RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411858.1

CCZ1B-202, Transcript of CCZ1 homolog B, vacuolar protein trafficking and biogenesis associated, humanhuman

TSL 5

Gene CCZ1B, Length 571 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCZ1B-202ENST00000411858 TNKSO95271 1327 aa29.1■■■□□ 2.25
CCZ1B-202ENST00000411858 TRDNQ13061 729 aa29.09■■■□□ 2.25
CCZ1B-202ENST00000411858 SEC23AQ15436 765 aa29.09■■■□□ 2.25
CCZ1B-202ENST00000411858 PNMA1Q8ND90 353 aa29.09■■■□□ 2.25
CCZ1B-202ENST00000411858 DPF3Q92784 378 aa29.09■■■□□ 2.25
CCZ1B-202ENST00000411858 MAML3Q96JK9 1138 aa29.09■■■□□ 2.25
CCZ1B-202ENST00000411858 PPP4R2Q9NY27 417 aa29.09■■■□□ 2.25
CCZ1B-202ENST00000411858 SLC5A4Q9NY91 659 aa29.09■■■□□ 2.25
CCZ1B-202ENST00000411858 SYDE2Q5VT97 1194 aa29.08■■■□□ 2.25
CCZ1B-202ENST00000411858 ERICH6BQ5W0A0 696 aa29.08■■■□□ 2.25
CCZ1B-202ENST00000411858 CCDC174Q6PII3 467 aa29.08■■■□□ 2.25
CCZ1B-202ENST00000411858 TRPV1Q8NER1 839 aa29.08■■■□□ 2.25
CCZ1B-202ENST00000411858 UBAC1Q9BSL1 405 aa29.08■■■□□ 2.25
CCZ1B-202ENST00000411858 KAT14Q9H8E8 782 aa29.08■■■□□ 2.25
CCZ1B-202ENST00000411858 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP29.07■■■□□ 2.24
CCZ1B-202ENST00000411858 CHST13Q8NET6 341 aa29.07■■■□□ 2.24
CCZ1B-202ENST00000411858 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
CCZ1B-202ENST00000411858 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
CCZ1B-202ENST00000411858 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
CCZ1B-202ENST00000411858 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa29.06■■■□□ 2.24
CCZ1B-202ENST00000411858 GOLGA8HP0CJ92 632 aa29.06■■■□□ 2.24
CCZ1B-202ENST00000411858 NECTIN1Q15223 517 aa29.06■■■□□ 2.24
CCZ1B-202ENST00000411858 LHX8Q68G74 356 aa29.06■■■□□ 2.24
CCZ1B-202ENST00000411858 NCOA7Q8NI08 942 aa29.06■■■□□ 2.24
CCZ1B-202ENST00000411858 ANO2Q9NQ90 1003 aa29.06■■■□□ 2.24
CCZ1B-202ENST00000411858 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
CCZ1B-202ENST00000411858 CDC45O75419 566 aa29.05■■■□□ 2.24
CCZ1B-202ENST00000411858 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
CCZ1B-202ENST00000411858 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa29.05■■■□□ 2.24
CCZ1B-202ENST00000411858 DDX11Q96FC9 970 aa29.05■■■□□ 2.24
CCZ1B-202ENST00000411858 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
CCZ1B-202ENST00000411858 HOMER2Q9NSB8 354 aa29.05■■■□□ 2.24
CCZ1B-202ENST00000411858 FBXO40Q9UH90 709 aa29.05■■■□□ 2.24
CCZ1B-202ENST00000411858 SLC27A2O14975 620 aa29.04■■■□□ 2.24
CCZ1B-202ENST00000411858 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
CCZ1B-202ENST00000411858 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
CCZ1B-202ENST00000411858 CHST3Q7LGC8 479 aa29.04■■■□□ 2.24
CCZ1B-202ENST00000411858 ANKLE1Q8NAG6 615 aa29.04■■■□□ 2.24
CCZ1B-202ENST00000411858 UBA5Q9GZZ9 404 aa29.04■■■□□ 2.24
CCZ1B-202ENST00000411858 CPVLQ9H3G5 476 aa29.04■■■□□ 2.24
CCZ1B-202ENST00000411858 OGDHLQ9ULD0 1010 aa29.04■■■□□ 2.24
CCZ1B-202ENST00000411858 ALAS1P13196 640 aa29.03■■■□□ 2.24
CCZ1B-202ENST00000411858 CYBAP13498 195 aa29.03■■■□□ 2.24
CCZ1B-202ENST00000411858 TKFCQ3LXA3 575 aa29.03■■■□□ 2.24
CCZ1B-202ENST00000411858 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
CCZ1B-202ENST00000411858 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
CCZ1B-202ENST00000411858 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
CCZ1B-202ENST00000411858 TRERF1Q96PN7 1200 aa29.03■■■□□ 2.24
CCZ1B-202ENST00000411858 SENP2Q9HC62 589 aa29.03■■■□□ 2.24
CCZ1B-202ENST00000411858 RNF146Q9NTX7 359 aa29.03■■■□□ 2.24
CCZ1B-202ENST00000411858 ICAM1P05362 532 aa29.02■■■□□ 2.24
CCZ1B-202ENST00000411858 ANTXR2P58335 489 aa29.02■■■□□ 2.24
CCZ1B-202ENST00000411858 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
CCZ1B-202ENST00000411858 MUM1L1Q5H9M0 696 aa29.02■■■□□ 2.24
CCZ1B-202ENST00000411858 CREB3L3Q68CJ9 461 aa29.02■■■□□ 2.24
CCZ1B-202ENST00000411858 ANKRD35Q8N283 1001 aa29.02■■■□□ 2.24
CCZ1B-202ENST00000411858 TINF2Q9BSI4 451 aa29.02■■■□□ 2.24
CCZ1B-202ENST00000411858 ACAD9Q9H845 621 aa29.02■■■□□ 2.24
CCZ1B-202ENST00000411858 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
CCZ1B-202ENST00000411858 CNGA1P29973 690 aa29.01■■■□□ 2.23
CCZ1B-202ENST00000411858 NECAB2Q7Z6G3 386 aa29.01■■■□□ 2.23
CCZ1B-202ENST00000411858 CCPG1Q9ULG6 757 aa29.01■■■□□ 2.23
CCZ1B-202ENST00000411858 CASC1Q6TDU7 716 aa29■■■□□ 2.23
CCZ1B-202ENST00000411858 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa29■■■□□ 2.23
CCZ1B-202ENST00000411858 FGD4Q96M96 766 aa29■■■□□ 2.23
CCZ1B-202ENST00000411858 SMCHD1A6NHR9 2005 aa28.99■■■□□ 2.23
CCZ1B-202ENST00000411858 CHRDL2Q6WN34 429 aa28.99■■■□□ 2.23
CCZ1B-202ENST00000411858 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
CCZ1B-202ENST00000411858 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
CCZ1B-202ENST00000411858 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
CCZ1B-202ENST00000411858 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
CCZ1B-202ENST00000411858 ASPRV1Q53RT3 343 aa28.98■■■□□ 2.23
CCZ1B-202ENST00000411858 STAG2Q8N3U4 1231 aa28.98■■■□□ 2.23
CCZ1B-202ENST00000411858 NR2E3Q9Y5X4 410 aa28.98■■■□□ 2.23
CCZ1B-202ENST00000411858 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa28.97■■■□□ 2.23
CCZ1B-202ENST00000411858 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP28.97■■■□□ 2.23
CCZ1B-202ENST00000411858 CNTN2Q02246 1040 aa28.97■■■□□ 2.23
CCZ1B-202ENST00000411858 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa28.97■■■□□ 2.23
CCZ1B-202ENST00000411858 ADGRF4Q8IZF3 695 aa28.97■■■□□ 2.23
CCZ1B-202ENST00000411858 PRO3102Q9H379 93 aa28.97■■■□□ 2.23
CCZ1B-202ENST00000411858 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
CCZ1B-202ENST00000411858 ERICH2A1L162 156 aa28.96■■■□□ 2.23
CCZ1B-202ENST00000411858 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
CCZ1B-202ENST00000411858 WTAPQ15007 396 aa28.96■■■□□ 2.23
CCZ1B-202ENST00000411858 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
CCZ1B-202ENST00000411858 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
CCZ1B-202ENST00000411858 FAM133AQ8N9E0 248 aa28.96■■■□□ 2.23
CCZ1B-202ENST00000411858 SOWAHBA6NEL2 793 aa28.95■■■□□ 2.22
CCZ1B-202ENST00000411858 SEPT4O43236 478 aa28.95■■■□□ 2.22
CCZ1B-202ENST00000411858 EVI5O60447 810 aa28.95■■■□□ 2.22
CCZ1B-202ENST00000411858 TMEM67Q5HYA8 995 aa28.95■■■□□ 2.22
CCZ1B-202ENST00000411858 CLEC4DQ8WXI8 215 aa28.95■■■□□ 2.22
CCZ1B-202ENST00000411858 MAD2L2Q9UI95 211 aa28.95■■■□□ 2.22
CCZ1B-202ENST00000411858 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
CCZ1B-202ENST00000411858 POTEB2H3BUK9 544 aa28.94■■■□□ 2.22
CCZ1B-202ENST00000411858 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
CCZ1B-202ENST00000411858 ANO1Q5XXA6 986 aa28.94■■■□□ 2.22
CCZ1B-202ENST00000411858 C11orf49Q9H6J7 331 aa28.94■■■□□ 2.22
CCZ1B-202ENST00000411858 JMJD4Q9H9V9 463 aa28.94■■■□□ 2.22
CCZ1B-202ENST00000411858 VAT1LQ9HCJ6 419 aa28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms