RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404287.2

MESTP1-201, Transcript of mesoderm specific transcript pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene MESTP1, Length 994 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESTP1-201ENST00000404287 MMP19Q99542 508 aa22.56■■□□□ 1.2
MESTP1-201ENST00000404287 MAD2L2Q9UI95 211 aa22.56■■□□□ 1.2
MESTP1-201ENST00000404287 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa22.55■■□□□ 1.2
MESTP1-201ENST00000404287 PGK2P07205 417 aa22.55■■□□□ 1.2
MESTP1-201ENST00000404287 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
MESTP1-201ENST00000404287 MCM5P33992 734 aa22.55■■□□□ 1.2
MESTP1-201ENST00000404287 UBXN2AP68543 259 aa22.55■■□□□ 1.2
MESTP1-201ENST00000404287 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
MESTP1-201ENST00000404287 ZNF792Q3KQV3 632 aa22.55■■□□□ 1.2
MESTP1-201ENST00000404287 ASPRV1Q53RT3 343 aa22.55■■□□□ 1.2
MESTP1-201ENST00000404287 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
MESTP1-201ENST00000404287 SNX14Q9Y5W7 946 aa22.55■■□□□ 1.2
MESTP1-201ENST00000404287 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
MESTP1-201ENST00000404287 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
MESTP1-201ENST00000404287 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
MESTP1-201ENST00000404287 ICAM1P05362 532 aa22.54■■□□□ 1.2
MESTP1-201ENST00000404287 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
MESTP1-201ENST00000404287 MUM1L1Q5H9M0 696 aa22.54■■□□□ 1.2
MESTP1-201ENST00000404287 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
MESTP1-201ENST00000404287 CHST13Q8NET6 341 aa22.54■■□□□ 1.2
MESTP1-201ENST00000404287 SHISA4Q96DD7 197 aa22.54■■□□□ 1.2
MESTP1-201ENST00000404287 FGD4Q96M96 766 aa22.54■■□□□ 1.2
MESTP1-201ENST00000404287 NEK1Q96PY6 1258 aa22.54■■□□□ 1.2
MESTP1-201ENST00000404287 USP26Q9BXU7 913 aa22.54■■□□□ 1.2
MESTP1-201ENST00000404287 LRRC2Q9BYS8 371 aa22.54■■□□□ 1.2
MESTP1-201ENST00000404287 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
MESTP1-201ENST00000404287 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
MESTP1-201ENST00000404287 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
MESTP1-201ENST00000404287 REC8O95072 547 aa22.53■■□□□ 1.2
MESTP1-201ENST00000404287 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
MESTP1-201ENST00000404287 EN2P19622 333 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
MESTP1-201ENST00000404287 SLC4A3P48751 1232 aa22.53■■□□□ 1.2
MESTP1-201ENST00000404287 GRM4Q14833 912 aa22.53■■□□□ 1.2
MESTP1-201ENST00000404287 SART3Q15020 963 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
MESTP1-201ENST00000404287 DPP9Q86TI2 863 aa22.53■■□□□ 1.2
MESTP1-201ENST00000404287 ADGRF4Q8IZF3 695 aa22.53■■□□□ 1.2
MESTP1-201ENST00000404287 MAML3Q96JK9 1138 aa22.53■■□□□ 1.2
MESTP1-201ENST00000404287 TMEM87BQ96K49 555 aa22.53■■□□□ 1.2
MESTP1-201ENST00000404287 ERICH2A1L162 156 aa22.52■■□□□ 1.2
MESTP1-201ENST00000404287 GJB1P08034 283 aa22.52■■□□□ 1.2
MESTP1-201ENST00000404287 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
MESTP1-201ENST00000404287 KCTD2Q14681 263 aa22.52■■□□□ 1.2
MESTP1-201ENST00000404287 OLFML2BQ68BL8 750 aa22.52■■□□□ 1.2
MESTP1-201ENST00000404287 RNF208Q9H0X6 261 aa22.52■■□□□ 1.2
MESTP1-201ENST00000404287 JMJD4Q9H9V9 463 aa22.52■■□□□ 1.2
MESTP1-201ENST00000404287 HOMER2Q9NSB8 354 aa22.52■■□□□ 1.2
MESTP1-201ENST00000404287 RNF146Q9NTX7 359 aa22.52■■□□□ 1.2
MESTP1-201ENST00000404287 SMCHD1A6NHR9 2005 aa22.52■■□□□ 1.19
MESTP1-201ENST00000404287 ALAS1P13196 640 aa22.51■■□□□ 1.19
MESTP1-201ENST00000404287 CYP2C19P33261 490 aa22.51■■□□□ 1.19
MESTP1-201ENST00000404287 LIFRP42702 1097 aa22.51■■□□□ 1.19
MESTP1-201ENST00000404287 TKFCQ3LXA3 575 aa22.51■■□□□ 1.19
MESTP1-201ENST00000404287 ZNF654Q8IZM8 581 aa22.51■■□□□ 1.19
MESTP1-201ENST00000404287 TRPV1Q8NER1 839 aa22.51■■□□□ 1.19
MESTP1-201ENST00000404287 MTMR8Q96EF0 704 aa22.51■■□□□ 1.19
MESTP1-201ENST00000404287 TCEANC2Q96MN5 208 aa22.51■■□□□ 1.19
MESTP1-201ENST00000404287 TRERF1Q96PN7 1200 aa22.51■■□□□ 1.19
MESTP1-201ENST00000404287 MYL10Q9BUA6 226 aa22.51■■□□□ 1.19
MESTP1-201ENST00000404287 TMEM106CQ9BVX2 250 aa22.51■■□□□ 1.19
MESTP1-201ENST00000404287 ACAD9Q9H845 621 aa22.51■■□□□ 1.19
MESTP1-201ENST00000404287 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
MESTP1-201ENST00000404287 FBXO40Q9UH90 709 aa22.51■■□□□ 1.19
MESTP1-201ENST00000404287 CCPG1Q9ULG6 757 aa22.51■■□□□ 1.19
MESTP1-201ENST00000404287 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
MESTP1-201ENST00000404287 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
MESTP1-201ENST00000404287 RPTORQ8N122 1335 aa22.51■■□□□ 1.19
MESTP1-201ENST00000404287 WDR19Q8NEZ3 1342 aa22.51■■□□□ 1.19
MESTP1-201ENST00000404287 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
MESTP1-201ENST00000404287 CPA1P15085 419 aa22.5■■□□□ 1.19
MESTP1-201ENST00000404287 GJA8P48165 433 aa22.5■■□□□ 1.19
MESTP1-201ENST00000404287 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
MESTP1-201ENST00000404287 CLEC4DQ8WXI8 215 aa22.5■■□□□ 1.19
MESTP1-201ENST00000404287 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP22.5■■□□□ 1.19
MESTP1-201ENST00000404287 KLRF2D3W0D1 207 aa22.49■■□□□ 1.19
MESTP1-201ENST00000404287 CYTH3O43739 400 aa22.49■■□□□ 1.19
MESTP1-201ENST00000404287 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
MESTP1-201ENST00000404287 KRT32Q14532 448 aa22.49■■□□□ 1.19
MESTP1-201ENST00000404287 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
MESTP1-201ENST00000404287 SGMS1Q86VZ5 419 aa22.49■■□□□ 1.19
MESTP1-201ENST00000404287 ASTN1O14525 1302 aa22.49■■□□□ 1.19
MESTP1-201ENST00000404287 NFIBO00712 420 aa22.48■■□□□ 1.19
MESTP1-201ENST00000404287 DDAH1O94760 285 aa22.48■■□□□ 1.19
MESTP1-201ENST00000404287 CYBAP13498 195 aa22.48■■□□□ 1.19
MESTP1-201ENST00000404287 QRICH1Q2TAL8 776 aa22.48■■□□□ 1.19
MESTP1-201ENST00000404287 CATIPQ7Z7H3 387 aa22.48■■□□□ 1.19
MESTP1-201ENST00000404287 FAM133AQ8N9E0 248 aa22.48■■□□□ 1.19
MESTP1-201ENST00000404287 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
MESTP1-201ENST00000404287 DEFB118Q96PH6 123 aa22.48■■□□□ 1.19
MESTP1-201ENST00000404287 MAP3K14Q99558 947 aa22.48■■□□□ 1.19
MESTP1-201ENST00000404287 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa22.48■■□□□ 1.19
MESTP1-201ENST00000404287 RIOX1Q9H6W3 641 aa22.48■■□□□ 1.19
MESTP1-201ENST00000404287 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
MESTP1-201ENST00000404287 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
MESTP1-201ENST00000404287 SGPL1O95470 568 aa22.47■■□□□ 1.19
MESTP1-201ENST00000404287 CNTN2Q02246 1040 aa22.47■■□□□ 1.19
MESTP1-201ENST00000404287 MFSD14CQ5VZR4 134 aa22.47■■□□□ 1.19
MESTP1-201ENST00000404287 ANKRD35Q8N283 1001 aa22.47■■□□□ 1.19
MESTP1-201ENST00000404287 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
MESTP1-201ENST00000404287 SLC5A4Q9NY91 659 aa22.47■■□□□ 1.19
MESTP1-201ENST00000404287 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.6 ms