RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497453.1

UBE2Q1-207, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

TSL 5

Gene UBE2Q1, Length 830 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-207ENST00000497453 PGK2P07205 417 aa20.87■□□□□ 0.93
UBE2Q1-207ENST00000497453 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
UBE2Q1-207ENST00000497453 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa20.87■□□□□ 0.93
UBE2Q1-207ENST00000497453 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP20.87■□□□□ 0.93
UBE2Q1-207ENST00000497453 CPVLQ9H3G5 476 aa20.87■□□□□ 0.93
UBE2Q1-207ENST00000497453 LY9Q9HBG7 655 aa20.87■□□□□ 0.93
UBE2Q1-207ENST00000497453 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
UBE2Q1-207ENST00000497453 HOMER2Q9NSB8 354 aa20.87■□□□□ 0.93
UBE2Q1-207ENST00000497453 SLC5A4Q9NY91 659 aa20.87■□□□□ 0.93
UBE2Q1-207ENST00000497453 ICAM1P05362 532 aa20.86■□□□□ 0.93
UBE2Q1-207ENST00000497453 ALAS1P13196 640 aa20.86■□□□□ 0.93
UBE2Q1-207ENST00000497453 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
UBE2Q1-207ENST00000497453 EN2P19622 333 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
UBE2Q1-207ENST00000497453 HSPA4P34932 840 aa20.86■□□□□ 0.93
UBE2Q1-207ENST00000497453 TKFCQ3LXA3 575 aa20.86■□□□□ 0.93
UBE2Q1-207ENST00000497453 KCNB2Q92953 911 aa20.86■□□□□ 0.93
UBE2Q1-207ENST00000497453 TMEM87BQ96K49 555 aa20.86■□□□□ 0.93
UBE2Q1-207ENST00000497453 NEK1Q96PY6 1258 aa20.86■□□□□ 0.93
UBE2Q1-207ENST00000497453 RNF146Q9NTX7 359 aa20.86■□□□□ 0.93
UBE2Q1-207ENST00000497453 CCPG1Q9ULG6 757 aa20.86■□□□□ 0.93
UBE2Q1-207ENST00000497453 RPTORQ8N122 1335 aa20.85■□□□□ 0.93
UBE2Q1-207ENST00000497453 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
UBE2Q1-207ENST00000497453 IGHA2P01877 340 aa20.85■□□□□ 0.93
UBE2Q1-207ENST00000497453 GJB1P08034 283 aa20.85■□□□□ 0.93
UBE2Q1-207ENST00000497453 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
UBE2Q1-207ENST00000497453 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
UBE2Q1-207ENST00000497453 KRT32Q14532 448 aa20.85■□□□□ 0.93
UBE2Q1-207ENST00000497453 ZNF792Q3KQV3 632 aa20.85■□□□□ 0.93
UBE2Q1-207ENST00000497453 ADCK5Q3MIX3 580 aa20.85■□□□□ 0.93
UBE2Q1-207ENST00000497453 MFSD14CQ5VZR4 134 aa20.85■□□□□ 0.93
UBE2Q1-207ENST00000497453 OLFML2BQ68BL8 750 aa20.85■□□□□ 0.93
UBE2Q1-207ENST00000497453 STAG2Q8N3U4 1231 aa20.85■□□□□ 0.93
UBE2Q1-207ENST00000497453 MAML3Q96JK9 1138 aa20.85■□□□□ 0.93
UBE2Q1-207ENST00000497453 TRERF1Q96PN7 1200 aa20.85■□□□□ 0.93
UBE2Q1-207ENST00000497453 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP20.85■□□□□ 0.93
UBE2Q1-207ENST00000497453 ACAD9Q9H845 621 aa20.85■□□□□ 0.93
UBE2Q1-207ENST00000497453 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
UBE2Q1-207ENST00000497453 MAD2L2Q9UI95 211 aa20.85■□□□□ 0.93
UBE2Q1-207ENST00000497453 GRM4Q14833 912 aa20.84■□□□□ 0.93
UBE2Q1-207ENST00000497453 CATIPQ7Z7H3 387 aa20.84■□□□□ 0.93
UBE2Q1-207ENST00000497453 ADGRF4Q8IZF3 695 aa20.84■□□□□ 0.93
UBE2Q1-207ENST00000497453 DDX11Q96FC9 970 aa20.84■□□□□ 0.93
UBE2Q1-207ENST00000497453 LRRC2Q9BYS8 371 aa20.84■□□□□ 0.93
UBE2Q1-207ENST00000497453 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
UBE2Q1-207ENST00000497453 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
UBE2Q1-207ENST00000497453 KLRF2D3W0D1 207 aa20.83■□□□□ 0.93
UBE2Q1-207ENST00000497453 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
UBE2Q1-207ENST00000497453 CYP2C19P33261 490 aa20.83■□□□□ 0.93
UBE2Q1-207ENST00000497453 GJA8P48165 433 aa20.83■□□□□ 0.93
UBE2Q1-207ENST00000497453 TROAPQ12815 778 aa20.83■□□□□ 0.93
UBE2Q1-207ENST00000497453 MUM1L1Q5H9M0 696 aa20.83■□□□□ 0.93
UBE2Q1-207ENST00000497453 ANKRD35Q8N283 1001 aa20.83■□□□□ 0.93
UBE2Q1-207ENST00000497453 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
UBE2Q1-207ENST00000497453 SNX14Q9Y5W7 946 aa20.83■□□□□ 0.93
UBE2Q1-207ENST00000497453 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
UBE2Q1-207ENST00000497453 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa20.82■□□□□ 0.92
UBE2Q1-207ENST00000497453 LIFRP42702 1097 aa20.82■□□□□ 0.92
UBE2Q1-207ENST00000497453 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
UBE2Q1-207ENST00000497453 NFXL1Q6ZNB6 911 aa20.82■□□□□ 0.92
UBE2Q1-207ENST00000497453 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
UBE2Q1-207ENST00000497453 ZNF654Q8IZM8 581 aa20.82■□□□□ 0.92
UBE2Q1-207ENST00000497453 TMTC2Q8N394 836 aa20.82■□□□□ 0.92
UBE2Q1-207ENST00000497453 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
UBE2Q1-207ENST00000497453 SHISA4Q96DD7 197 aa20.82■□□□□ 0.92
UBE2Q1-207ENST00000497453 DEFB118Q96PH6 123 aa20.82■□□□□ 0.92
UBE2Q1-207ENST00000497453 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
UBE2Q1-207ENST00000497453 WDR19Q8NEZ3 1342 aa20.81■□□□□ 0.92
UBE2Q1-207ENST00000497453 CCDC69A6NI79 296 aa20.81■□□□□ 0.92
UBE2Q1-207ENST00000497453 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
UBE2Q1-207ENST00000497453 DDAH1O94760 285 aa20.81■□□□□ 0.92
UBE2Q1-207ENST00000497453 SGPL1O95470 568 aa20.81■□□□□ 0.92
UBE2Q1-207ENST00000497453 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
UBE2Q1-207ENST00000497453 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
UBE2Q1-207ENST00000497453 NUP133Q8WUM0 1156 aa20.81■□□□□ 0.92
UBE2Q1-207ENST00000497453 TCEANC2Q96MN5 208 aa20.81■□□□□ 0.92
UBE2Q1-207ENST00000497453 USP26Q9BXU7 913 aa20.81■□□□□ 0.92
UBE2Q1-207ENST00000497453 JMJD4Q9H9V9 463 aa20.81■□□□□ 0.92
UBE2Q1-207ENST00000497453 VAT1LQ9HCJ6 419 aa20.81■□□□□ 0.92
UBE2Q1-207ENST00000497453 PNMA2Q9UL42 364 aa20.81■□□□□ 0.92
UBE2Q1-207ENST00000497453 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
UBE2Q1-207ENST00000497453 TRPV1Q8NER1 839 aa20.8■□□□□ 0.92
UBE2Q1-207ENST00000497453 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
UBE2Q1-207ENST00000497453 MYL10Q9BUA6 226 aa20.8■□□□□ 0.92
UBE2Q1-207ENST00000497453 CYBAP13498 195 aa20.79■□□□□ 0.92
UBE2Q1-207ENST00000497453 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
UBE2Q1-207ENST00000497453 SLC35G1Q2M3R5 365 aa20.79■□□□□ 0.92
UBE2Q1-207ENST00000497453 QRICH1Q2TAL8 776 aa20.79■□□□□ 0.92
UBE2Q1-207ENST00000497453 NSMFQ6X4W1 530 aa20.79■□□□□ 0.92
UBE2Q1-207ENST00000497453 MAP3K14Q99558 947 aa20.79■□□□□ 0.92
UBE2Q1-207ENST00000497453 TINF2Q9BSI4 451 aa20.79■□□□□ 0.92
UBE2Q1-207ENST00000497453 BRCA2P51587 3418 aa20.79■□□□□ 0.92
UBE2Q1-207ENST00000497453 PFASO15067 1338 aa20.78■□□□□ 0.92
UBE2Q1-207ENST00000497453 POTEB2H3BUK9 544 aa20.78■□□□□ 0.92
UBE2Q1-207ENST00000497453 NFIBO00712 420 aa20.78■□□□□ 0.92
UBE2Q1-207ENST00000497453 TFRCP02786 760 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
UBE2Q1-207ENST00000497453 CPA1P15085 419 aa20.78■□□□□ 0.92
UBE2Q1-207ENST00000497453 CNTN2Q02246 1040 aa20.78■□□□□ 0.92
UBE2Q1-207ENST00000497453 USH1GQ495M9 461 aa20.78■□□□□ 0.92
UBE2Q1-207ENST00000497453 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa20.78■□□□□ 0.92
UBE2Q1-207ENST00000497453 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms