RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462357.1

IMP4-209, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 5

Gene IMP4, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-209ENST00000462357 TTBK2Q6IQ55 1244 aa23.99■■□□□ 1.43
IMP4-209ENST00000462357 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
IMP4-209ENST00000462357 MAP3K14Q99558 947 aa23.99■■□□□ 1.43
IMP4-209ENST00000462357 RPTORQ8N122 1335 aa23.99■■□□□ 1.43
IMP4-209ENST00000462357 MYCP01106 439 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
IMP4-209ENST00000462357 GOLGA8HP0CJ92 632 aa23.98■■□□□ 1.43
IMP4-209ENST00000462357 ALAS1P13196 640 aa23.98■■□□□ 1.43
IMP4-209ENST00000462357 GNAQP50148 359 aa23.98■■□□□ 1.43
IMP4-209ENST00000462357 OLFML2BQ68BL8 750 aa23.98■■□□□ 1.43
IMP4-209ENST00000462357 TRERF1Q96PN7 1200 aa23.98■■□□□ 1.43
IMP4-209ENST00000462357 SLC12A7Q9Y666 1083 aa23.98■■□□□ 1.43
IMP4-209ENST00000462357 MGAMO43451 1857 aa23.98■■□□□ 1.43
IMP4-209ENST00000462357 KLRF2D3W0D1 207 aa23.97■■□□□ 1.43
IMP4-209ENST00000462357 PFASO15067 1338 aa23.97■■□□□ 1.43
IMP4-209ENST00000462357 DDAH1O94760 285 aa23.97■■□□□ 1.43
IMP4-209ENST00000462357 GJB1P08034 283 aa23.97■■□□□ 1.43
IMP4-209ENST00000462357 SOX10P56693 466 aa23.97■■□□□ 1.43
IMP4-209ENST00000462357 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
IMP4-209ENST00000462357 LZTS2Q9BRK4 669 aa23.97■■□□□ 1.43
IMP4-209ENST00000462357 MAF1Q9H063 256 aa23.97■■□□□ 1.43
IMP4-209ENST00000462357 HOMER2Q9NSB8 354 aa23.97■■□□□ 1.43
IMP4-209ENST00000462357 RNF146Q9NTX7 359 aa23.97■■□□□ 1.43
IMP4-209ENST00000462357 TAF6LQ9Y6J9 622 aa23.97■■□□□ 1.43
IMP4-209ENST00000462357 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP23.96■■□□□ 1.43
IMP4-209ENST00000462357 NUP133Q8WUM0 1156 aa23.96■■□□□ 1.43
IMP4-209ENST00000462357 TRIB2Q92519 343 aa23.96■■□□□ 1.43
IMP4-209ENST00000462357 AGBL1Q96MI9 1066 aa23.96■■□□□ 1.43
IMP4-209ENST00000462357 UBA5Q9GZZ9 404 aa23.96■■□□□ 1.43
IMP4-209ENST00000462357 RIPK3Q9Y572 518 aa23.96■■□□□ 1.43
IMP4-209ENST00000462357 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
IMP4-209ENST00000462357 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa23.95■■□□□ 1.42
IMP4-209ENST00000462357 ADGRF4Q8IZF3 695 aa23.95■■□□□ 1.42
IMP4-209ENST00000462357 KCNB2Q92953 911 aa23.95■■□□□ 1.42
IMP4-209ENST00000462357 LY9Q9HBG7 655 aa23.95■■□□□ 1.42
IMP4-209ENST00000462357 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
IMP4-209ENST00000462357 MSCO60682 206 aa23.94■■□□□ 1.42
IMP4-209ENST00000462357 RGS19P49795 217 aa23.94■■□□□ 1.42
IMP4-209ENST00000462357 ANTXR2P58335 489 aa23.94■■□□□ 1.42
IMP4-209ENST00000462357 GRM4Q14833 912 aa23.94■■□□□ 1.42
IMP4-209ENST00000462357 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
IMP4-209ENST00000462357 VAT1LQ9HCJ6 419 aa23.94■■□□□ 1.42
IMP4-209ENST00000462357 NRBP1Q9UHY1 535 aa23.94■■□□□ 1.42
IMP4-209ENST00000462357 RLFQ13129 1914 aa23.94■■□□□ 1.42
IMP4-209ENST00000462357 ZNF536O15090 1300 aa23.93■■□□□ 1.42
IMP4-209ENST00000462357 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
IMP4-209ENST00000462357 POTEB2H3BUK9 544 aa23.93■■□□□ 1.42
IMP4-209ENST00000462357 COBLO75128 1261 aa23.93■■□□□ 1.42
IMP4-209ENST00000462357 TFRCP02786 760 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
IMP4-209ENST00000462357 TROAPQ12815 778 aa23.93■■□□□ 1.42
IMP4-209ENST00000462357 MTFR1Q15390 333 aa23.93■■□□□ 1.42
IMP4-209ENST00000462357 RASGRP2Q7LDG7 609 aa23.93■■□□□ 1.42
IMP4-209ENST00000462357 MCF2L2Q86YR7 1114 aa23.93■■□□□ 1.42
IMP4-209ENST00000462357 RASEFQ8IZ41 740 aa23.93■■□□□ 1.42
IMP4-209ENST00000462357 ZNF654Q8IZM8 581 aa23.93■■□□□ 1.42
IMP4-209ENST00000462357 NPLOC4Q8TAT6 608 aa23.93■■□□□ 1.42
IMP4-209ENST00000462357 MAML3Q96JK9 1138 aa23.93■■□□□ 1.42
IMP4-209ENST00000462357 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
IMP4-209ENST00000462357 USP26Q9BXU7 913 aa23.93■■□□□ 1.42
IMP4-209ENST00000462357 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP23.93■■□□□ 1.422e-12■■■□□ 15.1
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IMP4-209ENST00000462357 B4DLN1 442 aa23.92■■□□□ 1.42
IMP4-209ENST00000462357 SMARCA1P28370 1054 aa23.92■■□□□ 1.42
IMP4-209ENST00000462357 GJA8P48165 433 aa23.92■■□□□ 1.42
IMP4-209ENST00000462357 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
IMP4-209ENST00000462357 SNAP25P60880 206 aa23.92■■□□□ 1.42
IMP4-209ENST00000462357 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
IMP4-209ENST00000462357 CCL14Q16627 93 aa23.92■■□□□ 1.42
IMP4-209ENST00000462357 ZNF792Q3KQV3 632 aa23.92■■□□□ 1.42
IMP4-209ENST00000462357 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
IMP4-209ENST00000462357 MAD2L2Q9UI95 211 aa23.92■■□□□ 1.42
IMP4-209ENST00000462357 CNPY2Q9Y2B0 182 aa23.92■■□□□ 1.42
IMP4-209ENST00000462357 A0A0G2JMZ2 1700 aa23.92■■□□□ 1.42
IMP4-209ENST00000462357 ABCB11O95342 1321 aa23.91■■□□□ 1.42
IMP4-209ENST00000462357 SGPL1O95470 568 aa23.91■■□□□ 1.42
IMP4-209ENST00000462357 PGK2P07205 417 aa23.91■■□□□ 1.42
IMP4-209ENST00000462357 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
IMP4-209ENST00000462357 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
IMP4-209ENST00000462357 PPP2R5BQ15173 497 aa23.91■■□□□ 1.42
IMP4-209ENST00000462357 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa23.91■■□□□ 1.42
IMP4-209ENST00000462357 SGMS1Q86VZ5 419 aa23.91■■□□□ 1.42
IMP4-209ENST00000462357 FBXO11Q86XK2 927 aa23.91■■□□□ 1.42
IMP4-209ENST00000462357 TINF2Q9BSI4 451 aa23.91■■□□□ 1.42
IMP4-209ENST00000462357 AMNQ9BXJ7 453 aa23.91■■□□□ 1.42
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IMP4-209ENST00000462357 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
IMP4-209ENST00000462357 SNX14Q9Y5W7 946 aa23.91■■□□□ 1.42
IMP4-209ENST00000462357 DOCK3Q8IZD9 2030 aa23.9■■□□□ 1.42
IMP4-209ENST00000462357 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa23.9■■□□□ 1.42
IMP4-209ENST00000462357 CNGA1P29973 690 aa23.9■■□□□ 1.42
IMP4-209ENST00000462357 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
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IMP4-209ENST00000462357 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
IMP4-209ENST00000462357 DEFB118Q96PH6 123 aa23.9■■□□□ 1.42
IMP4-209ENST00000462357 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
IMP4-209ENST00000462357 ASB14A6NK59 587 aa23.89■■□□□ 1.41
IMP4-209ENST00000462357 ZBTB5O15062 677 aa23.89■■□□□ 1.41
IMP4-209ENST00000462357 STAG2Q8N3U4 1231 aa23.89■■□□□ 1.41
IMP4-209ENST00000462357 RGS22Q8NE09 1264 aa23.89■■□□□ 1.41
IMP4-209ENST00000462357 JMJD4Q9H9V9 463 aa23.89■■□□□ 1.41
IMP4-209ENST00000462357 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
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