CXCL3-202ENST00000502974 FBXO40Q9UH90 709 aa29.23■■■□□ 2.27
CXCL3-202ENST00000502974 ZNF536O15090 1300 aa29.22■■■□□ 2.27
CXCL3-202ENST00000502974 ANTXR2P58335 489 aa29.22■■■□□ 2.27
CXCL3-202ENST00000502974 DPF3Q92784 378 aa29.22■■■□□ 2.27
CXCL3-202ENST00000502974 DDX11Q96FC9 970 aa29.22■■■□□ 2.27
CXCL3-202ENST00000502974 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
CXCL3-202ENST00000502974 FRMPD3Q5JV73 1810 aa29.22■■■□□ 2.27
CXCL3-202ENST00000502974 IGHA2P01877 340 aa29.21■■■□□ 2.27
CXCL3-202ENST00000502974 CYBAP13498 195 aa29.21■■■□□ 2.27
CXCL3-202ENST00000502974 WTAPQ15007 396 aa29.21■■■□□ 2.27
CXCL3-202ENST00000502974 NECAB2Q7Z6G3 386 aa29.21■■■□□ 2.27
CXCL3-202ENST00000502974 CHST13Q8NET6 341 aa29.21■■■□□ 2.27
CXCL3-202ENST00000502974 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
CXCL3-202ENST00000502974 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
CXCL3-202ENST00000502974 MSCO60682 206 aa29.2■■■□□ 2.26
CXCL3-202ENST00000502974 ASPRV1Q53RT3 343 aa29.2■■■□□ 2.26
CXCL3-202ENST00000502974 TMEM67Q5HYA8 995 aa29.2■■■□□ 2.26
CXCL3-202ENST00000502974 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
CXCL3-202ENST00000502974 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
CXCL3-202ENST00000502974 PRC1O43663 620 aa29.19■■■□□ 2.26
CXCL3-202ENST00000502974 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
CXCL3-202ENST00000502974 ALAS1P13196 640 aa29.19■■■□□ 2.26
CXCL3-202ENST00000502974 ZNF792Q3KQV3 632 aa29.19■■■□□ 2.26
CXCL3-202ENST00000502974 LHX8Q68G74 356 aa29.19■■■□□ 2.26
CXCL3-202ENST00000502974 ANKRD35Q8N283 1001 aa29.19■■■□□ 2.26
CXCL3-202ENST00000502974 TRPV1Q8NER1 839 aa29.19■■■□□ 2.26
CXCL3-202ENST00000502974 UBA5Q9GZZ9 404 aa29.19■■■□□ 2.26
CXCL3-202ENST00000502974 CPVLQ9H3G5 476 aa29.19■■■□□ 2.26
CXCL3-202ENST00000502974 SENP2Q9HC62 589 aa29.19■■■□□ 2.26
CXCL3-202ENST00000502974 RNF146Q9NTX7 359 aa29.19■■■□□ 2.26
CXCL3-202ENST00000502974 CCPG1Q9ULG6 757 aa29.19■■■□□ 2.26
CXCL3-202ENST00000502974 MCM5P33992 734 aa29.18■■■□□ 2.26
CXCL3-202ENST00000502974 ACAD9Q9H845 621 aa29.18■■■□□ 2.26
CXCL3-202ENST00000502974 SMCHD1A6NHR9 2005 aa29.17■■■□□ 2.26
CXCL3-202ENST00000502974 ICAM1P05362 532 aa29.17■■■□□ 2.26
CXCL3-202ENST00000502974 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
CXCL3-202ENST00000502974 TKFCQ3LXA3 575 aa29.17■■■□□ 2.26
CXCL3-202ENST00000502974 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa29.17■■■□□ 2.26
CXCL3-202ENST00000502974 TRERF1Q96PN7 1200 aa29.17■■■□□ 2.26
CXCL3-202ENST00000502974 TINF2Q9BSI4 451 aa29.17■■■□□ 2.26
CXCL3-202ENST00000502974 CEP290O15078 2479 aa29.17■■■□□ 2.26
CXCL3-202ENST00000502974 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
CXCL3-202ENST00000502974 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP29.16■■■□□ 2.26
CXCL3-202ENST00000502974 C11orf49Q9H6J7 331 aa29.16■■■□□ 2.26
CXCL3-202ENST00000502974 REC8O95072 547 aa29.15■■■□□ 2.26
CXCL3-202ENST00000502974 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa29.15■■■□□ 2.26
CXCL3-202ENST00000502974 RASEFQ8IZ41 740 aa29.15■■■□□ 2.26
CXCL3-202ENST00000502974 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
CXCL3-202ENST00000502974 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa29.14■■■□□ 2.26
CXCL3-202ENST00000502974 SEPT4O43236 478 aa29.14■■■□□ 2.26
CXCL3-202ENST00000502974 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP29.14■■■□□ 2.26
CXCL3-202ENST00000502974 MUM1L1Q5H9M0 696 aa29.14■■■□□ 2.26
CXCL3-202ENST00000502974 STAG2Q8N3U4 1231 aa29.14■■■□□ 2.26
CXCL3-202ENST00000502974 MTA3Q9BTC8 594 aa29.14■■■□□ 2.26
CXCL3-202ENST00000502974 LY9Q9HBG7 655 aa29.14■■■□□ 2.26
CXCL3-202ENST00000502974 NRBP1Q9UHY1 535 aa29.14■■■□□ 2.26
CXCL3-202ENST00000502974 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
CXCL3-202ENST00000502974 CATIPQ7Z7H3 387 aa29.13■■■□□ 2.25
CXCL3-202ENST00000502974 ADGRF4Q8IZF3 695 aa29.13■■■□□ 2.25
CXCL3-202ENST00000502974 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
CXCL3-202ENST00000502974 TMEM87BQ96K49 555 aa29.13■■■□□ 2.25
CXCL3-202ENST00000502974 NEK1Q96PY6 1258 aa29.13■■■□□ 2.25
CXCL3-202ENST00000502974 CNPY2Q9Y2B0 182 aa29.13■■■□□ 2.25
CXCL3-202ENST00000502974 MYH6P13533 1939 aa29.12■■■□□ 2.25
CXCL3-202ENST00000502974 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
CXCL3-202ENST00000502974 EVI5O60447 810 aa29.12■■■□□ 2.25
CXCL3-202ENST00000502974 TSGA10IPQ3SY00 556 aa29.12■■■□□ 2.25
CXCL3-202ENST00000502974 LRRC2Q9BYS8 371 aa29.12■■■□□ 2.25
CXCL3-202ENST00000502974 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
CXCL3-202ENST00000502974 MAD2L2Q9UI95 211 aa29.12■■■□□ 2.25
CXCL3-202ENST00000502974 NR2E3Q9Y5X4 410 aa29.12■■■□□ 2.25
CXCL3-202ENST00000502974 KLRF2D3W0D1 207 aa29.11■■■□□ 2.25
CXCL3-202ENST00000502974 H0YGN5 161 aa29.11■■■□□ 2.25
CXCL3-202ENST00000502974 KRT32Q14532 448 aa29.11■■■□□ 2.25
CXCL3-202ENST00000502974 GRM4Q14833 912 aa29.11■■■□□ 2.25
CXCL3-202ENST00000502974 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
CXCL3-202ENST00000502974 ADCK5Q3MIX3 580 aa29.11■■■□□ 2.25
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