RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476784.5

TTC3-215, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, humanhuman

TSL 2

Gene TTC3, Length 7,425 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC3-215ENST00000476784 RGL1Q9NZL6 768 aa7.34□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 CCDC141Q6ZP82 1450 aa7.33□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 ESPNB1AK53 854 aa7.33□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 MAFGO15525 162 aa7.33□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 PYGLP06737 847 aa7.33□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 ST8SIA6P61647 398 aa7.33□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP7.33□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 SLFN13Q68D06 897 aa7.33□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 ARMC6Q6NXE6 501 aa7.33□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 RAB20Q9NX57 234 aa7.33□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 ZNF233A6NK53 670 aa7.33□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 H7C0C1 242 aa7.33□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 ATP5OP48047 213 aa7.33□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 ADALQ6DHV7 355 aa7.33□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 TTC23LQ6PF05 361 aa7.33□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 KIF21BO75037 1637 aa7.33□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 PPFIA4O75335 1185 aa7.33□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP7.33□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 TRIM14Q14142 442 aa7.33□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 WRNIP1Q96S55 665 aa7.33□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP7.33□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 FAM47DPA6NHR8 397 aa7.33□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 KIF3CO14782 793 aa7.33□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP7.33□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 F13A1P00488 732 aa7.33□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 GOLGA8HP0CJ92 632 aa7.33□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 BPIFB4P59827 614 aa7.33□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 RINT1Q6NUQ1 792 aa7.33□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 SPATA5Q8NB90 893 aa7.33□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 KRT12Q99456 494 aa7.33□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 AFF2P51816 1311 aa7.33□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 ALDH1A1P00352 501 aa7.33□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 ACTN1P12814 892 aa7.33□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 ALDH1L2Q3SY69 923 aa7.33□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 FOXR1Q6PIV2 292 aa7.33□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 CPLX4Q7Z7G2 160 aa7.33□□□□□ -1.24
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TTC3-215ENST00000476784 ASIC4Q96FT7 647 aa7.33□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 ABHD8Q96I13 439 aa7.33□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa7.33□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 FANCIQ9NVI1 1328 aa7.33□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 ARHGEF11O15085 1522 aa7.33□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 NOS1P29475 1434 aa7.33□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 TXNDC9O14530 226 aa7.33□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 CELF2O95319 508 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 GSDMDP57764 484 aa7.33□□□□□ -1.24
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TTC3-215ENST00000476784 MYL10Q9BUA6 226 aa7.33□□□□□ -1.24
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TTC3-215ENST00000476784 ZHX2Q9Y6X8 837 aa7.33□□□□□ -1.24
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TTC3-215ENST00000476784 TMEM247A6NEH6 219 aa7.32□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 SMCO2A6NFE2 343 aa7.32□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 SIX5Q8N196 739 aa7.32□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 EXT2Q93063 718 aa7.32□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 IGFLR1Q9H665 355 aa7.32□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 NEUROD4Q9HD90 331 aa7.32□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa7.32□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 CTAGE15A4D2H0 777 aa7.32□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 IVLP07476 585 aa7.32□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 CTAGE8P0CG41 777 aa7.32□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 KRT15P19012 456 aa7.32□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 TSPY1Q01534 308 aa7.32□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 HHATQ5VTY9 493 aa7.32□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 GBP6Q6ZN66 633 aa7.32□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 KCTD1Q719H9 257 aa7.32□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 CTAGE6Q86UF2 777 aa7.32□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 CTAGE4Q8IX94 777 aa7.32□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 ZNF341Q9BYN7 854 aa7.32□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 SERTAD1Q9UHV2 236 aa7.32□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 PPFIA2O75334 1257 aa7.32□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 CAPZA2P47755 286 aa7.32□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
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TTC3-215ENST00000476784 VPS16Q9H269 839 aa7.32□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 PRRG1O14668 218 aa7.32□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 HUNKP57058 714 aa7.32□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa7.32□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 DNAAF3Q8N9W5 541 aa7.32□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 SCUBE2Q9NQ36 999 aa7.32□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa7.32□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 CTAGE9A4FU28 777 aa7.32□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 RNF8O76064 485 aa7.32□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
TTC3-215ENST00000476784 MYO1EQ12965 1108 aa7.32□□□□□ -1.24
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